采用Arraystar lncRNA芯片發(fā)現(xiàn)病毒型肝癌的新靶點
瀏覽次數(shù):3921 發(fā)布日期:2011-8-3
來源:上?党缮
第二軍醫(yī)大學(xué)孫樹漢教授課題組長期致力于肝癌研究,許多實驗成果已經(jīng)發(fā)表在國際頂級期刊上。此次研究利用Arraystar lncRNA芯片(長鏈非編碼RNA芯片)對肝癌及癌旁組織進行系統(tǒng)性篩查,發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH在乙型肝炎病毒(HBV)導(dǎo)致的肝癌(HCC)發(fā)生中起重要作用,研究成果發(fā)表在Hepatology。
此次研究中l(wèi)ncRNA芯片實驗在康成生物公司完成。
Yang, F., et al., Long non-coding RNA high expressed in hepatocellular carcinoma (lncRNA-HEIH) facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2. Hepatology, 2011. (影響因子:10.885)
文章首先通過Arraystar公司的LncRNA芯片對HBV導(dǎo)致的肝癌組織(n=5)及癌旁組織(n=5)中的長鏈非編碼RNA進行了系統(tǒng)的檢測與比較,并且通過50對標本的進一步qPCR驗證,找到了一組癌與癌旁中差異表達的lncRNA。實驗者特別關(guān)注一個在癌組織中特異性高表達的新LncRNA(lncRNA-HEIH:lncRNA High Expression in HCC)。
實驗者進一步研究lncRNA-HEIH與肝癌之間的功能聯(lián)系。通過與病人生存時間等臨床數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)分析,發(fā)現(xiàn)lncRNA-HEIH的表達水平可以作為病人生存時間的預(yù)測標志,并且和癌癥的復(fù)發(fā)有很強的相關(guān)性。對lncRNA-HEIH的功能研究發(fā)現(xiàn)它在細胞周期調(diào)控中起重要作用,它可能通過與EZH2結(jié)合來募集PRC2,進而抑制下游靶基因的表達從而發(fā)揮其調(diào)控功能。這些結(jié)果表明lncRNA-HEIH有望成為病毒型肝癌的一個新的早期診斷標志或治療靶點。
圖示:肝癌(n=5)和癌旁組織(n=5)的芯片聚類結(jié)果。Arraystar公司的lncRNA芯片同時設(shè)計了mRNA與lncRNA,圖A為差異表達的254個mRNA聚類結(jié)果,圖B為差異表達的174個lncRNA聚類結(jié)果。紅色代表上調(diào),綠色代表下調(diào)。