伯豪單細(xì)胞Flex年中巨惠，1.1W/樣本活動(dòng)價(jià)即將截止
單細(xì)胞Flex
年中巨惠來(lái)襲
活動(dòng)時(shí)間：即日起至2024年8月31日
巨惠價(jià)
1.1W/樣本
含抽核，上機(jī)，建庫(kù)，測(cè)序50G及Cell Ranger矩陣
年中巨惠來(lái)襲
活動(dòng)時(shí)間：即日起至2024年8月31日
巨惠價(jià)
1.1W/樣本
含抽核，上機(jī)，建庫(kù)，測(cè)序50G及Cell Ranger矩陣
活動(dòng)說(shuō)明：
1.活動(dòng)時(shí)間為合同簽訂時(shí)間；
2.2024年10月31日前有到款；
3.4~9個(gè)樣本，基礎(chǔ)分析1000元/樣本；≥10個(gè)樣本，基礎(chǔ)分析500元/樣本；
4.活動(dòng)最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。
1.活動(dòng)時(shí)間為合同簽訂時(shí)間；
2.2024年10月31日前有到款；
3.4~9個(gè)樣本，基礎(chǔ)分析1000元/樣本；≥10個(gè)樣本，基礎(chǔ)分析500元/樣本；
4.活動(dòng)最終解釋權(quán)歸伯豪生物所有。
10X Genomics及伯豪生物均實(shí)驗(yàn)過(guò)許多組織類(lèi)型：肺癌、前列腺癌、鼻咽癌腦轉(zhuǎn)移、肺轉(zhuǎn)移、肝癌、腸道、結(jié)直腸癌、肺癌淋巴結(jié)、子宮內(nèi)膜癌、胃癌、食管鱗癌、胃癌腦轉(zhuǎn)移、頸部淋巴結(jié)，黑色素瘤，卵巢癌，腎等。伯豪生物已完成數(shù)百例樣本，如圖所示FFPE居多，此外有細(xì)胞固定冰凍樣本。不同組織類(lèi)型的基因中位數(shù)有所差別，項(xiàng)目開(kāi)展前您可與伯豪生物科研顧問(wèn)聯(lián)系溝通了解白名單樣本以及其他樣本的更多信息。
1 Flex應(yīng)用樣本
• FFPE樣本，醫(yī)院病理科大量存檔樣本，進(jìn)行回顧性研究。
• 某些傳染類(lèi)疾病樣本，由于運(yùn)輸和實(shí)驗(yàn)條件限制不便于取新鮮樣本，可固定后送樣檢測(cè)。（附：細(xì)胞/核固定操作流程）
• 準(zhǔn)確獲取樣本瞬時(shí)基因表達(dá)譜“微量”變化，實(shí)驗(yàn)處理/藥物治療的不同時(shí)間及不同發(fā)育時(shí)間組等。新鮮組織解離過(guò)程容易誘導(dǎo)應(yīng)激基因的表達(dá)，或隨著處理時(shí)間的延長(zhǎng)而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜發(fā)生變化，引起細(xì)胞轉(zhuǎn)錄模式發(fā)生“人為改變”。尤其對(duì)于一些解離時(shí)間較長(zhǎng)和基因表達(dá)變化迅速的組織。
• 與FFPE空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合，極大開(kāi)拓了FFPE樣本的利用空間。
• 某些新鮮或冰凍樣本質(zhì)檢結(jié)果差，無(wú)法滿足常規(guī)實(shí)驗(yàn)要求的樣本。
2 Flex亮點(diǎn)
• 探針捕獲更靈敏，分析數(shù)千個(gè)至數(shù)十萬(wàn)個(gè)細(xì)胞或細(xì)胞核的基因表達(dá)，捕獲人類(lèi)或小鼠全轉(zhuǎn)錄組，可檢測(cè)低表達(dá)基因。
• 兼容不同樣本類(lèi)型，將單細(xì)胞分析擴(kuò)展到臨床試驗(yàn)或其他轉(zhuǎn)化研究所使用的FFPE組織并附帶針對(duì)不同樣本類(lèi)型而優(yōu)化的示范方案，包括細(xì)胞系、原代細(xì)胞以及含有脆弱細(xì)胞的解離組織。
• 鎖定細(xì)胞瞬時(shí)狀態(tài)，準(zhǔn)確獲取樣本瞬時(shí)基因表達(dá)譜“微量”變化。
• 細(xì)胞捕獲率高達(dá)65% ，多細(xì)胞（multiplets）比例低，每1,000個(gè)細(xì)胞僅為0.8%，滿負(fù)荷上樣時(shí)每個(gè)樣本的多細(xì)胞比例不超過(guò)8%。
• 減少批次效應(yīng)，在不折損數(shù)據(jù)質(zhì)量的情況下保存樣本，實(shí)現(xiàn)在同一次運(yùn)行中批量分析樣本，并最大限度減少實(shí)驗(yàn)可變性。
3 送樣建議
• 優(yōu)先寄送蠟塊，要求被包埋組織體積>0.5cm3，蠟塊密封后4度避光保存和運(yùn)輸。如不方便提供蠟塊，可切石蠟卷寄送。
• 石蠟卷要求：25μm或50μm厚度石蠟切片3卷以上，蠟卷被包埋組織橫截面積＞0.3cm2，現(xiàn)切現(xiàn)用（4度最多保存一周），厚度不可小于25μm，石蠟卷置于1.5ml EP管內(nèi)，密封后4度避光保存和運(yùn)輸，保證石蠟卷完整不破碎。石蠟卷如破碎較為嚴(yán)重，說(shuō)明樣本脆性較大，會(huì)影響樣本質(zhì)量。注：某些組織類(lèi)型由于同等體積下細(xì)胞數(shù)量較少，可能需要提供更多蠟卷，例如穿刺樣本、脂肪組織、肺癌、心肌等。
• FFPE保存年限：無(wú)明確年限要求，10X已測(cè)試1-11年FFPE，已有文獻(xiàn)表明相對(duì)于保存時(shí)間，固定時(shí)間對(duì)RNA質(zhì)量影響更大（Trinks A，2024）。
• 石蠟樣本后續(xù)需經(jīng)過(guò)DV200質(zhì)控，DV200≥30%的樣本繼續(xù)進(jìn)行細(xì)胞核解離操作，細(xì)胞核產(chǎn)量需≥30萬(wàn)，背景干凈雜質(zhì)少，核膜完整度>80%，結(jié)團(tuán)率<10%；合格樣本，可繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)。
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