2016年8月2日
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主持人:楊 冬 朱偉民
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主題:蛋白質(zhì)組信息學(xué) 蛋白質(zhì)鑒定
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時間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00-10:00
講座
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朱偉民
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● 課程介紹
● 蛋白質(zhì)組學(xué)
● 蛋白質(zhì)組信息學(xué)工作流程
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10:00-10:45
講座
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朱偉民
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工作流原理
● 序列數(shù)據(jù)庫
● 肽段鑒定
● 蛋白組裝
● 蛋白定量
● 質(zhì)量控制和標準
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10:45-11:00
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茶歇
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11:00-11:45
講座
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楊 冬
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工作流原理
● 翻譯后修飾
● 數(shù)據(jù)挖掘
● 數(shù)據(jù)注釋
● 聚類和其他分析
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11:45-12:30
練習(xí)
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楊 冬
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常用的生物信息數(shù)據(jù)庫和工具
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12:30-13:30
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午餐
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13:30-14:30
講座
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楊 冬
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Mascot:實踐中的搜索工具
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14:30-15:15
練習(xí)
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楊 冬
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搜索工具的環(huán)境
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30-16:30
講座
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楊 冬
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搜索工具實際應(yīng)用
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16:30-17:15
講座
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Henning Hermjakob
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數(shù)據(jù)存儲與發(fā)布:ProteomeXchange
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17:15
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結(jié)束
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2016年8月3日
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主持人:朱云平
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主題:定量蛋白質(zhì)組
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時間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00-10:00
講座
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常 乘
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標記定量蛋白質(zhì)組學(xué):母離子標記方法
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10:00-10:45
講座
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常 乘
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標定定量蛋白質(zhì)組學(xué):子離子標記方法
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10:45-11:00
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茶歇
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11:00-11:45
練習(xí)
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常 乘
馬 潔
馮曉東
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MaxQuant上機練習(xí)
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11:45-12:30
練習(xí)
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常 乘
馬 潔
馮曉東
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MaxQuant上機練習(xí)
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午餐
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13:30-14:30
講座
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常 乘
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非標定量蛋白質(zhì)組學(xué)
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14:30-15:15
練習(xí)
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常 乘
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差異表達蛋白的統(tǒng)計分析
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30
講座
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常 乘
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PANDA和PANDA-view介紹
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16:30
練習(xí)
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常 乘
馬 潔
馮曉東
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PANDA和PANDA-view上機練習(xí)
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17:15
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結(jié)束
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2016年8月4日
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主持人:馮晉文
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主題:工作流 數(shù)據(jù)發(fā)布
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時間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00
講座
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馮晉文
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TPP(trans proteome pipeline)數(shù)據(jù)分析平臺介紹
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10:00
練習(xí)
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馮晉文
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● 基于X!Tandem肽段鑒定
● 基于peptide Prophet肽段驗證
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10:45-11:00
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茶歇
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11:00
練習(xí)
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馮晉文
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蛋白質(zhì)定量
● Libra
蛋白質(zhì)組裝
● Protein Prophet
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11:45
練習(xí)
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馮晉文
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實際操作
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12:30-13:30
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午餐
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13:30
講座
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馮晉文
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Firmiana簡介
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14:30
練習(xí)
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馮晉文
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Firmiana上機練習(xí)
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30
講座
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馬 潔
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基于Iprox的數(shù)據(jù)存儲
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16:30
練習(xí)
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馬 潔
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實際操作:基于Iprox的數(shù)據(jù)存儲
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17:15-18:00
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參觀Phoenix center
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2016年8月5日
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主持人:李棟
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主題:網(wǎng)絡(luò)和通路
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時間
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主講人
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培訓(xùn)內(nèi)容
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9:00
講座
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李 棟
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蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析
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10:00
講座
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李 棟
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蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)集深度挖掘
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10:45
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茶歇
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11:00
練習(xí)
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李 棟
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網(wǎng)絡(luò)工具介紹:
● KEGG, Reactome
● STRING
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11:45
練習(xí)
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李 棟
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上機練習(xí)
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12:30
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午餐
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13:30
講座
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劉中揚
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Cytoscape簡介
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14:30
練習(xí)
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劉中揚
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Cytoscape上機練習(xí)
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15:15-15:30
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茶歇
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15:30-16:30
練習(xí)
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劉中揚
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Cytoscape上機練習(xí)
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17:15
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結(jié)束
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