腫瘤免疫浸潤(rùn)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)和工具使用技能實(shí)戰(zhàn)課通知

 
近期“腫瘤微環(huán)境、免疫浸潤(rùn)分析”相關(guān)研究不僅在論文發(fā)表上，發(fā)表數(shù)量逐年遞增。從近年的國(guó)家自然科學(xué)基金資助的項(xiàng)目數(shù)和總金額來(lái)看，腫瘤微環(huán)境和免疫方向相關(guān)立項(xiàng)也是節(jié)節(jié)攀升，反映了這一研究領(lǐng)域的重要性。
腫瘤微環(huán)境主要由腫瘤細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、免疫細(xì)胞、各種信號(hào)分子和細(xì)胞外基質(zhì)及特殊的理化特征等共同組成，腫瘤微環(huán)境顯著影響著腫瘤的診斷、生存結(jié)局和臨床治療敏感性。

通過(guò)發(fā)揮促腫瘤作用和抗腫瘤作用，浸潤(rùn)腫瘤的免疫細(xì)胞可以深刻影響腫瘤的進(jìn)展以及抗癌治療的成功。因此，腫瘤浸潤(rùn)免疫細(xì)胞的量化有望揭示免疫系統(tǒng)在人類癌癥中的多方面作用，并參與腫瘤逃逸機(jī)制和對(duì)治療的反應(yīng)。

因此免疫浸潤(rùn)也是近幾年腫瘤研究的一個(gè)重要方向。目前也有一些比較方便的工具幫助大家挖掘免疫浸潤(rùn)，如CIBERSORT等。

那么到底熱門文獻(xiàn)中免疫浸潤(rùn)分析是什么樣的？我們自己能不能做得出來(lái)？免疫浸潤(rùn)分析的相關(guān)工具和數(shù)據(jù)庫(kù)到底有哪些，又該如何使用？

華斯泰、爾云主辦的《腫瘤微環(huán)境和免疫浸潤(rùn)分析-生信技能課程》將帶領(lǐng)大家逐一對(duì)相關(guān)的工具和數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行學(xué)習(xí)，希望大家學(xué)習(xí)之后對(duì)免疫浸潤(rùn)分析有更深刻的了解，基本能夠滿足論文和基金中對(duì)于免疫浸潤(rùn)分析的需求。

一、學(xué)習(xí)目的與預(yù)期
1、主流免疫浸潤(rùn)分析數(shù)據(jù)庫(kù)（IMMUPORT、TISIDB、TIMER等）的熟悉掌握。
2、主流免疫浸潤(rùn)分析工具（CIBERSORT、ESTIMATE、xCELL等）的熟悉掌握。
3、掌握復(fù)現(xiàn)高分文獻(xiàn)中免疫浸潤(rùn)相關(guān)展示圖表的能力。
4、能夠滿足日常文章以及國(guó)自然基金免疫浸潤(rùn)分析相關(guān)圖表的制作。
二、導(dǎo)師介紹
宋老師，從事生信分析工作多年，參與并完成了超過(guò)百個(gè)軟件著作權(quán)和發(fā)明專利的撰寫和申請(qǐng)，參與超過(guò)近三百個(gè)項(xiàng)目的設(shè)計(jì)、開發(fā)、分析環(huán)節(jié)。
研究方向：擅長(zhǎng)GEO、TCGA數(shù)據(jù)挖掘；轉(zhuǎn)錄組、代謝組，蛋白組，16S等二代測(cè)序標(biāo)準(zhǔn)分析和定制化高級(jí)分析；長(zhǎng)期專注于腫瘤方向生物信息數(shù)據(jù)分析，精通R語(yǔ)言以及各類生物信息學(xué)軟件。
主要培訓(xùn)方向：《GEO數(shù)據(jù)挖掘》、《TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘和應(yīng)用》、《網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析》、《腸道微生物相關(guān)分析》等。
三、會(huì)議安排

時(shí)間安排		主要內(nèi)容
第一天	9:00~10:10	腫瘤免疫浸潤(rùn)高分生信文獻(xiàn)梳理 免疫浸潤(rùn)知識(shí)介紹并梳理文獻(xiàn)的關(guān)鍵圖表
	10:20~11:30	實(shí)操課∶ 1、TISIDB免疫學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹和使用 2、IMMUPORT免疫數(shù)據(jù)庫(kù)的介紹和使用
	14:00~15:10	實(shí)操課∶免疫細(xì)胞浸潤(rùn)估計(jì)工具CIBERSORT實(shí)操（包括原理，數(shù)據(jù)準(zhǔn)備，實(shí)操，結(jié)果可視化以及結(jié)果解讀）
	15:20~16:30	實(shí)操課∶ssGSEA 樣本基因集富集分析實(shí)操（原理，數(shù)據(jù)準(zhǔn)備，操作和結(jié)果解讀）
第二天	9:00~10:10	實(shí)操課∶腫瘤免疫工具 TIMER的實(shí)操以及結(jié)果解讀
	10:20~11:30	實(shí)操課∶腫瘤純度算法工具ESTIMATE的實(shí)操以及結(jié)果解讀
	14:00~15:10	實(shí)操課∶ 1、腫瘤免疫浸潤(rùn)分析工具 EPIC 使用 2、腫瘤免疫浸潤(rùn)分析工具xCE 使用
	15:20~16:30	課程成果檢測(cè)∶3-5分左右純生信文獻(xiàn)涉及免疫浸潤(rùn)部分的結(jié)果復(fù)現(xiàn)實(shí)操。提供整理數(shù)據(jù)

四、培訓(xùn)相關(guān)
開班時(shí)間：2021年12月18-19日
開班地點(diǎn)：線上直播
主辦方：華斯泰科研培訓(xùn)中心
承辦方：華斯泰生物醫(yī)學(xué)科技有限公司
報(bào)名費(fèi)：3200/人（可開具發(fā)票，費(fèi)用包含電子版材料）
優(yōu)惠政策：
1、提前報(bào)名及轉(zhuǎn)賬的，可以提前拿到學(xué)習(xí)材料
2、兩人成團(tuán)報(bào)名，每人減100
3、三人成團(tuán)報(bào)名，每人減200
4、參與培訓(xùn)的老師，課程結(jié)束后可以獲得全套視頻
報(bào)名咨詢：
聯(lián)系人：李老師                                                        
手 機(jī)：13366403928(微信同號(hào))
E-mail：13366403928@163.com

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