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數(shù)字PCR:中山大學(xué)科學(xué)家發(fā)現(xiàn)可作為食管鱗癌早期檢測(cè)生物標(biāo)志物

瀏覽次數(shù):2035 發(fā)布日期:2019-11-29  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
食管鱗狀細(xì)胞癌
食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC,簡(jiǎn)稱食管鱗癌)在我國(guó)占食管癌的90%以上。食管癌是發(fā)病率較高的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率在全球范圍內(nèi)居惡性腫瘤第8位,在我國(guó)大陸居各類腫瘤第5位,其死亡率在全球范圍居惡性腫瘤第6位,在我國(guó)大陸居第4位。(源自:中國(guó)早期食管鱗狀細(xì)胞癌及癌前病變篩查與診治共識(shí),2015年,北京)。
環(huán)狀核糖核酸
環(huán)狀核糖核酸即circRNA(Circular RNAs)是一類不具有5’末端帽子和3’末端poly(A)尾巴、并以共價(jià)鍵形成環(huán)形結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子。目前發(fā)現(xiàn)的circRNAs主要來(lái)源于基因外顯子exon,但還有其他類型,比如來(lái)源于內(nèi)含子intron,基因間intergenic,反義鏈antisense,重疊區(qū)sense overlapping。
作為一類新型的非編碼核糖核酸,circRNA由于反式剪切,大量存在于真核細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中(定位于細(xì)胞質(zhì)是miRNA海綿機(jī)制研究的充分必要條件),少部分內(nèi)含子來(lái)源的circRNA存在于核酸內(nèi),具有一定的組織特異性、時(shí)序和疾病特異性,非常適合做分子標(biāo)志物,故此近年來(lái)在人類癌癥研究中,引起了人們的廣泛關(guān)注,但是circRNA在食管鱗狀細(xì)胞癌中的作用(ESCC)仍不清楚。
近日中山大學(xué)附屬孫逸仙醫(yī)院廣東省惡性腫瘤表觀遺傳學(xué)和基因調(diào)控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,在由BioMed Central出版社發(fā)行的英國(guó)Molecular Cancer雜志上發(fā)表“circGSK3β promotes metastasis in esophageal squamous cell carcinoma by augmenting β-catenin signaling”。這項(xiàng)研究旨在識(shí)別調(diào)節(jié)ESCC進(jìn)程中新的circRNA,并探索其在ESCC的調(diào)節(jié)機(jī)制和臨床意義。該雜志影響因子10.679。(詳情請(qǐng)見(jiàn)文末)

文獻(xiàn)內(nèi)容
該研究得出結(jié)論:
circGSK3β對(duì)于ESCC轉(zhuǎn)移有重要的促進(jìn)作用,有可能成為ESCC的治療新靶點(diǎn)。同時(shí)血漿中circGSK3β水平有可能作為ESCC一種新的診斷和預(yù)后指標(biāo)檢測(cè)的生物標(biāo)志物。
方法:
使用微陣列方法篩選ESCC和臨近正常組織之間表達(dá)有差異的circRNA。在體外和體內(nèi)研究特定的差異表達(dá)的circRNA (circGSK3β)對(duì)腫瘤進(jìn)展的影響。
使用數(shù)字PCR方法對(duì)ESCC患者、良性病變患者和健康對(duì)照組血漿樣本中circGSK3β分析,并對(duì)血漿樣本中circGSK3β與ESCC檢出率進(jìn)行相關(guān)性研究。
結(jié)果:
證明circGSK3β的表達(dá)上調(diào)與晚期ESCC患者的臨床分期和不良預(yù)后呈正相關(guān)。同時(shí)進(jìn)一步揭示了circGSK3β通過(guò)與GSK3β的直接相互作用和抑制GSK3β活性對(duì)ESCC細(xì)胞的遷移和侵潤(rùn)有促進(jìn)作用,展現(xiàn)一種circRNA在癌癥進(jìn)展中的新作用機(jī)制。
更重要的發(fā)現(xiàn)是,血漿中circGSK3β的表達(dá)可作為ESCC和ESCC早期檢測(cè)生物標(biāo)志物,AUC分別為0.782和0.793。
文中描述的血漿中circGSK3β水平,使用數(shù)字PCR進(jìn)行檢測(cè),方法描述如下所示:
可復(fù)制此鏈接地址進(jìn)行全文下載:
https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-019-1095-y
Naica數(shù)字PCR平臺(tái)
法國(guó)Stilla Technologies Naica數(shù)字PCR平臺(tái)是實(shí)現(xiàn)DNA/RNA絕對(duì)定量的技術(shù)工具,自動(dòng)生成和組裝單層平鋪的微滴,進(jìn)行單分子PCR擴(kuò)增,通過(guò)高分辨率的三色熒光通道檢測(cè),自動(dòng)QC質(zhì)控,識(shí)別三色熒光中有效的陰陽(yáng)性微滴,從而達(dá)到目的DNA/RNA的絕對(duì)定量檢測(cè)。同時(shí)提供原始數(shù)據(jù)、單微滴追溯等功能,確保數(shù)據(jù)真實(shí)可靠。
◐ 只需一步加樣操作,無(wú)需標(biāo)準(zhǔn)品和標(biāo)準(zhǔn)曲線是真正的絕對(duì)定量系統(tǒng)。通過(guò)對(duì)模板的有限稀釋,耐受抑制劑能力強(qiáng),更有利于臨床、環(huán)境等復(fù)雜樣本的檢測(cè)。
◐ 有效微滴數(shù)~30000/樣本,實(shí)現(xiàn)低濃度、低豐度的核酸樣本進(jìn)行準(zhǔn)確定量。
◐ 閉式芯片設(shè)計(jì),樣本間獨(dú)立,避免了加樣交叉污染風(fēng)險(xiǎn),同時(shí)防止擴(kuò)增后的氣溶膠污染,保證結(jié)果安全可靠和實(shí)驗(yàn)環(huán)境安全。
北京深藍(lán)云生物科技有限公司承擔(dān)法國(guó)Stilla Technologies公司中國(guó)技術(shù)示范與服務(wù)中心職能,致力于為用戶提供新型生命科學(xué)研究?jī)x器和分析產(chǎn)品以及優(yōu)化的整體解決方案。
期刊介紹
Molecular Cancer雜志主要接收靶向治療、分子與細(xì)胞生物學(xué)、基因組學(xué)、遺傳學(xué)、病理與腫瘤免疫學(xué)等領(lǐng)域相關(guān)的學(xué)術(shù)論文。
在230本腫瘤學(xué)學(xué)SCI期刊中,Molecular Cancer雜志的SCI影響因子排名前11位。據(jù)WOS檢索結(jié)果:Molecular Cancer在2017-2018年共發(fā)表357篇論文,已在2019年被引用4221次(2019.11.1),2017-2018年發(fā)表的論著、綜述文章為351篇,即時(shí)影響因子為4221/351=12.026分。
 
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