Porvair:多向性表觀遺傳靶點(diǎn)篩選的高通量ChIP測(cè)定

Porvair Sciences 發(fā)表了一份應(yīng)用案例說(shuō)明，闡述了 ChromaTrap 的新型 96 孔染色質(zhì)免疫沉淀反應(yīng) (ChIP) 測(cè)定技術(shù)。

現(xiàn)代表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域科技發(fā)展迅速，所有指導(dǎo)原則都是通過(guò)活體內(nèi)蛋白質(zhì)與 DNA 的動(dòng)態(tài)綁定來(lái)調(diào)節(jié)基因，研究人員闡述道。其關(guān)鍵在于需要分析大量的高含量和低含量調(diào)節(jié)機(jī)制，來(lái)系統(tǒng)性地描繪出接觸病原體后蛋白質(zhì)與 DNA 的交互反應(yīng)。

染色質(zhì)免疫沉淀反應(yīng) (ChIP) 測(cè)定通常用于研究這兩者之間的關(guān)聯(lián)，一直以來(lái)均局限于大量的樣品研究，費(fèi)力的清洗步驟導(dǎo)致大量樣品丟失，噪聲比較低，而且再現(xiàn)性差。

新型應(yīng)用案例說(shuō)明中詳細(xì)闡述了 Chromatrap®96 Pro-A（一種 96 孔微孔板）的使用，所有孔都含有固相的固態(tài)多孔聚合物 BioVyonTM（其中通過(guò)化學(xué)反應(yīng)綁定蛋白質(zhì) A），因此 96 ChIP 測(cè)定法可在同一個(gè)孔板上同時(shí)運(yùn)行。

為確定在篩選表觀遺傳靶點(diǎn)時(shí) Chromatrap®96 是否易于使用、是否具有高度的設(shè)計(jì)靈活性以及高度的再現(xiàn)性，我們必須在 96 孔板上對(duì)三個(gè)人體染色質(zhì)樣品（HepG2、HeLa 和 K562）的三個(gè)基因靶點(diǎn)（GAPDH、beta-globin 和 PABPC1）同時(shí)開(kāi)展常規(guī)表觀遺傳標(biāo)記（H3、H4、H3K4me3 和 RNA pol II）的綁定效率和占用率研究，并使用 qPCR 進(jìn)行分析。應(yīng)用案例說(shuō)明中詳述了分析法、數(shù)據(jù)解讀以及統(tǒng)計(jì)分析法，以及使用新型 Chromatrap®96 高通量 ChIP 測(cè)定板的好處。該測(cè)定板具備多向性靶點(diǎn)篩選功能、靈活的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、可靠的再現(xiàn)性、高數(shù)據(jù)指令以及全自動(dòng)移液功能。

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