質(zhì)譜掃描SARS-CoV-SNP鑒定新冠與薩斯獲國(guó)家專利

中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院與北京萬(wàn)泉麟科技有限公司合作，于2020年8月研發(fā)《質(zhì)譜掃描SARS-CoV-SNP》，成功用于模擬SARS-CoV和SARS-CoV2病毒的檢測(cè)與鑒定，并于2021年5月11日獲得國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予發(fā)明專利授權(quán)ZL202010874232.5。

為了快速應(yīng)對(duì)突如其來(lái)的SARS相關(guān)冠狀病毒物種的襲擊，有必要研發(fā)“一種能夠通過(guò)SNP檢測(cè)和鑒定SARS相關(guān)冠狀病毒的通用試劑盒”，該試劑盒不僅能夠超高靈敏度精確檢測(cè)和區(qū)分已有的SARS-CoV和SARS-CoV-2病毒，而且還能夠用于對(duì)未來(lái)可能發(fā)生的新型冠狀病毒SARS-CoV-3，4，n進(jìn)行迅速、有效、及時(shí)的監(jiān)控和預(yù)警，為人類(lèi)預(yù)防未來(lái)新型冠狀病毒及其變種再次來(lái)襲，提供強(qiáng)有力的快速偵測(cè)工具。

經(jīng)幾千例SARS-CoV相關(guān)病毒全基因組DNA條形碼序列分析，從10個(gè)基因區(qū)域（ 5UTR, L, RdRp, ZD, S, EC3, M, N, O10, 3UTR ）中篩選出能夠區(qū)分SARS-CoV與SARS-CoV2的種特異性SNP保守位點(diǎn)，建立SARS-CoV相關(guān)病毒DNA二維碼識(shí)別標(biāo)志。（見(jiàn)表1）
 
 
注：設(shè)計(jì)十組引物和探針，分別靶向以上10個(gè)SNP位點(diǎn)。
采用多重PCR-MS精細(xì)測(cè)序。根據(jù)四堿基單點(diǎn)延伸組合，區(qū)分SARS-CoV與SARS-CoV-2，并預(yù)測(cè)未來(lái)可能出現(xiàn)的SARS-CoV-3，4，….n，真正做到防患于未然。（見(jiàn)圖1）
  注：1. 左圖：RdRp 探針?lè)鍨?381.1 Da，經(jīng)單堿延伸反應(yīng)后未移動(dòng)為陰性；2、中圖：經(jīng)單堿延伸后，峰移至6652.4 Da即A堿基工作，為SARS-2
3、右圖：經(jīng)單堿延伸后，峰移至6668.4Da 即G堿基工作，SARS-CoV
4、當(dāng)出現(xiàn)C/T時(shí)，則預(yù)示出現(xiàn)新SARS-Cov-n
 
目前獲得CFDA批準(zhǔn)的商用試劑盒，有單靶區(qū)段（ORF1ab）、雙靶區(qū)段（ORF1ab、N蛋白）、三靶區(qū)段（ORF1ab、N蛋白和E蛋白）的試劑，用于檢測(cè)SARS-CoV-2。
本發(fā)明的創(chuàng)造性在于，使用一套引物探針，同時(shí)檢測(cè)兩種完全不同種的病毒，不僅節(jié)省了合成引物的檢測(cè)成本，而且大大提高了檢測(cè)靈敏度，相當(dāng)于一次對(duì)一個(gè)樣本作了10次單色PCR，5次雙色PCR, 2.5次4色PCR。不僅可以提高檢測(cè)易變異和降解的RNA病毒的靈敏度，有效避免目前商用試劑1-2探針PCR檢測(cè)引起的低載量SARS-CoV-2病毒漏檢。而且可以用于對(duì)未來(lái)可能再次來(lái)襲的新SARS-CoV-3，4 …n,進(jìn)行預(yù)警。（見(jiàn)圖2）
 

SARS-CoV2 positive report	SARS-CoV positive report

 
在此發(fā)明之前，眾所周知PCR-MS法定義為只能用于檢測(cè)已知序列，不能用于檢測(cè)未知。而本發(fā)明第一次提出能夠用于預(yù)測(cè)未知物種的發(fā)生，將PCR-MS質(zhì)譜精細(xì)測(cè)序的作用發(fā)揮到了一個(gè)嶄新的階段。
 
中國(guó)檢驗(yàn)檢疫科學(xué)研究院是國(guó)家設(shè)立的公益性檢驗(yàn)檢測(cè)檢疫中央研究機(jī)構(gòu)，主要任務(wù)是開(kāi)展檢驗(yàn)檢測(cè)檢疫應(yīng)用研究，以及相關(guān)基礎(chǔ)、高新技術(shù)和軟科學(xué)研究，著重解決檢驗(yàn)檢測(cè)檢疫工作中帶有全局性、綜合性、關(guān)鍵性、突發(fā)性、基礎(chǔ)性的科學(xué)技術(shù)問(wèn)題，為國(guó)家檢驗(yàn)檢測(cè)檢疫決策、市場(chǎng)綜合監(jiān)管和質(zhì)量安全提升提供技術(shù)支持。

北京萬(wàn)泉麟科技有限公司專一致力于基于質(zhì)譜的病原微生物檢測(cè)試劑盒研發(fā)與服務(wù)，擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的《質(zhì)譜掃描病原體MasScan®Pathogens》和《質(zhì)譜掃描SNP二維碼分型MasScan^® SNP2D》系列產(chǎn)品，重點(diǎn)關(guān)注與人類(lèi)癌癥息息相關(guān)的“18種生物致癌因子”和“65種α屬粘膜皮膚高危HR-HPV及54種β屬皮膚致癌致疣HPV”等檢測(cè)。