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利用單分子分辨技術(shù)研究基于成像的人類單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)

摘要

熒光原位雜交(FISH)技術(shù)被廣泛應(yīng)用于單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄拷貝數(shù)統(tǒng)計和亞細(xì)胞定位。然而目前的技術(shù)手段并不能很容易的分析全轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)。本文中我們將分支DNA技術(shù)和自動化流體處理技術(shù),高通量成像技術(shù)以及定量成像分析技術(shù)結(jié)合在一起,使我們能以單分子成像對數(shù)千單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)進(jìn)行高度可重復(fù)性的定量。除此之外,我們還可對量化后的亞細(xì)胞形態(tài),轉(zhuǎn)錄本空間特性和不同細(xì)胞間可變性得到全景掌握。這為基因表達(dá)水平上細(xì)胞間的可變性提供了多個解釋,同時也能使我們在避免干擾轉(zhuǎn)錄組原有特征的情況下對其進(jìn)行功能相關(guān)性鑒定。因為這種方法可以和一系列高效成像技術(shù)相結(jié)合,我們認(rèn)為它有廣泛的應(yīng)用前景。

Nat Methods. 2013 Nov;10(11):1127-33. doi: 10.1038/nmeth.2657. Epub 2013 Oct 6.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Image-based+transcriptomics+in+thousands+of+single+human+cells+at+single-molecule+resolution.

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