日期 | 時(shí)間 | 培訓(xùn)內(nèi)容 | 授課老師 |
第一天 | 9:00-11:30 | 理論講解: 一、基因編輯技術(shù)簡(jiǎn)介(三代基因編輯工具) 1. ZFN 2.TALEN 3.CRISPR 二、CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)原理 1. CRISPR/Cas9發(fā)現(xiàn)歷史 2. CRISPR/Cas9作用機(jī)制解析 3. CRISPR/Cas9系統(tǒng)改造策略 |
劉剛博士 2008年博士畢業(yè)于中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院,從事腫瘤干細(xì)胞,細(xì)胞衰老,腫瘤轉(zhuǎn)移等細(xì)胞作用網(wǎng)絡(luò)和通路的研究,并作為骨干研究人員參加了973計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、在香港中文大學(xué)做為作為Postdoc和Research fellow,從事研究工作。先后Nature Genetics,cell research、PLOS one等期刊發(fā)表論文十余篇。 |
13:00-17:00 | 理論講解: 一、sgRNA在線設(shè)計(jì)構(gòu)建實(shí)戰(zhàn)演練(1.靶基因序列查找2.sgRNA在線設(shè)計(jì)合成) 二、CRISPR/Cas9轉(zhuǎn)染策略: 1.生物轉(zhuǎn)染(慢病毒、腺相關(guān)病毒等) 2.物理轉(zhuǎn)染 (電轉(zhuǎn)核酸/RNP、顯微注射、基因槍) 3.化學(xué)轉(zhuǎn)染 (脂質(zhì)體、陽(yáng)離子聚合物) 三、CRISPR/Cas9 sgRNA效率檢測(cè),脫靶檢測(cè)及解決策略 1、高保真Cas9(espCas9、Hifi-Cas9、Cluster1-Cas9) |
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第二天 | 9:00-11:30 | 理論講解: 一、CRISPR技術(shù)應(yīng)用解析 1.基因敲除(單基因敲除、多基因敲除、大片段刪除、多靶點(diǎn)sgRNA載體構(gòu)建策略) 2.基因敲入實(shí)戰(zhàn)演練(gRNA選擇、同源臂設(shè)計(jì)、導(dǎo)入,長(zhǎng)片段導(dǎo)入策略/提高基因敲入效率策略,PITCh、HITI、CRISPR-轉(zhuǎn)座酶高效基因敲入系統(tǒng)) 3.CRISPR在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的應(yīng)用(轉(zhuǎn)錄激活、轉(zhuǎn)錄抑制系統(tǒng)) 4.CRISPR靶基因標(biāo)記定位 二、CRISPR案例解析 1.基因敲除在小鼠模型構(gòu)建、植物、細(xì)胞、細(xì)菌、真菌等中的應(yīng)用案例解析 2.基于CRISPR的全基因組基因敲除高通量篩選策略(文庫(kù)構(gòu)建,選擇,流程優(yōu)化等) 3.基于CRISPR的全基因組轉(zhuǎn)錄激活/抑制高通量篩選策略(文庫(kù)構(gòu)建,選擇,流程優(yōu)化等) 三、CRISPR/Cas9與基因沉默技術(shù)(siRNA、shRNA)系統(tǒng)比較。 |
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13:00-17:00 | 理論講解: 一、單堿基基因編輯技術(shù)簡(jiǎn)介及在基因治療中的應(yīng)用 1.HF2-BE2 2.BE3系統(tǒng) 3.ABE系統(tǒng)4.單堿基基因編輯脫靶克服。 二、基因CRISPR的基因檢測(cè)系統(tǒng) 1、CRISPR-Cas12a系統(tǒng)介紹(DETECTR) 2、CRISPR-Cas13a系統(tǒng)介紹(SHERLOCK-多重病原菌檢測(cè)) 三、CRISPR/Cas9系統(tǒng)在腫瘤和遺傳病治療中應(yīng)用解析 1、CRISPR結(jié)合免疫檢查點(diǎn)抑制劑治療腫瘤 2、單基因遺傳病治療(DMD、先天性黑朦、地中海貧血等) 3、CRISPR治療HIV-基因編輯嬰兒解析 4、CRISPR治療HIV炎性白血病病例解析 四、新一代無(wú)模板基因敲入系統(tǒng)解析 1、CRISPR Primer-editing 基因敲入原理及應(yīng)用 |
實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 | 培訓(xùn)內(nèi)容 |
sgRNA敲除載體構(gòu)建 | 1.靶基因序列查找 |
2.sgRNA在線設(shè)計(jì)合成 | |
3.敲除載體選擇及線性化 | |
4. sgRNA連接,轉(zhuǎn)化等 | |
敲除載體轉(zhuǎn)染及初步鑒定 | 1.敲除質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 |
2.轉(zhuǎn)染篩選及敲除效果鑒定 | |
3.單克隆鑒定 |
課程福利
所有參加培訓(xùn)的老師均可獲得:
1. 免費(fèi)贈(zèng)送基因編輯質(zhì)粒載體一份:可以用于哺乳動(dòng)物、植物、真菌、細(xì)菌、斑馬魚、線蟲等,共62種。
2. 免費(fèi)贈(zèng)送sgRNA離線設(shè)計(jì)軟件(有基因組DNA序列即可設(shè)計(jì)。
3. 分子生物學(xué)免費(fèi)軟件安裝包一套(snapgene,premier6,Graphpad6.01,億圖圖示專家-技術(shù)路線圖繪制,Endnote,F(xiàn)lowjo等)。
4. 免費(fèi)獲得價(jià)值99美元信號(hào)通路圖制作神器 Biomedical-PPT-Toolkit-Suite一套。