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Sapphire與生命活動(dòng)大事件-錯(cuò)配修復(fù)

瀏覽次數(shù):1590 發(fā)布日期:2019-12-20  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
【導(dǎo)讀】
錯(cuò)配修復(fù)(mismatch repair,MMR):在含有錯(cuò)配堿基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式;主要用來(lái)糾正DNA雙螺旋上錯(cuò)配的堿基對(duì)。錯(cuò)配修復(fù)的過(guò)程需要區(qū)分母鏈和子鏈,做到只切除子鏈上錯(cuò)誤的核苷酸,而不會(huì)切除母鏈上本來(lái)就正常的核苷酸,屬于復(fù)制時(shí)修復(fù)。

【背景知識(shí)】
原核生物比如大腸桿菌的錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)是由Mut基因編碼的Mut S,Mut H和Mut L蛋白構(gòu)成,其中Mut S和Mut L會(huì)形成四聚體Mut SL,在DNA上滑動(dòng),如果遇到堿基對(duì)錯(cuò)配引起的隆起,就會(huì)停留,開(kāi)始把兩邊的DNA雙鏈拉扯,成環(huán),直到識(shí)別到GATC序列,如果A的N6發(fā)生甲基化,說(shuō)明是母鏈,不切除,而如果GATC的A沒(méi)有甲基化,說(shuō)明是子鏈,Mut H就會(huì)結(jié)合在Mut SL上。Mut H有核酸內(nèi)切酶活性,在GATC序列的5’端,也就是G的左邊切開(kāi),再由DNase I發(fā)揮外切酶活性,把Mut SL四聚體擰出的環(huán)全部切除,再由DNA POL III和DNA連接酶重新填補(bǔ)。
歷史重構(gòu)研究指出大腸桿菌使用EcMutS,EcMutL,EcMutH,EcUvrD,EcSSB和四個(gè)ssDNA核酸外切酶之一來(lái)實(shí)現(xiàn)切除。最近,中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所有了新的發(fā)現(xiàn)。
研究指出,最近的單分子圖像揭示了EcMutS和EcMutL在錯(cuò)配的DNA上形成了級(jí)聯(lián)的滑動(dòng)夾,共同協(xié)助EcMutH在遠(yuǎn)程的新復(fù)制的GATC位點(diǎn)引入ssDNA斷裂。研究人員已經(jīng)成功可視化了完整的鏈特異性切除過(guò)程,并發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)壽命的EcMutL滑動(dòng)夾在ssDNA斷裂附近捕獲了EcUvrD解旋酶,從而顯著提高了其解鏈能力。在這一過(guò)程中,EcSSB調(diào)節(jié)EcMutL-EcUvrD解旋,并且這一過(guò)程很少伴隨著廣泛的ssDNA外切酶消化。這一結(jié)果與一種依賴于EcMut- EcUvrD解旋酶驅(qū)動(dòng)的ssDNA片段在鄰近EcMut-GATC切口之間的移位,并且與外切酶無(wú)關(guān)的MMR鏈切除機(jī)制一致。
在這一研究中,科研人員通過(guò)美國(guó)Azure公司的SapphireTM雙模式多光譜激光成像系統(tǒng)對(duì)核酸外切酶的活性進(jìn)行了研究。
對(duì)于大多數(shù)成像系統(tǒng)、需要在應(yīng)用的靈活性和圖像質(zhì)量之間做選擇。作為新一代實(shí)驗(yàn)室成像平臺(tái) ,SapphireTM Biomolecular Imager是新一代激光掃描成像系統(tǒng),兩者兼顧,具有無(wú)與倫比的靈活性、出色的靈敏度和圖像質(zhì)量。無(wú)論使用哪種應(yīng)用,SapphireTM Biomolecular Imager和SapphireTM 采集軟件都能夠提供高質(zhì)量的數(shù)據(jù)。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì):
◐ 多達(dá)四個(gè)固態(tài)激光器(488nm,520nm,658nm或685nm可選,785nm),提供極高的激發(fā)靈敏度。
◐ 藍(lán)光檢測(cè)和磷屏成像用PMT,近紅外熒光檢測(cè)使用APDs,可見(jiàn)光和化學(xué)發(fā)光用CCD 。
◐ 超寬動(dòng)態(tài)范圍,同時(shí)成像和定量低豐度和高豐度樣品 。
◐ 圖像分辨率可達(dá)10微米,實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量圖像分析 。
◐ Sapphire Capture和AzureSpot軟件,實(shí)現(xiàn)完美的成像和準(zhǔn)確的分析。
 
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