江蘇CDC利用MiSeq測序技術(shù)對H7N9研究獲重要進展

 

       記者近日獲悉，江蘇省疾病預(yù)防控制中心在H7N9流感病毒檢測和研究上取得兩項重大進展，研究成果分別發(fā)表在世界頂尖醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)期刊《新英格蘭醫(yī)學(xué)》《The New England Journal of Medicine》和《柳葉刀》（Lancet）上。

       自江蘇省報道第一例H7N9流感病毒感染者以來，大部分H7N9感染者都有禽類接觸史或去過畜禽交易市場，為此，南京市采取了暫�；钋萁灰椎募膊☆A(yù)防控制措施，對全市的活禽進行檢查，可感染源并沒有找到，不僅僅在江蘇，感染源在哪，在全國范圍內(nèi)目前均未有確定的說法。江蘇省疾病預(yù)防控制中心對第一例H7N9患者樣品及其工作的活禽屠宰場所臨近攤位的雞籠和二級活禽批發(fā)市場進行取樣，利用美國Illumina公司先進的全基因組測序儀MiSeq和熒光定量聚合酶鏈式反應(yīng)法對樣品進行分析，發(fā)現(xiàn)患者樣品和環(huán)境樣品的H7N9流感病毒通過部分氨基酸的變化更加適應(yīng)人類，進化樹分析表明這種新亞型H7N9流感病毒來源并不一致，在禽類中可能正在發(fā)生重組。溯源分析表明，新型H7N9流感病毒是從二級批發(fā)市場傳播到零售市場，進而傳染給人類，這也解釋了大部分H7N9感染患者有過禽類接觸史的流行病學(xué)調(diào)查資料，對于下一步的疾病預(yù)防控制工作非常重要。該研究成果發(fā)表在世界頂尖醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)期刊《新英格蘭醫(yī)學(xué)》上。

        在人類、禽類或其他動物中存在的多種病毒同時感染的現(xiàn)象也有可能是新型病毒的一個來源。江蘇省疾病預(yù)防控制中心對一例15歲H7N9患者的樣品進行新一代高通量并行測序分析后發(fā)現(xiàn)，有H7N9和H3N2兩種亞型的流感病毒同時感染了這名患者。雖然從2013年4月中旬后，H1N1亞型流感病毒已經(jīng)取代H3N2亞型流感病毒作為在江蘇省流行的病毒亞型，但這次H7N9和H3N2共同感染同一個病人還是首次報道。而且，雙病毒感染是新型病毒重組亞型的一個潛在來源，人體很有可能是病毒重組的又一個混合容器。該研究充分利用MiSeq新一代測序技術(shù)的高通量并行測序優(yōu)勢，通過幾步簡單的操作，在短時間內(nèi)檢測到兩種流感病毒亞型同時感染，成果發(fā)表在頂級醫(yī)學(xué)雜志《柳葉刀》上，對于揭示是否會存在人際傳播以及加強病毒進化的監(jiān)控非常重要。

        自發(fā)現(xiàn)首例H7N9患者以來，江蘇省衛(wèi)生廳、疾病預(yù)防控制中心和各大醫(yī)院采取果斷措施，很快控制住疫情的進一步擴散，患者大部分都得到有效治療，治愈率高。江蘇省疾病預(yù)防控制中心利用最新的高通量測序技術(shù)對病毒樣品進行快速分析，研究成果高質(zhì)量、快速度的發(fā)表在世界頂尖醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)雜志上，開創(chuàng)了江蘇省公共衛(wèi)生和基礎(chǔ)研究的先例。