大樣本數(shù)據(jù)共享視角下對新冠病毒論文的理解

2020 年 2 月 9 日，中國工程院院士、新型冠狀病毒肺炎疫情聯(lián)防聯(lián)控工作機(jī)制科研攻關(guān)專家組組長鐘南山院士團(tuán)隊(duì)、李蘭娟院士團(tuán)隊(duì)、武漢市金銀潭醫(yī)院、武漢市中心醫(yī)院、黃岡市主要醫(yī)院、浙江大學(xué)附屬第一醫(yī)院、香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)與治療學(xué)系等一線臨床醫(yī)院和研究機(jī)構(gòu)聯(lián)合在預(yù)印本平臺 medRxiv 發(fā)表了題為Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China 的文章。研究匯總了全國 31 個(gè)省市，共 552 家醫(yī)院的 NCP 患者病例資料，納入了從發(fā)病到 1 月 29 號共計(jì) 1099 例確診的 2019-nCoV 感染 NCP 患者。（文章地址https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.06.20020974v1.full.pdf）

一線的研究數(shù)據(jù)、高水平的研究團(tuán)隊(duì)、大規(guī)模的共享樣本數(shù)據(jù)分析、及時(shí)的信息披露等等，無論從哪個(gè)角度來看，這篇論文都具有極高的科研價(jià)值。本篇論文得出以下結(jié)論：潛伏期最長可達(dá) 24 天，尿液、糞便中都能找到新型冠狀病毒，初診時(shí)僅有 43.8% 的病人有發(fā)熱癥狀……

(文字來源：http://www.raincent.com/content-10-14382-1.html)

 

 

通過對鐘院士文章的理解，我們可以發(fā)現(xiàn)在本次研究過程中，大樣本數(shù)據(jù)共享和建立數(shù)據(jù)集在進(jìn)行疫情精準(zhǔn)防控分析中起到重要作用。樣本數(shù)據(jù)共享的價(jià)值在于：通過不同機(jī)構(gòu)之間進(jìn)行樣本數(shù)據(jù)共享，集中形成大樣本數(shù)據(jù)。對大樣本數(shù)據(jù)從不同維度進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘，發(fā)現(xiàn)新冠病毒的統(tǒng)計(jì)性信息特點(diǎn)，為公眾提供完整、連續(xù)、準(zhǔn)確、及時(shí)的防疫策略，為醫(yī)護(hù)人員提供追溯疾病源頭的方法，為決策者提供傳染病發(fā)展的有效數(shù)據(jù)和依據(jù)。

 

本論文為回顧性研究，為什么要做回顧性研究？分析可以分為以下兩點(diǎn)：①單一機(jī)構(gòu)樣本數(shù)據(jù)量不足，不能支撐研究需要，所以幾家單位聯(lián)合研究；②無可用數(shù)據(jù)集，導(dǎo)致數(shù)據(jù)分析緩慢，結(jié)果難匯總�；�于以上兩點(diǎn)，做了回顧性研究。當(dāng)然，如果有一個(gè)平臺，能夠?qū)崿F(xiàn)數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)共享，那么研究者還可以進(jìn)行大樣本數(shù)據(jù)的階段性實(shí)時(shí)研究，為疫情防控工作提供指導(dǎo)。

 

（來源：科技部官方網(wǎng)站）

 

日前，科技部也做出了明確指示：要求科技人員大力弘揚(yáng)科學(xué)家精神，樹立大局觀念，增強(qiáng)社會責(zé)任感，以“功成不必在我”的胸襟，發(fā)揮集智攻關(guān)、團(tuán)結(jié)協(xié)作的優(yōu)良傳統(tǒng)，加強(qiáng)有關(guān)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、臨床病例、流行病學(xué)統(tǒng)計(jì)等數(shù)據(jù)、成果的開放共享，共同做好防控新型冠狀病毒肺炎的科技應(yīng)對工作。

 

2019年9月4日，中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)分會-2019（CTS2019）在湖北武漢召開，鐘南山院士在全體大會上做了《大數(shù)據(jù)視角下的呼吸疾病防控》的報(bào)告。

 

2020年1月29日的新聞發(fā)布會上，世界衛(wèi)生組織傳染病流行病學(xué)家Maria Van Kerkhove也表示：“共享病毒至關(guān)重要�！�

 

2020年2月5日，《自然》雜志在評論欄目發(fā)表官方聲明，呼吁全球的研究者們聯(lián)合起來，將與疫情相關(guān)的所有數(shù)據(jù)和研究成果及時(shí)公開，并承諾將發(fā)表的相關(guān)研究立即與世界衛(wèi)生組織共享。

 

既然大樣本的數(shù)據(jù)共享對科研價(jià)值如此之大，大樣本數(shù)據(jù)共享平臺也就顯得尤為重要。作為生物樣本庫行業(yè)耕耘已久且青島市首家科創(chuàng)板上市的物聯(lián)網(wǎng)生物科技公司，海爾生物醫(yī)療生物樣本庫團(tuán)隊(duì)，結(jié)合近十余年來全國700余座生物樣本庫建設(shè)運(yùn)營的實(shí)際經(jīng)驗(yàn)，為解決各生物樣本庫“信息孤島”的行業(yè)痛點(diǎn)，結(jié)合科研工作者的實(shí)際需求，迭代了BIMS系統(tǒng)（海爾生物樣本信息管理系統(tǒng)），同時(shí)基于區(qū)塊鏈技術(shù)，采用數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)、智能合約保障的模式，打造了具有五大特色的“生物樣本信息共享生態(tài)服務(wù)平臺”（以下簡稱“平臺”，官方網(wǎng)址http://ubiobank.haierbiomedical.com/#/home）：

 

 

一、平臺通過區(qū)塊鏈技術(shù)強(qiáng)化數(shù)據(jù)校驗(yàn)，避免低效數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)共享。例如，平臺通過不同技術(shù)手段對樣本共享數(shù)據(jù)進(jìn)行多方數(shù)據(jù)校驗(yàn)，從樣本源上切實(shí)保障數(shù)據(jù)質(zhì)量，為后續(xù)的數(shù)據(jù)流轉(zhuǎn)應(yīng)用奠定良好基礎(chǔ)；

二、平臺利用區(qū)塊鏈技術(shù)，切實(shí)加強(qiáng)數(shù)據(jù)安全和質(zhì)量保護(hù)，提升保護(hù)樣本源隱私，加強(qiáng)安全規(guī)范。堅(jiān)守兩個(gè)原則：“脫敏原則”，發(fā)布內(nèi)容要“經(jīng)過特殊算法處理，脫敏私密信息”，“非必要不公開原則”；

三、平臺打破樣本數(shù)據(jù)“孤島”，高效運(yùn)轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)，加強(qiáng)合作機(jī)構(gòu)之間交流互動(dòng)，加速數(shù)據(jù)整合，提升科研產(chǎn)出效率；

四、平臺擁有樣本、數(shù)據(jù)、物流、檢驗(yàn)等多種服務(wù)資源，面向醫(yī)療、生物、制藥、科研、醫(yī)學(xué)教育等領(lǐng)域的用戶，提供項(xiàng)目合作及生態(tài)服務(wù)（樣本存儲、樣本轉(zhuǎn)運(yùn)、樣本檢測、設(shè)備租賃、科研項(xiàng)目合作等），在科學(xué)研究、技術(shù)轉(zhuǎn)化和成果應(yīng)用領(lǐng)域提供完整的線上線下支持，打造生物科研領(lǐng)域的生態(tài)體系。

五、平臺提供上億份級樣本資源供廣大科研工作者檢索，整合國內(nèi)樣本庫資源，提供精準(zhǔn)檢索服務(wù)，為科研合作方搭建快速合作橋梁，發(fā)揮生物樣本資源的科研價(jià)值、社會價(jià)值。

 

另外還有科研資訊專欄、明星生物樣本庫展示、權(quán)威專家直播、行業(yè)通知公告、技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)展示等功能；平臺線下定期舉辦科研學(xué)術(shù)沙龍活動(dòng)，共同探討生物樣本科研應(yīng)用新方向，加強(qiáng)科學(xué)家之間的合作交流。

 

面對這場席卷全國疫情風(fēng)暴，平臺將強(qiáng)化跨單位、跨學(xué)科的樣本數(shù)據(jù)共享，提升樣本數(shù)據(jù)資源的整合效率，加快樣本數(shù)據(jù)集成分析的速度，形成數(shù)據(jù)、模型及數(shù)據(jù)集三維一體化，切實(shí)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)共享、科研共享、成果共享，為科研加油提速，為人類大健康貢獻(xiàn)力量。

 

附1：共享平臺官網(wǎng)注冊地址：http://ubiobank.haierbiomedical.com/#/home

附2：APP下載：應(yīng)用商店搜索“樣本管家”

附3：公眾號二維碼

 

附4：BIMS及樣本庫示例