SBC邀您參加2024空間多維組學(xué)創(chuàng)新轉(zhuǎn)化研討會

會議背景

空間多組學(xué)正在生物學(xué)各個領(lǐng)域中得到廣泛的應(yīng)用，多維度的整合不同類型的空間數(shù)據(jù)獲得具有價值的研究成果，在精準(zhǔn)醫(yī)療和藥物開發(fā)等領(lǐng)域取得創(chuàng)新轉(zhuǎn)化應(yīng)用，是空間多組學(xué)研究面臨的重大挑戰(zhàn)。作為一門新興的交叉科學(xué)，空間多組學(xué)的發(fā)展充滿無限可能，將為科學(xué)研究和醫(yī)療實(shí)踐帶來革命性的改變。通過持續(xù)的技術(shù)升級和跨學(xué)科創(chuàng)新合作，空間組學(xué)將在未來展現(xiàn)出更加輝煌的成就。

由上海生物芯片有限公司（生物芯片上海國家工程研究中心）、上海市生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會主辦，NanoString Technologies、因美納、上海達(dá)邁生物科技有限公司以及布魯克（北京）科技有限公司協(xié)辦的“2024空間多維組學(xué)創(chuàng)新轉(zhuǎn)化研討會”，將邀請國內(nèi)多位科學(xué)家、臨床專家和行業(yè)專家分享各自領(lǐng)域的空間多組學(xué)應(yīng)用及研究進(jìn)展，探討與推動醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的創(chuàng)新轉(zhuǎn)化。

時間地點(diǎn)
2024年4月12日（全天）
上海市浦東新區(qū)李冰路151號1號樓二樓報告廳

會議信息
主辦單位
上海生物芯片有限公司
（生物芯片上海國家工程研究中心）
上海市生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會
協(xié)辦單位
NanoString Technologies
因美納
上海達(dá)邁生物科技有限公司
布魯克（北京）科技有限公司
承辦單位
生物谷

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會議議程

1、08:45-09:00 會議簽到

2、09:00-09:05 歡迎辭

3、09:05-09:35 主題報告：生理病理下的空間細(xì)胞譜系研究
中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院 彭廣敦 研究員

4、09:35-10:05 主題報告：單細(xì)胞空間組學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)化研究
復(fù)旦大學(xué) 錢斌治 教授

5、10:05-10:35 主題報告：Decoding tumor microenvironments from spatially resolved transcriptomics data through AI models
東華大學(xué)人工智能研究院 左春滿 講師

6、10:35-11:05 主題報告：早發(fā)前列腺癌的遺傳和時空異質(zhì)性研究
南京醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院 杜牧龍 副教授

7、11:05-11:35 主題報告：METTL14 downregulation drives S100A4+ monocyte-derived macrophages via MyD88/NF-κB pathway to promote MAFLD progression
海軍軍醫(yī)大學(xué) 楊富 教授

8、11:35-12:05 主題報告：空間代謝組學(xué)與臨床研究：基于成像質(zhì)譜的多模式組織成像分析
中國科學(xué)院上海藥物研究所 劉佳 教授級高級工程師

9、12:05-12:20 主題報告：因美納技術(shù)助力多組學(xué)應(yīng)用研究
因美納 李鑫博士 售前技術(shù)專家

10、12:20-13:00 午餐

11、13:00-13:30 主題報告：單細(xì)胞蛋白組學(xué)和空間蛋白組學(xué)技術(shù)及應(yīng)用
上海交通大學(xué) 丁顯廷 教授

12、13:30-14:00 主題報告：DIA宏蛋白質(zhì)組技術(shù)及其在菌群研究中的應(yīng)用
復(fù)旦大學(xué) 喬亮 研究員

13、14:00-14:30 主題報告：深度學(xué)習(xí)驅(qū)動的單細(xì)胞技術(shù)在精準(zhǔn)診療中的應(yīng)用
復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院 郝潔 研究員

14、14:30-15:00 主題報告：脊髓瘢痕形成過程中的膠質(zhì)細(xì)胞的演化
南通大學(xué) 周松林 副研究員

15、15:00-15:30 主題報告：基于單細(xì)胞技術(shù)的腫瘤免疫治療研究
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院 莊光磊 研究員

16、15:30-15:40 茶歇

17、15:40-16:10 主題報告：單細(xì)胞DNA測序用于體液中單細(xì)胞良惡性的鑒定
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院 王卓 青年副研究員

18、16:10-16:40 主題報告：新一代空間組學(xué)與生物標(biāo)志物研究
上海生物芯片有限公司（生物芯片上海國家工程研究中心） 蔣敏 產(chǎn)品經(jīng)理

19、16:40-16:55 主題報告：超高靈敏度4D-質(zhì)譜引領(lǐng)空間蛋白質(zhì)組學(xué)研究（線上）
布魯克（北京）科技有限公司 杜瀟賢 蛋白組學(xué)應(yīng)用主管

20、16:55-17:25 主題報告：Optimizing CosMx Runs: Best Practices and Insights for Success（線上）
Ufuk Degirmenci
Head of spatial genomics department
LifeStrands Genomics

21、17:25-17:40 技術(shù)平臺介紹
NanoString Technologies 牛璐瑤 中國區(qū)市場經(jīng)理

22、17:40-17:50 互動抽獎、會議閉幕 

嘉賓介紹（按日程順序排序，持續(xù)更新中）
 
彭廣敦 研究員
中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院

研究工作聚焦于多能干細(xì)胞的時空動態(tài)細(xì)胞譜系以及轉(zhuǎn)化應(yīng)用，建立了新型單細(xì)胞譜系示蹤技術(shù)、自動化深度單細(xì)胞測序平臺、基于激光顯微切割的原位空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，以及結(jié)合微流控芯片的新型空間多組學(xué)技術(shù)；系統(tǒng)的繪制了小鼠著床后胚胎三個胚層建立過程以及器官發(fā)生階段的高分辨率時空動態(tài)分子圖譜，揭示多能干細(xì)胞的發(fā)育調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并提供多能干細(xì)胞細(xì)胞命運(yùn)的空間位置參考坐標(biāo)系；相關(guān)工作以通訊作者發(fā)表在Nature，Nature Methods, Nature Genetics，Nature Communications, Cell Reports等國際知名期刊。中國科學(xué)院A類戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)、廣東省自然科學(xué)杰出青年科學(xué)基金等項(xiàng)目主持人，中國發(fā)育生物學(xué)會副秘書長。

錢斌治 教授
復(fù)旦大學(xué)

曾任英國愛丁堡大學(xué)癌癥研究中心和生殖健康中心雙聘終身教授。長期專注于腫瘤轉(zhuǎn)移和免疫微環(huán)境的研究，闡明了巨噬細(xì)胞在癌癥轉(zhuǎn)移中的重要作用，并開創(chuàng)了轉(zhuǎn)移相關(guān)巨噬細(xì)胞的研究領(lǐng)域。目前已在Nature、Cell、Nature Review Immunology等知名國際期刊發(fā)表了近40篇高水平學(xué)術(shù)論文，總引用超14300次，累計(jì)影響因子334，其中8篇被web of science評為高被引文章。課題組在原有工作基礎(chǔ)上，負(fù)責(zé)搭建了具有國際先進(jìn)領(lǐng)先水平的復(fù)旦大學(xué)空間多組學(xué)測-算-控整合研究平臺，將采用標(biāo)準(zhǔn)化研究，數(shù)據(jù)驅(qū)動，AI整合算法，功能驗(yàn)證四位一體的研究方式促進(jìn)跨學(xué)科交叉融合，推動各相關(guān)研究領(lǐng)域的共同進(jìn)步。研究方向：空間組學(xué)；腫瘤免疫；腫瘤微環(huán)境；生物信息學(xué)。

左春滿 講師
東華大學(xué)人工智能研究院

東華大學(xué)人工智能研究院講師，碩士生導(dǎo)師，專注于設(shè)計(jì)人工智能和統(tǒng)計(jì)方法，集成多模態(tài)數(shù)據(jù)以解析疾病的時空異質(zhì)性，以及臨床應(yīng)用�，F(xiàn)主持國自然青年基金、上海市高層次青年人才計(jì)劃等項(xiàng)目。獲得2023年度上海市人工智能學(xué)會青年優(yōu)秀論文獎。目前是中國生物信息學(xué)會（籌）系統(tǒng)生物學(xué)和網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)專委會的委員。相關(guān)成果以第一或通訊作者身份發(fā)表在《Nature Communications》,《Journal of Hepatology》,《Cancer Letters》《Bioinformatics》等國際期刊上。師從徐鷹教授，于2018.12博士畢業(yè)于吉林大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院，在攻讀博士期間（2016.2-2018.7）作為聯(lián)合培養(yǎng)學(xué)生，在美國佐治亞大學(xué)從事計(jì)算系統(tǒng)生物學(xué)相關(guān)研究；師從陳洛南研究員，于2019.7-2021.8加入中國科學(xué)院分子細(xì)胞卓越創(chuàng)新中心從事博士后研究工作。此外，擔(dān)任多個國際期刊的審稿人。

杜牧龍 副教授
南京醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院

圍繞腫瘤、呼吸系統(tǒng)等復(fù)雜疾病的生物標(biāo)志物，從事“遺傳多組學(xué)理論與應(yīng)用”的交叉學(xué)科研究工作。獲江蘇省杰出青年基金，主持國自然面上和青年項(xiàng)目、江蘇省自然面上項(xiàng)目等。近五年來在Gastroenterology、Intensive Care Medicine（2021/2023）、Science Advances、Nucleic Acids Research（2020/2022）、Cancer Research（2022/2023a/2023b）、Cell Reports Medicine等期刊，以第一或通訊作者身份（含并列）發(fā)表科學(xué)論文三十余篇。授權(quán)國家發(fā)明專利4件和軟件著作權(quán)4件。入選江蘇省“333高層次人才培養(yǎng)工程”、江蘇省青年科技人才托舉工程。

楊富 教授
海軍軍醫(yī)大學(xué) 

現(xiàn)任海軍軍醫(yī)大學(xué)“遺傳學(xué)”國家重點(diǎn)學(xué)科、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室主任、教授。主要從事復(fù)雜性狀遺傳病的表觀遺傳學(xué)調(diào)控機(jī)制研究。獲教育部青年長江學(xué)者，上海市“青年拔尖人才”等人才項(xiàng)目資助。在Signal Transduction and Targeted Therapy, Molecular Cell、Journal of Hepatology、Experimental & Molecular Medicine的雜志發(fā)表研究論文40余篇，其中1篇論文被評為2018年度“中國百篇最具影響力國際學(xué)術(shù)論文”，2篇論文被F1000的專家推薦并評論，7篇SCI論文為ESI高被引論文�？偹�引用3500余次，最高單篇被他引642次。獲教育部自然科學(xué)獎一等獎（第2）等學(xué)術(shù)獎勵。

蔣敏 產(chǎn)品經(jīng)理
上海生物芯片有限公司（生物芯片上海國家工程研究中心）

2013年畢業(yè)于中國科學(xué)院大學(xué)，10余年高通量組學(xué)科研服務(wù)經(jīng)驗(yàn)。至今服務(wù)藥企、研發(fā)機(jī)構(gòu)等項(xiàng)目2000+，協(xié)助客戶發(fā)表文獻(xiàn)超過50篇。曾參與設(shè)計(jì)表達(dá)譜ceRNA芯片，基于外泌體的轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)產(chǎn)品開發(fā)，空間多組學(xué)產(chǎn)品開發(fā)等工作。特別擅長基因芯片，高通量二代測序，單細(xì)胞組學(xué)檢測，空間組學(xué)檢測等。

丁顯廷 教授
上海交通大學(xué)

博士生導(dǎo)師，上海交通大學(xué)國際合作與交流處副處長，個性化醫(yī)學(xué)研究院常務(wù)副院長，生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院分子與納米醫(yī)學(xué)平臺主任。國家“萬人計(jì)劃”科技創(chuàng)新領(lǐng)軍人才、國家基金委優(yōu)秀青年科學(xué)基金、求是基金會“求是杰出青年學(xué)者獎”、上海市“曙光計(jì)劃”學(xué)者。在Nature, PNAS, Advanced Materials, Science Advances, Genome Biology, Nature Communications等領(lǐng)域內(nèi)旗艦雜志發(fā)表論文150余篇；授權(quán)國內(nèi)外發(fā)明專利60余項(xiàng)。研究方向：個體化診療標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)與檢測、基于人工智能的藥物組合與優(yōu)化設(shè)計(jì)。

喬亮 研究員
復(fù)旦大學(xué)

復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系，研究員、博導(dǎo)。2015年入選國家級人才計(jì)劃青年項(xiàng)目，2020年獲批國家基金委優(yōu)秀青年科學(xué)基金項(xiàng)目。在PNAS、Nature Communications、Chem、JACS、Angew. Chem. Int. Ed.、Anal. Chem.等SCI期刊上發(fā)表論文150篇。授權(quán)發(fā)明專利13項(xiàng)。編著著作1部�，F(xiàn)任中國蛋白質(zhì)組學(xué)會委員、全國衛(wèi)生產(chǎn)業(yè)企業(yè)管理協(xié)會實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)（質(zhì)譜分析）專家委員會委員、中國儀器儀表學(xué)會分析儀器分會質(zhì)譜儀器專家組委員、上海市化學(xué)化工學(xué)會分析化學(xué)專業(yè)委員會委員、Applied Biochemistry and Biotechnology副主編、Chinese Chemical Letters編委、《質(zhì)譜學(xué)報》編委、《高等學(xué)�；瘜W(xué)學(xué)報》青年執(zhí)行編委、《分析測試學(xué)報》青年編委、VIEW青年編委等。

郝潔 研究員
復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院

復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院PI研究員，英國帝國理工大學(xué)榮譽(yù)研究員、上海市浦江人才。以第一作者和通訊作者在Nature Protocols, Cell Reports Methods, Briefings in Bioinformatics, Bioinformatics, Analytical Chemistry,Frontiers of medicine，NMR in Biomedicine等國際知名期刊上發(fā)表多篇高水平學(xué)術(shù)論文，google scholar他引超3100次。一篇文章歸入Clinical Medicine學(xué)術(shù)領(lǐng)域同一出版年最優(yōu)秀前1%, 并被web of science標(biāo)示為熱點(diǎn)論文和高被引論文。已授權(quán)發(fā)明專利4項(xiàng)（第一發(fā)明人）。2016年入選上海市浦江人才計(jì)劃。

周松林 副研究員
南通大學(xué)

蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)博士，南通大學(xué)神經(jīng)再生重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副研究員。長期從事中樞及外周神經(jīng)損傷與修復(fù)研究，發(fā)現(xiàn)了一系列調(diào)控中樞視神經(jīng)節(jié)細(xì)胞及外周背根神經(jīng)節(jié)神經(jīng)元內(nèi)在再生能力和軸突再生微環(huán)境表型調(diào)節(jié)的非編碼RNA和轉(zhuǎn)錄因子。近年來，以第一作者或通訊作者（含共同）多次在iScience、Neuron、Dev Cell、J Cell Sci、Exp Neurol、Neurosci Bull、Neurosci Res. 等神經(jīng)科學(xué)期刊發(fā)表論文。主持國家自然科學(xué)基金3項(xiàng)，曾獲江蘇省“青藍(lán)工程”優(yōu)秀青年教師，“六大高峰”C類人才項(xiàng)目。相關(guān)研究成果曾獲得2019年教育部高等學(xué)�？茖W(xué)研究優(yōu)秀成果獎（科學(xué)技術(shù))自然科學(xué)獎二等獎；2019 年江蘇省科技廳科學(xué)技術(shù)獎三等獎；2020 年華夏醫(yī)學(xué)科技獎一等獎。獲得澳大利亞專利二項(xiàng)，中國專利3項(xiàng)。

莊光磊 研究員
上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院

博士，研究員，博士生導(dǎo)師。現(xiàn)為上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院研究員，腫瘤系統(tǒng)醫(yī)學(xué)全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室課題組長，上海市婦科腫瘤重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任。研究方向?yàn)槟[瘤動態(tài)演進(jìn)與精準(zhǔn)化診療，致力于系統(tǒng)闡明惡性腫瘤的動態(tài)演進(jìn)規(guī)律，揭示新的診治策略，推動臨床轉(zhuǎn)化研究。獲得上海市東方學(xué)者，上海市青年科技啟明星，國家優(yōu)青，上海市衛(wèi)生健康行業(yè)青年五四獎?wù)�，中華醫(yī)學(xué)科技獎二等獎（第二完成人）。擔(dān)任中國生理學(xué)會基質(zhì)生物學(xué)委員會委員，已發(fā)表SCI論文80余篇，取得授權(quán)專利10余項(xiàng)。

王卓 青年副研究員
復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院

2018年在上海交通大學(xué)獲博士學(xué)位；2018-2021年在復(fù)旦大學(xué)開展博士后研究工作，入選2018年上海市“超級”博士后激勵計(jì)劃。自2021年起，在復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院任青年副研究員。一直從事單細(xì)胞測序技術(shù)開發(fā)及其在液體活檢分析中的應(yīng)用。根據(jù)腫瘤細(xì)胞基因組不穩(wěn)定的特征提出了體液中游離單細(xì)胞良惡性鑒定的定量分子算法。基于腫瘤細(xì)胞能量代謝特征，應(yīng)用單細(xì)胞測序技術(shù)開發(fā)了一系列腫瘤患者血液、胸腹水、尿液、腦脊液等體液中游離腫瘤細(xì)胞檢測技術(shù)。以第一（含共一）作者發(fā)表5篇學(xué)術(shù)論文。主持科研項(xiàng)目3項(xiàng)，獲授權(quán)中國發(fā)明專利2項(xiàng)，美國發(fā)明專利1項(xiàng)。

劉佳 教授級高級工程師
中國科學(xué)院上海藥物研究所

主要從事基于創(chuàng)新質(zhì)譜的藥物代謝和代謝組學(xué)研究。包括分析方法開發(fā)、藥物代謝和機(jī)制研究、成藥性評價、內(nèi)源性代謝物在疾病進(jìn)展和藥物干預(yù)中的機(jī)制研究；在Nat Commun，Gut Microbes，Acta Pharmacol Sin，Anal Chem和Anal Chim Acta等期刊，以通訊作者或第一作者發(fā)表SCI論文19篇。完成先導(dǎo)化合物成藥性評價5000余項(xiàng)，臨床前藥物體外代謝和藥物相互作用研究100余項(xiàng)，創(chuàng)新藥物臨床前PKPD研究3項(xiàng)，創(chuàng)新藥物系統(tǒng)臨床前藥動學(xué)和藥物代謝研究4項(xiàng)，創(chuàng)新藥物臨床藥動學(xué)研究6項(xiàng)（其中2個新藥已獲批上市）。

李鑫 博士，因美納售前技術(shù)專家
因美納

遺傳學(xué)博士，畢業(yè)于上海交通大學(xué)Bio-X研究院。曾就職于Thermofisher, Agena Bioscience等公司，負(fù)責(zé)基因分析產(chǎn)品線的應(yīng)用方案開發(fā)與市場推廣。

杜瀟賢 蛋白組學(xué)應(yīng)用主管
布魯克（北京）科技有限公司

現(xiàn)任布魯克公司蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用主管。畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)化學(xué)系，從事基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究，具有豐富的組學(xué)實(shí)驗(yàn)，質(zhì)譜和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)。2019年加入布魯克公司，主要負(fù)責(zé)基于timsTOF 系列質(zhì)譜的蛋白組學(xué)技術(shù)支持和推廣。

Ufuk Degirmenci 
Head of spatial genomics department
LifeStrands Genomics

牛璐瑤 中國區(qū)市場經(jīng)理
NanoString technology

2017-2021年曾就職于Illumina，負(fù)責(zé)NGS和Microarray基因組學(xué)技術(shù)在各科研領(lǐng)域中的應(yīng)用推廣和技術(shù)支持。2021年至今，任職NanoString Technologies中國市場部經(jīng)理，主要負(fù)責(zé)NanoString技術(shù)在腫瘤、神經(jīng)科學(xué)等各類轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的市場推廣和拓展合作。

參展咨詢

胡老師：021-51320288-分機(jī)號8156
聯(lián)系郵箱：xiaohong_hu@shbiochip.com

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