10x Genomics 邀您免費注冊單細胞數(shù)據(jù)分析研討會

 
歡迎您參與我們的現(xiàn)場數(shù)據(jù)分析研討會！這個活動會面向 10x Genomics 單細胞和空間的用戶，包括數(shù)據(jù)分析的互動。請您攜帶自己的筆記本電腦。

10月10日｜9:30am - 3:00pm
 

• 從原始數(shù)據(jù)預處理、sample demultiplexing、doublet removal和其他QC、批次校正和數(shù)據(jù)整合、自動細胞注釋，到多樣本差異基因分析。
• 首先我們將了解 10x cellranger 如何處理原始測序數(shù)據(jù)。
• 在后續(xù)的下游分析中，我們將使用多個10x和第三方開發(fā)的工具/軟件，并熟悉他們的分析算法。
• 經(jīng)過這些分析步驟后，我們可以找到與 COVID-19 嚴重程度相關的細胞類型特異性基因特征。

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②Visium HD數(shù)據(jù)分析研討會：識別腫瘤微環(huán)境中不同的巨噬細胞亞群
10月11日｜9:30am - 4:20pm
 

 
Visium HD 提供單細胞scale的空間轉(zhuǎn)錄組學分析。本次研討會將涵蓋多方面對 Visium HD 進行深入數(shù)據(jù)分析。

• 首先我們將了解 Space Ranger 如何處理HD圖像和測序數(shù)據(jù)。
• 而后，我們將了解如何評估HD數(shù)據(jù)質(zhì)量以及使用Loupe Browser進行HD數(shù)據(jù)可視化。
• 我們還將使用第三方工具進行以下 HD 分析：

1. 使用 Seurat 進行 HD 8μm bin 數(shù)據(jù)進行下游分析；
2. HD 8μm bin數(shù)據(jù)與單細胞數(shù)據(jù)的整合；
3. 對HD數(shù)據(jù)進行H&E圖像細胞核分割，并將分割得到的細胞核數(shù)據(jù)與單細胞數(shù)據(jù)進行整合。多方面的HD數(shù)據(jù)分析揭示了人類結腸癌組織不同區(qū)域的不同巨噬細胞亞群。
 

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講者信息

 

關于怡美通德

北京怡美通德科技發(fā)展有限公司是10x Genomics的官方授權代理商，代理美國10x Genomics公司生產(chǎn)的Chromium單細胞測序建庫系列產(chǎn)品、Visium空間轉(zhuǎn)錄組系列產(chǎn)品以及Xenium組織空間原位分析系統(tǒng)，提供儀器配套的試劑耗材供貨、產(chǎn)品演示實驗、產(chǎn)品安裝、使用培訓以及售前售后技術咨詢、生物信息學分析等相關技術服務。

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