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網(wǎng)絡(luò)式大數(shù)據(jù)構(gòu)建“藥物Google搜索工具”揭示藥物與疾病之間聯(lián)系
講座摘要:
美國國立衛(wèi)生研究院NIH資助建立網(wǎng)絡(luò)集成式細(xì)胞內(nèi)特征的公共數(shù)據(jù)(LINCS)項(xiàng)目,旨在開發(fā)細(xì)胞水平上藥物特性的生物學(xué)標(biāo)簽,通過監(jiān)視細(xì)胞內(nèi)表型的變化動態(tài)反映藥物作用機(jī)制,使我們能迅速了解個體細(xì)胞的藥物功能基因組學(xué)和藥物代謝組學(xué)的特征。LINCS項(xiàng)目開發(fā)Connectivity Map(Cmap)數(shù)據(jù)庫,收集了使用化合物處理和相關(guān)基因干擾劑處理的人類細(xì)胞基因表達(dá)的信息像是一本藥物基因表達(dá)的目錄,利用高通量、低成本的檢測方案搜索Cmap數(shù)據(jù)庫將基因、疾病及藥物作一個連結(jié),進(jìn)而揭秘中草藥、天然活性成分及小分子化合物的作用機(jī)制,發(fā)展新藥開發(fā)或老藥新用達(dá)到個體化醫(yī)療的目的。 另外,LINCS項(xiàng)目在線網(wǎng)絡(luò)分析平臺也為全球的科研人員提供個體化代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)庫,旨在開發(fā)單細(xì)胞水平的藥物特性的代謝圖譜,利用高內(nèi)涵檢測技術(shù)可得到固定細(xì)胞中蛋白的免疫檢測,活細(xì)胞凋亡圖像分析,蛋白激酶生化分析以及細(xì)胞活力相關(guān)的生理參數(shù),為研究者和臨床診斷醫(yī)生探測單細(xì)胞個體分析和如何用藥提供了一個獨(dú)特的工具。 應(yīng)用美國NIH LINCS大數(shù)據(jù)項(xiàng)目可獲得新藥開發(fā)整合式解決方案,加速常規(guī)的藥物研發(fā)周期、降低研發(fā)成本、多參數(shù)系統(tǒng)性揭示藥物治療疾病的新機(jī)制。

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