Precellys研磨器入選SelectScience二代測序八大新技術(shù)

瀏覽次數(shù)：6358　發(fā)布日期：2018-12-13　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

11月，SelectScience發(fā)表社論文章：發(fā)掘二代測序八大最新技術(shù)（Explore Eight of The Latest Advances in Next-Generation Sequencing Technology），這篇文章主要對用于二代測序、質(zhì)量控制和全基因組測序方法樣品制備的最新技術(shù)和指南進(jìn)行了歸納總結(jié)。

二代測序工作十分繁瑣，要獲得滿意的測序結(jié)果，在最初的樣品制備一步就需要嚴(yán)格把控，制備測序樣本時(shí)的主要目標(biāo)是盡量減少產(chǎn)生偏向。偏向是指因?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)而產(chǎn)生的數(shù)據(jù)系統(tǒng)失真。為了確保精確測序結(jié)果，關(guān)鍵是確保樣本制備工作流程是無偏且可靠的；然而實(shí)際上實(shí)驗(yàn)偏向是不可能消除的，只能通過采取一切可行的工具和技術(shù)來降低偏向?qū)ψ罱K分析的影響。

近年來的研究顯示，利用RNA測序分析基因表達(dá)譜可以發(fā)現(xiàn)大量的信息。為了實(shí)現(xiàn)RNA測序，首先必須獲得高質(zhì)量的總RNA，相對DNA而言，RNA不穩(wěn)定容易產(chǎn)生降解的特性，令RNA的提取和純化成為進(jìn)行有效RNA測序的關(guān)鍵步驟，這要求一款能高效研磨且在研磨過程中能充分保持RNA分子的完整性和生物活性的研磨儀器。同時(shí)研究表明，如果細(xì)胞不能均勻且完全破碎的話，在接下來的每一步包括RNA提取步驟都會(huì)產(chǎn)生實(shí)驗(yàn)偏向。

法國bertin Precellys生物樣品研磨器2000多篇科學(xué)實(shí)驗(yàn)指南充分證明能最大程度地保證提取RNA的無偏性和完整性，優(yōu)化測序提取工序。它的高度靈活性和高效率使用戶能夠在大約30秒的時(shí)間里就能完全研磨，均質(zhì)或裂解任何類型的動(dòng)物、人、植物或微生物的軟硬樣品，是理想的測序樣本前處理工具。

SelectScience在該篇社論中指出，科學(xué)家們非常關(guān)注二代測序的最新技術(shù)和應(yīng)用，并探索著從小鼠全腎和部分腎中制備高質(zhì)量的總RNA樣品用于基因表達(dá)分析，因?yàn)橹挥袕恼麄€(gè)器官中提取總RNA，才能可靠地估計(jì)器官中的基因表達(dá)水平（因?yàn)檩^小的部分組織部分可能不代表整個(gè)器官）。該報(bào)道特別介紹了法國Bertin Precellys生物樣本研磨器幫助科學(xué)家有效地從腎器官中提取總RNA，從而獲得高質(zhì)量和高完整性的RNA，為RNA測序和基因表達(dá)分析做好充分準(zhǔn)備。建立了RNA提取的理想方案，并證明Precellys從半個(gè)或整個(gè)小鼠腎臟中提取RNA非常有效，如下圖所示分析了兩種樣本研磨提取后RNA質(zhì)量和完整性，圖中結(jié)果顯示兩種樣本都獲得了非常高質(zhì)量 (RIN>8.8)的RNA。