12月13~14日,第四屆國(guó)際精準(zhǔn)醫(yī)療產(chǎn)業(yè)論壇在深圳隆重召開(kāi)。Namocell有幸參與本次盛會(huì),并在多組學(xué)與醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化研究分論壇上作了精彩的單細(xì)胞專題報(bào)告。
在本次會(huì)議的報(bào)告中,Namocell向來(lái)賓分享了單細(xì)胞測(cè)序相關(guān)技術(shù)的發(fā)展,并介紹了Namocell單細(xì)胞分離儀在該領(lǐng)域中的最新應(yīng)用數(shù)據(jù)結(jié)果,并取得了熱烈的反響。
在單細(xì)胞RNA測(cè)序領(lǐng)域,目前有三種常用方法:其一是以10x Genomics為代表的微滴(droplet-based)測(cè)序;其二是以Namocell為代表的PCR板(plate-based)測(cè)序;其三是以BD Rhapsody為代表的微孔(micro-well-based)測(cè)序。
微滴方法的操作較簡(jiǎn)單通量較高,但缺點(diǎn)是每個(gè)細(xì)胞可獲取的基因數(shù)量低,通常在1到3千個(gè)基因左右,并且只能測(cè)到3’端順序,而不能做到全長(zhǎng)測(cè)序。PCR板方法的通量沒(méi)有微滴方法高,但有幾大優(yōu)勢(shì):
1、可以有選擇性進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序,提高了測(cè)序效率;
2、每個(gè)細(xì)胞可獲取的基因數(shù)量高,通常高達(dá)1萬(wàn)個(gè)基因以上;
3、可以做RNA全長(zhǎng)測(cè)序。微孔方法還比較新,通量高但是技術(shù)上有些受限,包括細(xì)胞間RNA的交叉污染等問(wèn)題還有待解決。
Namocell單細(xì)胞分離儀是基于PCR板方法的最高效,最簡(jiǎn)便的獲取單細(xì)胞的儀器。Namocell通過(guò)微流控芯片將所需要的單個(gè)細(xì)胞分選出來(lái),在PCR板的小管中進(jìn)行單細(xì)胞cDNA放大及合成。這不但能夠?qū)?xì)胞樣本進(jìn)行特異性篩選,也能夠在測(cè)序中獲得更大的數(shù)據(jù)量,最終極大的提升了測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量。
眾所周知,目前單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域最大的挑戰(zhàn)是成本太高。美國(guó)麻省理工學(xué)院的測(cè)序中心采用Namocell單細(xì)胞分離儀進(jìn)行單細(xì)胞的測(cè)序,使原先25微升的反應(yīng)量降低至1.2微升,使成本降低了20倍。該測(cè)序中心主任Stuart Levine博士在2019年10月的美國(guó)人類遺傳學(xué)會(huì)(American Society of Human Genetics)的年會(huì)中做了主題報(bào)告,分享了如何用Namocell單細(xì)胞分離儀降低反應(yīng)體積,以降低單細(xì)胞測(cè)序成本。
Namocell已經(jīng)跟一些相關(guān)公司開(kāi)展合作,正致力于在單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域提供全面解決方案,為用戶提供更方便,更低成本的服務(wù)。