免費(fèi)在線系列講座-CADD在小分子藥物研發(fā)中的應(yīng)用

近幾十年來，隨著計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)（CADD）已成為新藥研究的重要手段之一，通過計(jì)算機(jī)輔助手段，可以有效地加速先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化，縮短藥物研究與開發(fā)的周期，有效地降低開發(fā)成本�？店攀⑹菍�為生命科學(xué)領(lǐng)域以及研發(fā)機(jī)構(gòu)提供信息學(xué)產(chǎn)品及支持，在計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域有出色的產(chǎn)品以及解決方案的公司。在疫情特殊時(shí)期，為了讓廣大對(duì)CADD感興趣的藥物研發(fā)科研工作者能便捷地了解、學(xué)習(xí)CADD技術(shù)在小分子藥物研發(fā)中的應(yīng)用，康昱盛將在2020年4月-5月舉辦四期免費(fèi)的在線系列講座。
 
主辦單位：

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主講人：

林偉昱，產(chǎn)品經(jīng)理
盛亞運(yùn)，高級(jí)應(yīng)用工程師
肖新哲，應(yīng)用工程師

時(shí)間：

2020年4月2日（周四）15:00-16:00；
2020年4月16日（周四）15:00-16:00；
2020年4月30日（周四）15:00-16:00；
2020年5月14日（周四）15:00-16:00

授課方式：

免費(fèi)網(wǎng)絡(luò)授課

課程安排：                          

第一講：In Silico Fragment-Based Drug Design: Approaches and Applications

2020年4月2日（周四）15:00-16:00

基于片段的藥物設(shè)計(jì)是一種發(fā)現(xiàn)高質(zhì)量候選藥物的關(guān)鍵方法。作為對(duì)生物物理學(xué)的FBDD方法的補(bǔ)充，計(jì)算機(jī)模擬的FBDD采用基于結(jié)構(gòu)的方法快速設(shè)計(jì)和篩選大的虛擬化合物庫，考慮了更大化學(xué)空間的探索。

本次講座將主要介紹基本的計(jì)算機(jī)模擬FBDD方法，涵蓋了從組合片段庫設(shè)計(jì)，到受體活性口袋的骨架躍遷、片段連接和生長(zhǎng)。同時(shí)我們還將展示在MOE中如何通過基于反應(yīng)的組合庫設(shè)計(jì)和藥化轉(zhuǎn)化規(guī)則生成一系列相關(guān)聯(lián)的衍生物，以及討論如何利用藥效團(tuán)模型和2D/3D描述符來指導(dǎo)計(jì)算機(jī)模擬的FBDD過程。 第二講：StarDrop BIOSTER：Automatic Compound Generation with Improved Properties

2020年4月16日（周四）15:00-16:00

       小分子藥物設(shè)計(jì)、優(yōu)化和數(shù)據(jù)分析平臺(tái)StarDrop可以為用戶帶來極佳的交互式分子設(shè)計(jì)體驗(yàn)，利用StarDrop的分子設(shè)計(jì)模塊Nova和化學(xué)經(jīng)驗(yàn)知識(shí)庫BIOSTER，用戶可以基于多種方法全自動(dòng)生成性質(zhì)更佳的候選分子，并兼顧候選分子的可合成性。

       本次講座將主要介紹利用StarDrop來進(jìn)行藥物分子de novo設(shè)計(jì)的方法，涵蓋化合物創(chuàng)意轉(zhuǎn)化功能、匹配系列分析以及虛擬庫枚舉，并利用StarDrop特有的多參數(shù)評(píng)價(jià)方法和強(qiáng)大的交互式設(shè)計(jì)功能，來指導(dǎo)如何通過StarDrop全自動(dòng)生成性質(zhì)更均衡、更具化學(xué)創(chuàng)意的候選化合物。 第三講：StarDrop P450 Foreseeing Molecules: Additional P450 Prediction Guiding in silico Drug Design

2020年4月30日（周四）15:00-16:00

       作為藥物代謝預(yù)測(cè)軟件，StarDrop的代謝預(yù)測(cè)模塊P450廣受全球用戶的青睞�，F(xiàn)今，P450模塊即將在原來針對(duì)七種主要細(xì)胞色素P450酶亞型基礎(chǔ)上增加更多預(yù)測(cè)模型，包含黃素單加氧酶（FMO）和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸糖基轉(zhuǎn)移酶（UGT）預(yù)測(cè)模型。

       本次講座將為您展示利用StarDrop的P450模塊進(jìn)行藥物代謝預(yù)測(cè)及候選分子改造的功能，并展示全新的FMO和UGT預(yù)測(cè)模型。聯(lián)合頂尖的毒性預(yù)測(cè)模塊Derek Nexus，幫助您在模擬階段既可評(píng)估藥物分子及代謝產(chǎn)物的各項(xiàng)ADME性質(zhì)及毒性，幫助您獲得性質(zhì)更優(yōu)、毒性更小的候選分子。
第四講：Small Molecule Virtual Screening

2020年5月14日（周四）15:00-16:00

虛擬篩選 (Virtual Screening, VS) 是基于小分子數(shù)據(jù)庫開展的活性化合物篩選。利用小分子化合物與藥物靶標(biāo)間的分子對(duì)接運(yùn)算，虛擬篩選可快速從幾十至上百萬分子中，遴選出具有成藥性的活性化合物，大大降低實(shí)驗(yàn)篩選化合物數(shù)量，縮短研究周期，降低藥物研發(fā)的成本。據(jù)報(bào)道虛擬篩選的陽性率為5%-30%，利用虛擬篩選成功輔助藥物設(shè)計(jì)的案例逐年增多，虛擬篩選已成為目前最有潛力的藥物開發(fā)工具。

本次講座將系統(tǒng)介紹虛擬篩選的基本原理和一般流程，并以2019新冠病毒3CL水解酶晶體結(jié)構(gòu)（PDB code:6LU7）為例，通過MOE的多個(gè)模塊演示帶大家快速地深入了解和熟悉虛篩的具體操作。
如何報(bào)名：

如果您計(jì)劃參加，可以通過以下四種方式報(bào)名，為保證講課質(zhì)量，報(bào)名人數(shù)有限，建議您提前報(bào)名！

1. 進(jìn)入康昱盛官方網(wǎng)站 http://www.cloudscientific.com/plus/view.php?aid=380，進(jìn)入活動(dòng)頁面，點(diǎn)擊左下角“我要報(bào)名sign up"。
2. 將 “CADD+姓名+單位+郵箱+電話+研究方向”發(fā)送到marketing@cloudscientific.com，即可。
3. 關(guān)注“康昱盛”公眾號(hào)，發(fā)送“CADD+姓名+單位+郵箱+電話+研究方向”到公眾號(hào)報(bào)名。 4. 直接通過電話報(bào)名，電話： 021- 54975000

備注：您提交報(bào)名信息后，我們會(huì)在一個(gè)工作日內(nèi)通過電話或者微信聯(lián)系您，并在網(wǎng)絡(luò)講座開始當(dāng)日為您提供網(wǎng)絡(luò)授課地址，您可以與您的同學(xué)或同事共享學(xué)習(xí)！
 
 
關(guān)于MOE （Molecular Operating Environment）

MOE是由加拿大CCG公司開發(fā)的功能全面、強(qiáng)大的分子模擬及藥物設(shè)計(jì)綜合軟件，它是目前市場(chǎng)上被廣泛應(yīng)用的一個(gè)軟件包，世界排名前50的生物醫(yī)藥研發(fā)公司都在用這套軟件系統(tǒng)；在科研領(lǐng)域每年引用這個(gè)軟件發(fā)表的高水平文章多達(dá)近千篇。MOE集可視化、模擬和應(yīng)用開發(fā)于一體，可以輕松、靈活地用于基于結(jié)構(gòu)和基于片段的藥物設(shè)計(jì)，藥效團(tuán)的發(fā)現(xiàn)和篩選，藥物化學(xué)的應(yīng)用，生物藥的應(yīng)用，蛋白和抗體的建模，分子建模和模擬，化學(xué)信息學(xué)和定量構(gòu)效關(guān)系，以及定制化開發(fā)等等。

關(guān)于StarDrop

StarDrop是一個(gè)用于在藥物發(fā)現(xiàn)中輔助決策、幫助項(xiàng)目組快速確定高質(zhì)量化合物的軟件。
StarDrop用于評(píng)估復(fù)雜的數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)通常由于實(shí)驗(yàn)或預(yù)測(cè)產(chǎn)生的誤差而具有一定的不確定性。在對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行評(píng)分時(shí)，StarDrop給您帶來可靠與直觀簡(jiǎn)潔的方法，以幫助做出決策：哪些化合物是您需要優(yōu)先考慮開發(fā)的。StarDrop良好的交互式工具可以幫助您有效地開拓改進(jìn)化合物的途徑。通過其高度可視化、易于使用的界面，StarDrop將指導(dǎo)您完成每個(gè)階段的化合物選擇和設(shè)計(jì)過程。StarDrop獨(dú)特的Card View為您提供了自由的環(huán)境去探索、管理您的項(xiàng)目數(shù)據(jù)，根據(jù)您自己的想法獲取化合物之間的關(guān)系；不再受限于表格和列表，從而能快速地找到高質(zhì)量的化合物和新的優(yōu)化策略。