國(guó)家基因庫(kù)正式發(fā)布自主研發(fā)的樣本庫(kù)信息管理平臺(tái)
國(guó)家基因庫(kù)發(fā)布國(guó)內(nèi)先進(jìn)的樣本庫(kù)信息管理平臺(tái)，助力精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展
一、國(guó)內(nèi)樣本庫(kù)行業(yè)和精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展呼吁先進(jìn)的信息化管理平臺(tái)
生物樣本資源庫(kù)作為一種為研究利用人體生物樣本提供資源的貯藏室，已成為支持基因組學(xué)和個(gè)體化藥物研究等的關(guān)鍵資源。但是臨床及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中新治療方法的研發(fā)僅僅依靠?jī)?chǔ)存大量的生物樣本是不夠的，還需要獲取樣本相應(yīng)的臨床、病理、影像、治療、隨訪、知情同意、生活方式等信息，所以樣本庫(kù)行業(yè)急需建立一個(gè)健全的樣本庫(kù)信息管理系統(tǒng)追蹤樣本的生命周期進(jìn)行全程有效追蹤，獲取從樣本采集到處理、生理和臨床信息注釋、科研應(yīng)用、最終到樣本銷(xiāo)毀的信息數(shù)據(jù)。
生物技術(shù)和計(jì)算機(jī)技術(shù)的快速發(fā)展為大規(guī)模收集如血液、尿液等人體生物樣本、存儲(chǔ)樣本的相關(guān)醫(yī)療信息、大量的樣本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析、生物樣本信息資源庫(kù)的信息化應(yīng)用管理及不同地域間的生物樣本信息資源庫(kù)的資源交流提供了良好的平臺(tái)。針對(duì)建立、統(tǒng)一、資源網(wǎng)絡(luò)是國(guó)際樣本庫(kù)發(fā)展趨勢(shì)中的三個(gè)里程碑，然而完成“統(tǒng)一”的任務(wù)是發(fā)展樣本資源網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)。我國(guó)生物樣本信息建設(shè)起步較晚，使得國(guó)內(nèi)的生物樣本信息資源難以實(shí)現(xiàn)資源共享、資源得不到充分有效的利用。目前國(guó)內(nèi)大部分樣本庫(kù)信息以臨床診斷作為樣本的主要信息，如特定類(lèi)別腫瘤樣本庫(kù)的主要信息局限于病患的臨床診斷結(jié)果，而個(gè)體健康信息（如飲食習(xí)慣、生活方式、家系信息等相關(guān)信息）卻可能缺失，這是國(guó)內(nèi)信息化管理方面存在的問(wèn)題之一，也是中國(guó)生物樣本庫(kù)信息化建設(shè)現(xiàn)狀的縮影。
2009年9月，美國(guó)國(guó)家癌癥研究中心（National Cancer Institute, NCI）籌劃建立了美國(guó)第一個(gè)國(guó)家級(jí)人類(lèi)癌癥生物樣本信息資源庫(kù)（The Cancer Human Biobank，caHUB），該樣本庫(kù)是世界上技術(shù)最先進(jìn)、管理最完善的大規(guī)模生物樣本庫(kù)之一，其為生物樣本庫(kù)的管理制定的一套先進(jìn)完善的樣本庫(kù)管理規(guī)范《NCI Best Practices for Biospecimen Resources》中也提到，生物樣本庫(kù)信息管理系統(tǒng)是高標(biāo)準(zhǔn)樣本庫(kù)的重要組成部分。
統(tǒng)一的生物樣本庫(kù)信息管理平臺(tái)應(yīng)以數(shù)字化、規(guī)范化、網(wǎng)絡(luò)化為目標(biāo)，完整包含和整合樣本質(zhì)控信息、樣本存儲(chǔ)信息、生物信息及整合了醫(yī)療機(jī)構(gòu)已建立的信息系統(tǒng)（HIS）、電子病歷系統(tǒng)（EMR）等臨床信息，減少生物樣本庫(kù)多源信息化資源重疊，簡(jiǎn)便查詢(xún)和檢索、優(yōu)化流程，為臨床和科研提供可靠方便的決策信息。建立起統(tǒng)一的、健全的生物樣本庫(kù)信息化系統(tǒng)也是今后國(guó)內(nèi)生物樣本庫(kù)海量數(shù)據(jù)整合的發(fā)展趨勢(shì)和必要途徑。
2015年9月4日，美國(guó)國(guó)家健康中心（NIH）宣布將投入總計(jì)4800萬(wàn)美元的資金專(zhuān)門(mén)用于收集整合基因組信息并將其錄入至電子健康記錄系統(tǒng)。NIH 的這一計(jì)劃主要是為了完善電子健康病例系統(tǒng)以及醫(yī)療保險(xiǎn)體系并服務(wù)于精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃。
對(duì)于我國(guó)醫(yī)療領(lǐng)域來(lái)說(shuō)，13億人可以形成海量的信息數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)，將成為推動(dòng)國(guó)內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)的重要基礎(chǔ)，而建立標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)一的樣本信息管理平臺(tái)，則是數(shù)據(jù)信息規(guī)范收集、有效使用、擴(kuò)大共享的重要基礎(chǔ)。
二、國(guó)家基因庫(kù)研發(fā)并發(fā)布國(guó)內(nèi)先進(jìn)的信息化管理平臺(tái)
由國(guó)家發(fā)改委、衛(wèi)計(jì)委、財(cái)政部和工信部聯(lián)合批復(fù)成立的國(guó)家基因庫(kù)作為國(guó)內(nèi)唯一的國(guó)家級(jí)基因庫(kù)，自成立之初就確定了要站在國(guó)家戰(zhàn)略高度為中國(guó)生命科學(xué)研究和生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供大支撐平臺(tái)的使命和建設(shè)目標(biāo)。如何提升國(guó)內(nèi)樣本庫(kù)信息化管理水平自然也成為國(guó)家基因庫(kù)關(guān)注的重要項(xiàng)目，經(jīng)過(guò)專(zhuān)業(yè)團(tuán)隊(duì)的長(zhǎng)時(shí)期專(zhuān)項(xiàng)研究，結(jié)合與國(guó)內(nèi)知名醫(yī)療機(jī)構(gòu)合作的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，研發(fā)出了一套標(biāo)準(zhǔn)統(tǒng)一的樣本信息管理平臺(tái)，該套平臺(tái)既具有綜合性，整合關(guān)聯(lián)了樣本質(zhì)控和存儲(chǔ)、臨床及生物三方面的信息，形成綜合性的貫穿數(shù)據(jù)，又具有相對(duì)獨(dú)立性，各子系統(tǒng)之間可獨(dú)立應(yīng)用，以確保信息的安全與穩(wěn)定。整個(gè)平臺(tái)包含了樣本采集和處理質(zhì)量控制、樣本管理、臨床信息管理等一系列子系統(tǒng)：
“樣本采集&處理質(zhì)量控制系統(tǒng)”：是目前國(guó)內(nèi)第一個(gè)從樣本離體、轉(zhuǎn)運(yùn)、處理到存儲(chǔ)進(jìn)行全過(guò)程質(zhì)控的信息化管理系統(tǒng)，系統(tǒng)對(duì)樣本所有質(zhì)量關(guān)鍵點(diǎn)進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控，如時(shí)間、行為及環(huán)境的監(jiān)控。
“樣本管理系統(tǒng)”：與質(zhì)量控制系統(tǒng)無(wú)縫連接，具有可視化的儲(chǔ)存、條碼化的管理、標(biāo)準(zhǔn)化的流程以及自定義具有靈活設(shè)置系統(tǒng)信息管。
“臨床信息管理”：靈活的數(shù)據(jù)查詢(xún)，圖表化的直觀展示。
國(guó)家基因庫(kù)構(gòu)建樣本庫(kù)管理平臺(tái)的長(zhǎng)遠(yuǎn)目標(biāo)，是希望樣本和醫(yī)療數(shù)據(jù)信息提取安全、便利，使醫(yī)療和科研工作者進(jìn)行貫穿信息的標(biāo)準(zhǔn)化管理及綜合搜索、分析，真正實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的實(shí)用化，從而為醫(yī)療數(shù)據(jù)挖掘及醫(yī)學(xué)健康領(lǐng)域的科研發(fā)現(xiàn)提供可靠而全面的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)，推動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的發(fā)展。
2015年9月15日，國(guó)家基因庫(kù)在上海的第五屆中國(guó)生物樣本庫(kù)及精準(zhǔn)醫(yī)療國(guó)際討會(huì)上正式發(fā)布這套自主研發(fā)的樣本信息管理平臺(tái)，希望這套綜合性信息化管理平臺(tái)能夠?yàn)榇龠M(jìn)國(guó)內(nèi)生物樣本庫(kù)信息化管理進(jìn)程和為國(guó)內(nèi)外生物、醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的科研和產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供專(zhuān)業(yè)而標(biāo)準(zhǔn)的服務(wù)。目前綜合平臺(tái)中的“樣本管理系統(tǒng)”已開(kāi)放免費(fèi)試用，您可登陸國(guó)家基因庫(kù)資源共享平臺(tái)E-BioBank申請(qǐng)?jiān)囉? http://ebiobank.cngb.org/product_software.htm 或 聯(lián)系EBB平臺(tái)：cngb-ebb@genomics.cn
參考資料：
NCI Best Practices for Biospecimen Resources http://biospecimens.cancer.gov/practices/。
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