Diagenode核酸剪切儀BioruptorPico深度試用分析探討

今年5月，比利時 Diagenode 公司 Bioruptor Pico 核酸剪切儀試用活動再傳捷報，本次試用單位上海伯豪生物使用Bioruptor Pico 進行了多項實驗均獲得了品質(zhì)優(yōu)良的樣品，實驗效果理想。

試用日期：2017年5月

試用單位：上海伯豪生物

試用詳情：

Sample volume: 100 µl
Tubes: 0.65 ml Bioruptor® Microtubes (Cat. No. C30010013)
Tube holder:  0.65 ml tube holder & tube adaptor for Bioruptor® Pico (Cat. No. B01200010) for 12 x 0.65 ml tubes
DNA concentration:  0.1-10 ng/µl
Sonication buffer: TE (10 mM Tris, 1 mM EDTA), pH 7.5 - 8.0
Target size:150-1000bp
Sonication cycles: 按照廠家參考循環(huán)數(shù)

儀器已經(jīng)預冷，陳老師準備樣品

結(jié)果分析：

DNA concentration:  1ng/µl
Target size:150bp
Sonication cycles: 30 cycles (30 sec ON/OFF)
試用結(jié)果：樣品品質(zhì)良好，超聲效果理想。三個樣品由于實際濃度有差別，所以波峰有高低�？傮w上波峰稍稍拖后。Pico儀器是市面上唯一一款60KHz的超聲波破碎儀，片段極限在70bp。熟悉DNA打斷實驗的都知道，目的片段越小、濃度越高越難處理。之前在新培晶試用時，由于濃度太高（50 ng/µl），導致超聲時間過長，效果一般。鏈接：http://www.boyibio.cn/news/html/?89.html

DNA concentration:  紅1 ng/µl和藍20ng/ul兩個樣品
Target size:250bp
Sonication cycles: 8 cycles (30 sec ON/90 sec OFF)
試用結(jié)果：樣品品質(zhì)良好，超聲效果理想。廠家推薦濃度是（1-20ng/ul），在此范圍內(nèi)超聲效果基本上是不變的。

DNA concentration:  2ng/µl
Target size:300bp
Sonication cycles: 6 cycles (30 sec ON/OFF)
試用結(jié)果：樣品品質(zhì)良好，超聲效果理想。

DNA concentration:  紅2ng/µl（有誤），藍10ng/µl，綠2ng/µl，青0.2ng/µl
Target size:400bp
Sonication cycles: 6 cycles (15 sec ON/90sec OFF)
試用結(jié)果：樣品品質(zhì)良好，超聲效果理想。濃度方面應該有誤，不影響分析，總的來說，超聲重復性理想，青0.2ng/µl濃度太低沒有檢測到。

DNA concentration:  紅1ng/µl，藍9ng/µl
Target size:1000bp
Sonication cycles: 8 cycles (5sec ON/90sec OFF)
試用結(jié)果：樣品品質(zhì)良好，超聲效果理想。波峰明顯小于1kb，超聲循環(huán)數(shù)需要減少1-2個循環(huán)。