BSI攜PEAKS系列新版本軟件亮相美國第72屆ASMS大會

瀏覽次數(shù)：1360　發(fā)布日期：2024-6-11　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉(zhuǎn)載請注明出處

2024年6月2日-6月6日，第72屆美國質(zhì)譜年會（ASMS）在美國阿納海姆隆重舉行！BSI攜最新版本的PEAKS®系列軟件與DeepImmu®免疫肽組發(fā)現(xiàn)服務(wù)、PEAKS AB®多克隆抗體測序服務(wù)新品亮相大會！

PEAKS® 新版本軟件亮點

全面支持ThermoFisher Hybrid-DIA、AB SCIEX ZT Scan DIA數(shù)據(jù)的快速、準確分析；
支持Bruker TimsTOF ddaPASEF抗體測序數(shù)據(jù)分析。
DeepNovo® Peptidome workflow算法升級，全面支持DDA和DIA數(shù)據(jù)的免疫肽組分析。
免疫肽組分析支持基因關(guān)聯(lián)、序列變異和翻譯后修飾位點鑒定。
PEAKS DB search通過深度學(xué)習(xí)提升MS2評分，鑒定數(shù)量提升10%。
DIA數(shù)據(jù)分析性能大幅提升，速度更快、更靈敏、更準確，更好的短梯度數(shù)據(jù)分析支持。

會議期間，CTO辛磊博士受邀參加了深度學(xué)習(xí)從頭測序算法的技術(shù)研討會，在會上分享了PEAKS®算法團隊在de novo sequencing領(lǐng)域多年的工作成果，以及deep learning技術(shù)當下的應(yīng)用及對未來的展望。作為首個將深度學(xué)習(xí)應(yīng)用到de novo sequencing的算法模型，BSI的DeepNovo®也得到后續(xù)眾多算法的借鑒與引用。

此外，對于近幾年大熱的免疫多肽研究，會場的相關(guān)墻報幾乎也成了PEAKS®專場。來自Helmboltz Institute of Translational Oncology Mainz，Genentech，The Children's Hospital of Philadelphia，Baylor college of Medicine, Roche， ADA Forsyth Institute，Regeneron等臨床機構(gòu)、制藥公司，學(xué)術(shù)單位展示了他們利用PEAKS的DeepNovo Peptidome或者de novo sequencing工作流在免疫多肽組發(fā)現(xiàn)中的數(shù)據(jù)分析應(yīng)用。蒙特利爾大學(xué)的Pierre Thibault教授也在口頭報告中分享了他們在非小細胞肺癌方面利用PEAKS進行的相關(guān)工作成果。

本次會議BSI及百蓁生物共展出6張墻報，涉及新抗原發(fā)現(xiàn)方法和流程，多抗測序方法，從頭測序算法，數(shù)據(jù)統(tǒng)計等方面，引起了眾多業(yè)內(nèi)同行的興趣并討論。TP 566 An AI-driven, proteogenomics-based and complete workflow for novel neoantigen discovery
Authors: Qing Zhang [1], Kyle Hoffman [1], Sahar Rabinoviz [1], Peng Chao [2], Haibo Bian [1], Wenting Li [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China
ThP 058 A Bayesian model for estimating the posterior error probability and the false discovery rate of de novo peptide sequencing
Authors: Hieu Tran [1], Rui Qiao [1], Lei Xin [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ONWP 047 Revolutionizing Proteomics: Ultra-Fast, High-Accuracy Peptide Sequencing with Enhanced GraphNovo AlgorithmAuthors: Zeping Mao [1], Lei Xin[1], Shengying Pan [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
WP 704 Combining Top-Down and Bottom-Up Mass Spectrometry Paves the Way for High Throughput Polyclonal Antibody Sequencing
Authors: Lei Xin [1], Peng Chao [2], Jun Ma [2], Shuyang Zhang [1], Zihao Wang [1], Wenting Li [1], Kyle Hoffman [1], Ailee Aihemaiti [1], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Baizhen Biotechnology (Shanghai) Co., Ltd., Shanghai 201112, China
MP 451 Confident identification of proteome-wide low-level mutations using PEAKS 11.5
Authors: Kyle Hoffman [1], Julie Genereaux [2], Lei Xin [1], Zia Rahman [1], Christopher J Brandl [2], Patrick O’Donoghue [2], Baozhen Shan [1]
[1] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON
[2] Western University, London, ON
TP 576 Distinguishing MIPs in the cell surface or in processing by MS with Immunoprecipitation and Mild Acid Elution methods
Authors: Chao Peng[1], Ping Wu[1], Haofei Miao[1], Ling Li[1], Baozhen Shan [2]
[1] BaizhenBio (Wuhan) Inc., Hubei, China
[2] Bioinformatics Solutions Inc., Waterloo, ON

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