專場早知道!單細胞分析邁入多組學時代,掀起單細胞多組學研究新革命!
大量的多組學分析,如基因組、轉錄組和蛋白質(zhì)基因組學分析,已被證明有利于加強對細胞事件的全面了解。這一優(yōu)勢促進了單細胞多組學分析的發(fā)展。近年來出現(xiàn)了一些前沿的單細胞多組學技術,并掀起了一場新的研究革命!
今天,我們可以在一個細胞內(nèi)看到多重宇宙,或者更準確地說,叫做“多個組學”。當前發(fā)展出的技術已經(jīng)允許我們觀察代謝組、轉錄組、蛋白質(zhì)組和其他組學,因此,更詳細和更廣闊的視野正展現(xiàn)在我們的眼前。更重要的是,這些技術正被有機地裝載為多組學技術平臺,使我們能看到單一組學無法觀察到的互作關系和模式。
為了促進單細胞技術及組學應用交流合作,由萬怡醫(yī)學主辦的“
第二屆單細胞技術及組學應用發(fā)展大會”將于
2023年5月19-20日在
上海盛大召開!大會匯集70+業(yè)內(nèi)大咖領袖,1000+優(yōu)秀同仁,傳遞最新行業(yè)信息,積極促進研究成果轉化落地!愿在春日融融的五月,邀您共赴這場學術盛宴!
單細胞多組學研究進展專場,大咖搶先看!
葉幼瓊,上海市免疫學研究所研究員
報告題目:基于單細胞組學和空間轉錄組數(shù)據(jù)解析腫瘤微環(huán)境
嘉賓簡介:
葉幼瓊,研究員,博士生導師。上海交通大學醫(yī)學院上海市免疫學研究所,腫瘤多組學與腫瘤免疫課題組長。課題組聚焦腫瘤(邊界)微環(huán)境和免疫治療,圍繞腫瘤(邊界)微環(huán)境,以生物大數(shù)據(jù)為驅(qū)動,構建算法、結合生信創(chuàng)新方法、基礎實驗、臨床隊列等多尺度手段闡釋TME中調(diào)控因子對腫瘤進展和免疫逃逸機制、并利用多維數(shù)據(jù)構建免疫治療療效預測模型,為免疫治療提供新治療策略。以通訊/共同通訊作者發(fā)表4篇學術論文,包括Nature Communications 2022)、Journal of Clinical Investigation (2021)、Genome Medicine (2020)、Molecular Cancer (2021),以第一/共同第一作者發(fā)表11篇學術論文,包括Cancer Cell (2020)、Nature Metabolism (2019)、Nature Immunology (2019)、Nature Communications (2020)、Cell Systems (2018),以第一申請人獲批一項軟件著作權。受邀發(fā)表評論及綜述文章4篇,包括Cancer Cell (2021)、Trends Genetics (2020)和Trends Cancer (2018)等?傆3篇 IF >20;16篇IF >10的學術論文。主要研究內(nèi)容為 1)利用單細胞組學、空間組學和病理圖片等多尺度數(shù)據(jù)構建精準研究腫瘤邊界微環(huán)境的工具,以研究腫瘤邊界微環(huán)境在不同腫瘤免疫微環(huán)境分型、腫瘤轉移、免疫治療耐受中調(diào)控機制,及開放基于邊界微環(huán)境調(diào)控因子的新腫瘤治療策略;2)基于臨床隊列的單細胞等組學揭示腫瘤微環(huán)境相關特征以輔助腫瘤免疫治療。
陳磊,上海交通大學基礎醫(yī)學院研究員
報告題目:單細胞空間宏轉錄組測序研究
嘉賓簡介:
陳磊研究員,基因組與微生物組學課題組組長。2010年獲得貝勒醫(yī)學院博士學位;2010-2014在圣路易斯華盛頓大學從事博士后研究;2014-2016在美國杰克遜基因組醫(yī)學實驗室擔任生物信息分析師;2016加入我院,任“基因組與微生物組學”課題組組長。陳磊課題組長期從事生物信息方面的研究工作,研究重點一方面是基因測序數(shù)據(jù)的挖掘與分析,另一方面是微生物組與疾病的研究,相關成果發(fā)表在Nature,Science,GenomeResearch 等雜志上。長期從事生物信息方面的研究工作,研究重點一方面是基因測序數(shù)據(jù)的挖掘與分析,另一方面是微生物組與疾病的研究。1. 基因測序相關的生物信息學。2. 利用基因測序研究人體共生微生物群體,研究它們與人類慢性疾病的關系。3. 腸道微生態(tài)與免疫系統(tǒng)的相互作用。
郝潔,復旦大學附屬中山醫(yī)院研究員/英國帝國理工大學榮譽研究員
報告題目:組學分析促進單細胞技術的臨床轉化研究
嘉賓簡介:
郝潔,生物醫(yī)學信息學博士,復旦大學附屬中山醫(yī)院研究員,英國帝國理工大學 榮譽研究員,上海市浦江人才。研究方向:機器學習,代謝組學,蛋白組學,單細胞組學等多組學生物醫(yī)學信息學新算法研究。2004年以英國伯明翰大學電子電機工程系建系以來最高分獲得電子電機工程本碩連讀工程碩士一等榮譽學位,畢業(yè)論文獲得當年唯一最佳設計獎。2005年獲得由英國教育部長親自簽發(fā)的海外優(yōu)秀學生的全額博士獎學金,在英國伯明翰大學攻讀生物醫(yī)學信息學博士。2010年加入英國帝國理工大學,代謝組學創(chuàng)史人Jeremy Nicholson教授的研究組,從事機器學習,生物信息學,化學計量學,多變量統(tǒng)計分析等在代謝組學等多組學領域的應用,以及算法和軟件的研發(fā)。以第一作者和通訊作者在Nature Protocols, Bioinformatics, Analytical Chemistry,Briefings in Bioinformatics, Frontiers of medicine,NMR in Biomedicine等國際知名期刊上發(fā)表多篇高水平學術論文,google scholar他引近2800次。一篇文章歸入Clinical Medicine學術領域同一出版年最優(yōu)秀前1%, 并被web of science標示為熱點論文和高被引論文。已授權發(fā)明專利3項(第一發(fā)明人)。2016年入選上海市浦江人才計劃。
石鐵流,華東師范大學生命醫(yī)學研究所/生命科學學院教授
報告題目:基于單細胞組學探討訓練固有免疫記憶中巨噬細胞的作用
嘉賓簡介:
石鐵流 教授,博導。于1992年在中科院上海植物生理研究所獲得植物生理專業(yè)碩士學位。1999于美國Louisville大學獲計算機碩士學位,2000年于Louisville大學獲得分子生物學博士學位。2002年6月回國,加入到中科院上海生命科學研究院生物信息中心,擔任副主任。2008年底加入到華東師范大學,為生命科學學院教授。多年來從事生物信息學和計算系統(tǒng)生物學的研究。主要的研究方向是:1. 臨床信息標準化及臨床大數(shù)據(jù)研究;2. 高通量數(shù)據(jù)(測序數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù))分析及方法學開發(fā);3.整合臨床信息和多組學數(shù)據(jù)的疾病基因及機理研究,生物分子標記的發(fā)現(xiàn)和藥物靶點研究。主持和參與了多項國家863項目、973項目和“中國人類蛋白質(zhì)組”等重大研究計劃項目,國家自然科學基金項目。已在Nature, Cell, Nature Biotechnology,Nature Communication, Cell Research等雜志上發(fā)表了150多篇SCI的研究論文。通過數(shù)據(jù)整合及大規(guī)模的文本挖掘,建立了最完善的罕見疾病和出生缺陷的注釋平臺。此外,還建立了一站式蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析平臺 - Firmiana、測序數(shù)據(jù)分析及疾病基因組的分析平臺,為系統(tǒng)地高通量的開展相關組學數(shù)據(jù)分析打下了基礎。目前擔任上海植物生理學會理事和上海生物信息學學會理事,上海市基因健康專委會委員和上海市計算機生物信息學專委會委員。同時擔任《中國科學–生命科學》(Science China-Life Sciences)雜志的生物信息學和系統(tǒng)生物學Section編委,Pediatric Investigation雜志副主編等。
張力燁,上?萍即髮W生命科學與技術學院研究員
報告題目:單細胞組學應用研究
嘉賓簡介:
張力燁,博士,研究員。現(xiàn)任上?萍即髮W生命科學與技術學院課題組組長。2003-2007年就讀于上海交通大學生命學院,獲得生物技術學士學位。2007-2012年就讀于美國賓州州立大學Franklin Pugh和馬紅課題組獲得細胞和發(fā)育生物學博士學位。2012-2017年在美國波士頓大學醫(yī)學院計算生物醫(yī)學中心Stefano Monti課題組從事博士后研究。2017年五月起人上?萍即髮W生命科學與技術學院研究員,博士生導師,課題組組長。以第一作者或者通訊作者在Molecular Cell,Genome Research,EMBO Journal,Molecular Therapy等雜志,包括合作工作共發(fā)表論文30余篇,發(fā)表論文H-index為18。得到了國家自然科學基金支持,并作為骨干參與國家重點研發(fā)項目。目前研究方向主要側重在使用生物信息學手段研究腫瘤的轉移進化機制。目前課題組尤其關注腫瘤發(fā)展轉移過程中表觀遺傳和大規(guī)?截悢(shù)變異所發(fā)揮的作用,并試圖分析研究腫瘤轉移進化過程中基因組的動態(tài)變化。
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2023年5月19-20日,上海!給您展示自己的舞臺!
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參展可咨詢:李女士:155 0212 4800同微信
壁報征集令
為提高會議水平,活躍學術氣氛,培養(yǎng)青年醫(yī)生、學生和科研人員,增進相互了解。本次大會設立墻報展示區(qū),鼓勵醫(yī)生、科研人員、學生等參會代表用墻報的方式展示自己近期的研究及成果。申請人可聯(lián)系會務組(李老師:155 0212 4800同微信)提交展示材料(Word/PDF格式),審核通過后將告知申請人,申請壁報展示的企業(yè)或個人將獲得
大會免費觀摩券一張。
征集對象:醫(yī)生、醫(yī)藥研發(fā)領域相關科研及學術、臨床研究等機構、團體或個人。
征集范圍:不限于臨床研究及醫(yī)藥研發(fā)領域相關科研成果、學術論文、項目成果展示等,不接受廣告類、機構宣傳類、非科學性、商業(yè)性及違規(guī)敏感類信息展示。
壁報要求:尺寸90cm×120cm(豎版),圖文結合,印刷精度300dpi以上,紙版壁報自行制作帶到現(xiàn)場張貼。
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