“基因組科學(xué)”（22期/總42期）研習(xí)班通知

開班時間：2013年12月8日至12月15日
上課內(nèi)容：基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)

 

培訓(xùn)地點：杭州 浙江大學(xué)華家池校區(qū)
收費標(biāo)準(zhǔn)：注冊費為￥3000/人，安排食宿、費用自理。

上機(jī)實習(xí)內(nèi)容：
1.基因組數(shù)據(jù)注釋和分析； 2.核苷酸序列分析； 3.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析； 4.芯片數(shù)據(jù)的基本處理和分析； 5.蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析； 6.系統(tǒng)生物學(xué)軟件實習(xí)-網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯示與分析。

隨著眾多生物基因組測序項目的完成，生物學(xué)數(shù)據(jù)正在加速度增長。如何科學(xué)地分析和注釋這些高通量數(shù)據(jù)，已成為生物學(xué)工作者急需學(xué)習(xí)和解決的問題。 我們將為您提供學(xué)術(shù)殿堂，請您參加我們舉辦的“基因組科學(xué)”研習(xí)班。這里您將可以聽到于軍教授（注：于軍被《科學(xué)美國人》評為2002年度世界科學(xué)領(lǐng)袖）親自主講的基因組學(xué)基礎(chǔ)知識和前沿進(jìn)展。楊軍、陳銘教授分別主講系統(tǒng)生物學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法和思路。

我們也將為您邀請經(jīng)驗豐富的胡松年等教授給您細(xì)說基因轉(zhuǎn)錄組的測定及分析、基因芯片、新一代測序等實驗技術(shù)的關(guān)鍵事項。如果您正在從事研究工作并想進(jìn)一步提升科學(xué)研究水平，不妨來這里傾聽浙江大學(xué)鄭樹教授、楊軍教授、薛慶中教授分別述說在醫(yī)學(xué)和農(nóng)學(xué)應(yīng)用中的經(jīng)驗和體會。

如果您想學(xué)習(xí)從互聯(lián)網(wǎng)公共數(shù)據(jù)庫獲取數(shù)據(jù)、處理數(shù)據(jù)的方法，從中挖掘有價值的信息資源，您更應(yīng)該來參加我們舉辦的“基因組科學(xué)”研習(xí)班。我們將為您提供優(yōu)質(zhì)服務(wù)，每人一臺PC機(jī)，讓您緊隨大屏幕演示“跟我學(xué)”操作。上機(jī)實習(xí)課6次，帶您進(jìn)入基因組科學(xué)大門，輔導(dǎo)您運用網(wǎng)上的軟件和工具，繪制進(jìn)化樹，探討物種起源；從錯綜復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)中，梳理分子間的相互作用。6天短暫的學(xué)習(xí)肯定會讓您學(xué)有所獲。我們還給您提供科學(xué)出版社發(fā)行的最新教材，便于自學(xué)、溫故知新、復(fù)習(xí)鞏固。

凡來參加過學(xué)習(xí)的學(xué)員都夸我們的研習(xí)班工作認(rèn)真負(fù)責(zé)，給學(xué)員們提供了極好的“充電”機(jī)會。至今我們已舉辦40期，每期150人左右，學(xué)員遍布全國30余個省市。每次研習(xí)班都有近20名教授、研究員參加，更多是碩士生、博士生等年輕學(xué)者。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯(lián)系；也有的通過研習(xí)班建立了協(xié)作關(guān)系，共同申請課題，發(fā)表論文，其中不少優(yōu)秀的研究成果，已在SCI期刊上發(fā)表。

不學(xué)不會，早學(xué)早會。有志或有興趣學(xué)習(xí)基因組、蛋白質(zhì)組、系統(tǒng)生物學(xué)的科研工作者、高校教師及研究生，熱烈歡迎您前來杭州參加“基因組科學(xué)”研習(xí)班。

 

上課內(nèi)容涵蓋“基因組學(xué)－>蛋白質(zhì)組學(xué)－>系統(tǒng)生物學(xué)”的研究方法、技術(shù)思路、前沿進(jìn)展及其在各生物學(xué)科中的應(yīng)用。主要內(nèi)容如下：
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術(shù)原理與進(jìn)展（講課人：于 軍 教授）
2. 基因轉(zhuǎn)錄組的測定及分析、大規(guī)模測序方法及應(yīng)用、微生物基因組學(xué)（講課人：胡松年教授）
3. 蛋白質(zhì)組學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)應(yīng)用及數(shù)據(jù)分析（講課人：楊軍、陳銘教授等）
4. 基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、系統(tǒng)生物學(xué)在醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)中的應(yīng)用 （講課人：鄭樹、薛慶中、鐘伯雄教授）

 

上機(jī)實習(xí)課采用 “跟我學(xué)”方式，學(xué)習(xí)生物信息學(xué)軟件使用，每人一臺PC機(jī)跟著大屏幕一步步學(xué)會基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的基本方法。主要內(nèi)容如下：

實習(xí)一： 基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析
    通過序列比對工具BLAST的學(xué)習(xí)，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進(jìn)化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認(rèn)識基因復(fù)制在進(jìn)化上的功能。

實習(xí)二： 核苷酸序列分析
    學(xué)習(xí)基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件，包括：基因預(yù)測，編碼區(qū)結(jié)構(gòu)分析，選擇性剪切分析，基因啟動子預(yù)測，基因調(diào)控元件預(yù)測，密碼子偏好性分析等內(nèi)容。

實習(xí)三： 芯片的基本數(shù)據(jù)處理和分析
    使用TM4軟件來實現(xiàn)芯片的數(shù)據(jù)采集，低質(zhì)量過濾，標(biāo)準(zhǔn)化處理及聚類等可視化分析；使用GenMAPP軟件挖掘芯片數(shù)據(jù)在代謝途徑中的生物學(xué)意義；介紹NCBI GEO數(shù)據(jù)庫，學(xué)習(xí)檢索和提交芯片數(shù)據(jù)。

實習(xí)四：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析
    從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開始，接著對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進(jìn)行分析，預(yù)測目標(biāo)蛋白的生物功能。

實習(xí)五： 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析
    使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習(xí)。

實習(xí)六：系統(tǒng)生物學(xué)軟件實習(xí)-----網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯示與分析
    利用Cytoscape系統(tǒng)生物學(xué)分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，并與基因表達(dá)等數(shù)據(jù)整合。

 

    從事生命科學(xué)、農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域科研工作者和高校教師及研究生。

 

    若對本期研習(xí)內(nèi)容有興趣，請將以下報名表回執(zhí)（點擊下載）發(fā)送E-mail到gjsu2012@163.com。我們會立即回信，并登記在冊，待排定課表后發(fā)給您詳細(xì)教學(xué)日程表（每節(jié)課時間、講課主題、講課人等）。待您確認(rèn)后，發(fā)給您報到通知并排定上機(jī)號。

 

 

    “DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具”（第三版）， 薛慶中等編著，科學(xué)出版社出版 2012年6月發(fā)行

 

聯(lián) 系 人： 周老師

傳    真： 13611816758

郵    箱:  

               浙江大學(xué)浙江加州國際納米技術(shù)研究院
             中國科學(xué)院北京基因組研究所
            2013年10月10日