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新冠病毒研究用水系列三:如何獲得完美的核酸電泳條帶

瀏覽次數(shù):3277 發(fā)布日期:2020-5-12  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
在新冠病毒2019-nCoV的分子生物學(xué)研究中,電泳技術(shù)是一個(gè)重要的方法,主要用于核酸、蛋白質(zhì)的分離與鑒定,使用的實(shí)驗(yàn)儀器主要是電泳儀。本文,樂(lè)楓純水為大家總結(jié)了實(shí)驗(yàn)中常出現(xiàn)的問(wèn)題和解決方法。
 
核酸電泳用水方案

什么是核酸電泳?
核酸電泳是基因操作的核心技術(shù)之一,用于分離、鑒定DNA、RNA 分子混合物和純化DNA片段。
核酸電泳最讓大家頭疼的問(wèn)題 - 異常條帶
核酸電泳實(shí)驗(yàn)中,常常會(huì)遇到條帶模糊、拖尾、扭曲等現(xiàn)象,究其原因,除了操作不當(dāng),電泳條件未優(yōu)化,電泳緩沖液也是重要的影響因素之一。電泳緩沖液的組成及其離子強(qiáng)度影響DNA的電泳遷移率。
核酸電泳用水方案
 
  • 緩沖液離子強(qiáng)度低,電導(dǎo)率小,導(dǎo)致DNA遷移緩慢;如果多次使用,離子強(qiáng)度降低,PH值上升,緩沖能力減弱,從而影響電泳效果。
  • 緩沖液離子強(qiáng)度高,則電導(dǎo)率高并明顯產(chǎn)熱,嚴(yán)重時(shí)會(huì)引起凝膠熔化或DNA變性。
 
表1 核酸電泳條帶異常原因匯總及建議的解決方法
 
常見(jiàn)問(wèn)題 原因 解決方法
條帶模糊 核酸降解 使用不含核酸酶的超純水配置緩沖液
電泳緩沖液陳舊 建議經(jīng)常更換緩沖液
有蛋白污染 使用低有機(jī)物的超純水配置緩沖液
核酸變性 使用超純水或者緩沖液稀釋樣品
條帶黯淡 核酸濃度過(guò)低 增加上樣量
核酸降解  使用不含核酸酶的超純水配置緩沖液
條帶被示蹤染料掩蓋 提高上樣量;避免使用與目的片段遷移率相同的示蹤染料 
拖帶或涂抹帶 PCR體系或PCR程序不合適 優(yōu)化PCR體系和PCR程序
條帶扭曲 配膠的緩沖液和電泳緩沖液不同 配膠和電泳中使用同一批緩沖液
電泳時(shí)電壓過(guò)高 控制電泳時(shí)電壓不超過(guò)6V/CM
 

核酸電泳用純水要求
為了防止水中雜質(zhì)(如:核酸酶、蛋白質(zhì)、離子等)對(duì)電泳結(jié)果的影響,核酸電泳實(shí)驗(yàn)配置緩沖溶液或稀釋樣品需要使用超純水:
  • 電阻率 18.2 MΩ·cm
  • TOC < 10 ppb
  • 無(wú)核酸酶和蛋白酶
  • 細(xì)菌總數(shù)< 1 CFU/mL
  • 熱原< 0.005 EU/mL
  • 0.22μm 或更低的顆粒過(guò)濾


核酸電泳用純水機(jī)推薦 

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廣州某疾控中心安裝的Genie G
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以自來(lái)水為進(jìn)水產(chǎn)EDI純水和超純水 
荷蘭安裝的Genie U
以自來(lái)水為進(jìn)水產(chǎn)RO純水和超純水


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  • 配備RephiBio 終端過(guò)濾器,可有效去除水中的熱原(內(nèi)毒素)、核酸酶、細(xì)菌等雜質(zhì),滿(mǎn)足核酸電泳實(shí)驗(yàn)用水要求。


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