我們很榮幸在10月和11月為您帶來一系列有關(guān)表觀遺傳學(xué)研究的網(wǎng)絡(luò)研討會。研究者們會介紹表觀遺傳學(xué)研究中的一些有趣的話題!
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Dovetail Genomics公司介紹
Dovetail Genomics公司在2013年成立于美國,初期提供從文庫構(gòu)建到基因組組裝注釋的技術(shù)服務(wù)。目前Dovetail Genomics同時(shí)提供商業(yè)化的染色質(zhì)互作建庫試劑盒。是世界領(lǐng)先的Hi-C技術(shù)服務(wù)公司,已經(jīng)在全球范圍內(nèi)建立了多個(gè)的基因組服務(wù)。共有以下四種試劑盒。
這是研究染色質(zhì)構(gòu)象的試劑盒,該試劑盒改進(jìn)了染色質(zhì)片段化方法,分別使用了DNase和微球菌核酸(MNase),由此產(chǎn)生的高度一致的短片段,這也使得解析染色質(zhì)互作的分辨率達(dá)到了核小體級尺度,這也是理論上實(shí)驗(yàn)?zāi)軐?shí)現(xiàn)的最大分辨率。打破高分辨率障礙:Micro-C使染色質(zhì)構(gòu)象捕獲在核小體水平
主要內(nèi)容:
*Micro-C 試劑盒中MNase酶的使用,如何提高了染色質(zhì)分辨率?
*Micro-C信噪比增加的原因以及減少染色質(zhì)構(gòu)象測序負(fù)擔(dān)的意義。
*Micro-C捕獲到的傳統(tǒng)Hi-C方法難以捕獲的內(nèi)容,包括增強(qiáng)子-啟動(dòng)子和啟動(dòng)子-啟動(dòng)子的相互作用。
*Micro-C技術(shù)如何運(yùn)用到ChiP中。
從基因型到表型:通過基因組拓?fù)鋵⑿蛄凶儺惻c染色質(zhì)動(dòng)力學(xué)聯(lián)系起來
主要內(nèi)容:
*基因組的構(gòu)象在基因調(diào)控中的作用。
*為什么將構(gòu)象數(shù)據(jù)與基因組數(shù)據(jù)整合在一起可以獲得更完整的文庫變體視圖。
*為什么整合構(gòu)象數(shù)據(jù)和基因分型數(shù)據(jù)可以提供一個(gè)更完整的觀點(diǎn)的變異。
*如何在單個(gè)測序庫中捕獲具有構(gòu)象的變體(SNV和結(jié)構(gòu)變體)。
ChIP-seq后的檢測:基因組構(gòu)象提升了我們對于基因調(diào)控的認(rèn)知主要內(nèi)容:
*基因組構(gòu)象在基因調(diào)控研究中的作用。
*為什么拓?fù)湎嗷プ饔每梢詫⒒蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)描繪的更完整。
*拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的在發(fā)育、基因調(diào)控和疾病研究中的應(yīng)用。
*如何將Hi-C的三維數(shù)據(jù)與ChIP-seq結(jié)合。