Illumina與倫德貝克基金會攜手構(gòu)建人類基因組數(shù)據(jù)集

 

 

丹麥哥本哈根——2019年3月26日——Illumina將與丹麥哥本哈根大學(xué)的倫德貝克基金會地理遺傳學(xué)中心（Lundbeck Foundation Centre for GeoGenetics）開展合作，共同探究某些精神疾病和神經(jīng)疾病的疾病演進史與感染性病原體之間的關(guān)系。該項目屬全球首例，旨在發(fā)掘出全新的知識，從醫(yī)學(xué)和生物學(xué)視角理解古往今來驅(qū)使人類神經(jīng)精神疾病不斷演進的特殊因素。最后，本項目還有望為開發(fā)精神/神經(jīng)疾病治療藥物和其他治療手段提供一種新的方法。

 

腦部疾病從何而來？為揭示微生物在阿茨海默病和精神分裂癥等神經(jīng)精神疾病的發(fā)病機理中扮演什么樣的角色，Eske Willerslev教授及其國際研究團隊將繪制數(shù)千具古歐亞人殘骸的完整DNA圖譜，并據(jù)此構(gòu)建全球最大的基因組數(shù)據(jù)集之一。他們將從殘骸的骨和牙齒中采集數(shù)據(jù)，其中最古老的材料可追溯至10,000年以前。

 

這個多學(xué)科研究團隊匯集了古基因組學(xué)、神經(jīng)遺傳學(xué)、群體遺傳學(xué)、考古學(xué)、語言學(xué)、腦健康等眾多領(lǐng)域的專家，將致力于構(gòu)建兩個獨特的基因組數(shù)據(jù)子集。第一個panel覆蓋5,000個古人類基因組，第二個panel則包括與人類疾病相關(guān)的古病原體DNA。這兩個panel都將公開發(fā)布，共同助力我們深入研究疾病變異的演進，以及疾病變異與人類基因組和病原體之間的相互作用。該項目將構(gòu)建并分析有史以來最大的古人類和病原體基因組panel。

 

劍橋大學(xué)教授、菲利普親王勛章獲得者（Prince Philip Professor）、哥本哈根大學(xué)倫德貝克基金會（Lundbeck Foundation）教授Willerslev表示：“在過去10,000多年的歷史長河中，我們?nèi)祟惖纳�活方式�?jīng)歷了許多重大變化。從采獵時代進入農(nóng)耕時代后，我們的飲食、聚落模式都發(fā)生了變化，隨著居住環(huán)境改變，我們被環(huán)境病原體微生物感染的風(fēng)險也隨之發(fā)生變化。我們還知道，慢性病毒、細菌和真菌感染也可能誘發(fā)神經(jīng)精神疾病，因此我們完全有理由相信，通過分析當(dāng)時的DNA，可以揭示這些疾病演進的趨勢，讓我們可以構(gòu)建全新的公開參考數(shù)據(jù)集，進而增強科研領(lǐng)域和醫(yī)療保健領(lǐng)域?qū)�疾病演進的理解。”

 

為解碼人類疾病的基因起源和演進過程，Willerslev教授及其團隊將在他們的研究中應(yīng)用Illumina功能最為強大的測序儀——NovaSeq™6000系統(tǒng)。該系統(tǒng)經(jīng)專門設(shè)計，開辟了擴大實驗規(guī)模、提升實驗穩(wěn)定性的全新視野，其高通量優(yōu)勢能夠為大型隊列研究提供有力支持。這種規(guī)模的項目將受益于分析速度、通量和數(shù)據(jù)質(zhì)量，因此該項目將使用S4流動槽，將測序通量提升至每兩天測定多達200億個古人類DNA片段。

 

“NovaSeq 6000擁有無與倫比的數(shù)據(jù)質(zhì)量和高通量優(yōu)勢，是本項目的不二之選�！盬illerslev教授補充道，“盡管我們多年前就已經(jīng)構(gòu)想出這個探究遺傳性疾病基因起源的項目，但在Illumina的NovaSeq系統(tǒng)上市之前，那都只是不可能實現(xiàn)的構(gòu)想而已。我們很高興倫德貝克基金會高瞻遠矚地預(yù)見到了我們這個項目的重要性，也很高興Illumina技術(shù)讓這項研究得以實施。”

 

Illumina歐洲、中東和非洲地區(qū)高級副總裁兼總經(jīng)理Paula Dowdy表示：“Illumina非常期待與Willerslev教授及其團隊合作，共同開展這個意義非凡的研究項目。如果我們能通過追溯過去10,000年來的DNA發(fā)掘出一些新的信息，了解與腦部疾病相關(guān)的基因是何時，以及在怎樣的環(huán)境條件下被引入人類DNA的，這將成為無價的研究成果。這個項目可提供有關(guān)精神疾病患者的深刻見解，有望助力未來基因療法和精準(zhǔn)醫(yī)療產(chǎn)品的開發(fā)�！�

 

Illumina公司通過解碼基因組而改善人類健康。我們注重創(chuàng)新，這使我們成為DNA測序和芯片技術(shù)的全球領(lǐng)導(dǎo)者，并為科研、臨床和應(yīng)用市場的客戶提供服務(wù)。我們的產(chǎn)品應(yīng)用在生命科學(xué)、腫瘤學(xué)、生殖保健、農(nóng)業(yè)及其他新興市場上。如欲了解更多信息，請訪問www.illumina.com或關(guān)注@illumina。

 

專注腦、疾病和進化研究的德貝克基金會地理遺傳學(xué)中心（Lundbeck Foundation GeoGenetics Centre）是世界一流的卓越研究中心，主要研究遠古時期人類和病原體的DNA以及環(huán)境DNA。該中心最初作為丹麥國家研究基金會卓越研究中心成立于2009年，之后在倫德貝克基金會（Lundbeck Foundation）、嘉士伯基金會（Carlsberg Foundation）、諾和諾德基金會（Novo Nordisk Foundation）和惠康基金會（Wellcome Trust）的大力資助下持續(xù)運作至今。LF地理遺傳學(xué)中心位于丹麥哥本哈根大學(xué)內(nèi)，是一個橫跨多個學(xué)科的研究機構(gòu)，匯集了來自世界各地主攻不同學(xué)科的眾多科學(xué)家。在這里，我們致力于探索人類的遷徙、疾病的演進、為適應(yīng)環(huán)境而產(chǎn)生的生活方式改變，以及語言的發(fā)展歷程，旨在了解“我們是誰”、“我們從哪來”、“未來我們將前往何方”。我們的目標(biāo)是提升彼此對于作為人類的意義的認知，并通過理解疾病病因、尊重多樣性的方式減輕人類痛苦。