安捷倫公司與根特大學(xué)合作在芯片中整合入了 LNCipedia 內(nèi)容
2015 年 6月 10 日,北京 — 安捷倫科技公司(紐約證交所:A)近日宣布更新其新型 SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片用于人、小鼠和大鼠模型的信使 RNA 分析應(yīng)用。此次更新改進(jìn)了編碼和非編碼內(nèi)容,為研究人員提供在常用平臺(tái)上研究表達(dá)模式的最新工具。
安捷倫公司與根特大學(xué)合作開發(fā)了最新款旗艦版 SurePrint G3 人基因表達(dá) v3 微陣列芯片,其中完整包含的LNCipedia 2.1 數(shù)據(jù)庫能夠?qū)﹂L(zhǎng)鏈非編碼 RNA (lncRNA) 轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行可靠分析。
LncRNA(長(zhǎng)度大于 200 個(gè)核苷酸的非編碼 RNA)能夠通過直接作用于 DNA、RNA 和蛋白質(zhì)而改變基因調(diào)控,從而實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)特異性或系統(tǒng)范圍內(nèi)的調(diào)控。 通過 lncRNA 與癌癥、心血管疾病和神經(jīng)退行性疾病的關(guān)聯(lián)不難看出其廣范卻至關(guān)重要的作用。
經(jīng)重新設(shè)計(jì)的安捷倫基因表達(dá)微陣列芯片是高質(zhì)量的特征捕獲工具,可實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因或通路的有效分析,涉及從協(xié)助疾病危險(xiǎn)分層到闡明藥物作用機(jī)制的各種應(yīng)用。
根特大學(xué)的 Jo Vandesompele 教授說:“我們與安捷倫密切合作設(shè)計(jì)了一流的 mRNA 和 lncRNA 表達(dá)分析方法。 在單次分析中對(duì)這兩種類型的 RNA 進(jìn)行的同時(shí)測(cè)定有助于從相對(duì)基因表達(dá)水平深入探究 mRNA 與 lncRNA 之間的生物學(xué)聯(lián)系。 其中的關(guān)鍵在于實(shí)現(xiàn)編碼和長(zhǎng)鏈非編碼特征的良好平衡,而 LNCipedia 2.1 則是與安捷倫基因表達(dá)內(nèi)容配對(duì)的最佳數(shù)據(jù)源。 微陣列芯片的最終設(shè)計(jì)經(jīng)優(yōu)化后可快速給出大量有價(jià)值的信息!
最新的微陣列芯片采用能夠?qū)崿F(xiàn)寡核苷酸精確合成的 SurePrint 技術(shù)制造。 SurePrint 微陣列芯片的靈敏度處于業(yè)內(nèi)領(lǐng)先水平,具有 5 個(gè)數(shù)量級(jí)以上的動(dòng)態(tài)范圍以及 5% 的陣列間變異系數(shù)中值,且在 R2>0.95 時(shí)與外部 RNA 對(duì)照聯(lián)盟 (External RNA Controls Consortium) 的加標(biāo) RNA 對(duì)照品相比具有出色的定量一致性。
“我們的 SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片不僅包含 LNCipedia 的 lncRNA 等嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶I(yè)內(nèi)容,還能夠?yàn)閷<壹?jí)用戶提供靈活的定制服務(wù)!卑步輦惢蚪M學(xué)高級(jí)總監(jiān) Alessandro Borsatti 博士談道, “憑借基因表達(dá)微陣列芯片的出色性能和定量一致性以及 RNA 測(cè)序和靶向序列捕獲產(chǎn)品,我們能夠使研究人員在微陣列芯片的篩查應(yīng)用與更深度的二代測(cè)序的發(fā)現(xiàn)性應(yīng)用之間實(shí)現(xiàn)完美轉(zhuǎn)換!
SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片屬于 SurePrint 產(chǎn)品系列,該系列包括 microRNA 與比較基因組雜交微陣列芯片。 安捷倫基因組學(xué)工作流程包括用于質(zhì)量控制的 2100 生物分析儀和 2200 Tapestation、用于數(shù)據(jù)采集的 SureScan 掃描儀、用于數(shù)據(jù)分析的 GeneSpring 軟件,以及用于進(jìn)行實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)的 AriaMX 系統(tǒng)。
如需了解有關(guān) SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片的更多信息,請(qǐng)?jiān)L問 www.agilent.com/genomics/v3 。
關(guān)于安捷倫科技公司
安捷倫科技公司(紐約證交所:A)是生命科學(xué)、診斷和應(yīng)用化學(xué)市場(chǎng)領(lǐng)域的全球領(lǐng)導(dǎo)者,是致力打造美好世界的頂級(jí)實(shí)驗(yàn)室合作伙伴。安捷倫與全球 100 多個(gè)國(guó)家的客戶進(jìn)行合作,提供儀器、軟件、服務(wù)和消耗品,產(chǎn)品可覆蓋到整個(gè)實(shí)驗(yàn)室工作流程。在 2014 財(cái)年,安捷倫的凈收入為 40 億美元。全球員工數(shù)約為 12000 人。今年是安捷倫進(jìn)軍分析儀器領(lǐng)域的 50 周年紀(jì)念。如需了解安捷倫科技公司的詳細(xì)信息,請(qǐng)?jiān)L問 www.agilent.com.cn 。