講座：基于深度學習DIA數(shù)據(jù)分析及腫瘤新生抗原發(fā)現(xiàn)

金秋九月，豆谷科技將聯(lián)合BSI于2021年9月28日推出基于PEAKS Online高靈敏度高通量的DIA完整數(shù)據(jù)分析及腫瘤新生抗原解決方案的免費在線講座。由高級應(yīng)用工程師李文婷為大家介紹PEAKS Online的軟件平臺，并由BSI的單寶珍博士和大家一起探討AI賦能腫瘤新生抗原發(fā)現(xiàn)解決方案。期待各位同行，老師和同學們參與！
 

講座內(nèi)容：
 

一、PEAKS Online基于深度學習的DIA完整工作流

時間：2021年9月28日14:30-15:10

主講人：李文婷（高級應(yīng)用工程師）
 

二、AI賦能腫瘤新生抗原發(fā)現(xiàn)

時間：2021年9月28日15:10-15:50
 

主講人：單寶珍 博士，CEO & CSO
 

講座背景介紹：

基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)采集方式已從數(shù)據(jù)依賴性采集(DDA)走向數(shù)據(jù)非依賴性采集(DIA)，這主要是由于DIA可為用戶提供額外的豐富信息。然而，一直以來，DIA數(shù)據(jù)的處理分析仍然具有挑戰(zhàn)性。比如，搜索這些數(shù)據(jù)通常需要一個巨大的譜圖庫，而這個譜圖庫是由DDA模式下運行的高度分餾的樣本產(chǎn)生的，這實際上與DIA的目的是不相符的�；�于深度學習的譜圖預測模型的最新進展使得通過預測譜圖和保留時間來進行數(shù)據(jù)庫搜索成為可能，并且深度學習還可以對DIA數(shù)據(jù)進行多肽從頭測序，從而鑒定出ORFs以外的多肽。今年BSI開發(fā)推出了PEAKS Online的DIA全工作流，集成譜圖庫搜索、數(shù)據(jù)庫搜索及多肽從頭測序，實現(xiàn)可以對DIA和DDA數(shù)據(jù)進行準確全面分析的高通量處理。對多肽的鑒定和定量具有超高的靈敏度和準確度。以免疫多肽組分析為例，PEAKS Online 對免疫多肽組的DIA數(shù)據(jù)分析，僅僅在譜圖庫搜索的結(jié)果，HLA-bound peptide的鑒定結(jié)果比之前文獻報道的多約50-200%。并且，通過不同方法對HLA-bound peptide的結(jié)合基序分析，都表現(xiàn)出非常高的特異性。
 

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關(guān)于豆谷科技

上海豆谷信息科技有限公司是一家致力于為蛋白質(zhì)組學和抗體生物藥領(lǐng)域的科研工作者提供基于質(zhì)譜的數(shù)據(jù)分析軟件和服務(wù)整體解決方案的公司，是加拿大Bioinformatics Solutions Inc在中國的獨家代理，負責軟件全系列產(chǎn)品和服務(wù)的商務(wù)、銷售和技術(shù)工作，主要包括：PEAKS AB及抗體測序與表征服務(wù)，PEAKS Studio、PEAKS Online等

關(guān)于BSI

BSI是世界領(lǐng)先的生物信息軟件和服務(wù)公司，位于加拿大享有“硅谷”之稱的安大略省滑鐵盧市。BSI在質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域擁有多年的經(jīng)驗積累，為迅猛發(fā)展的基因組學，蛋白質(zhì)組學和生物技術(shù)行業(yè)提供了世界領(lǐng)先的算法和軟件解決方案及質(zhì)譜分析服務(wù)。旗下著名的PEAKS軟件平臺在全世界范圍內(nèi)擁有上千家學術(shù)和工業(yè)界用戶。2016年ASMS期間BSI又隆重推出的PEAKS AB軟件平臺更是一經(jīng)推出即獲得多家生物制藥公司的青睞。