樣本收集手冊之植物類樣本的收集方法及注意事項

各位老師、同學(xué)，大家好。今天將要分享的是我們樣本收集手冊的第五彈——植物類代謝組學(xué)樣本收集參考步驟。本次，我們將詳細(xì)介紹植物類樣本（葉片、莖、花、根、果實、種子）的收樣方法及注意事項。做植物代謝方向的老師可千萬不要錯過。話不多說，我們干貨奉上。
 

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1.葉片、莖、花

 

• 樣品量要求：

GC-MS，LC-MS 實驗：200mg/sample。

頂空 GC-MS 實驗：2g/sample。

 

• 樣本收集步驟：

取整片葉片/一段莖/一朵花，用錫箔紙包裹并標(biāo)記后，迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。取出后迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。迅速放入-80℃冰箱凍存。足量干冰寄送。

 

• 注意事項：

1. 采集葉片樣本時，最好在中午光照好的時間收集。

2. 要根據(jù)實驗設(shè)計，采集樣本時保持樣本一致性，尤其是同一組樣本（顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等）。

3. 由于錫箔紙上 marker 筆標(biāo)記容易模糊，所以需要在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明。

 

2.根

 

• 樣品量要求：

GC-MS，LC-MS 實驗：500mg/sample。

頂空 GC-MS 實驗：3g/sample。

 

• 樣本收集步驟：

1. 取整株植物的根部，迅速用 1×PBS 漂洗掉根上的泥土。

2. 根據(jù)具體實驗設(shè)計取植株根特定的部位，500 mg/sample 裝入離心管中。

3. 標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

4. -80 度凍存；足量干冰寄送。

 

• 注意事項：

1. PBS 漂洗時間要盡快。

2. 由于根部組織特別脆弱，被擠壓后會變成漿糊狀，所以推薦保存至離心管中，而不是錫箔紙包裹。

 

3.果實、種子

 

• 樣品量要求：

GC-MS，LC-MS 實驗：200~500mg/sample。

頂空 GC-MS 實驗：3g/sample。

 

• 樣本收集步驟：

1. 對于含多汁、塊頭較大的果實（番茄、西瓜、蘋果等）需要先用鋒利的刀分割成“均勻”合適的小塊（≈200 mg/sample）分裝至 2mL 離心管中，標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

 

2. 對于細(xì)小的顆粒種子（擬南芥種子、谷物種子等），可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝（≈200 mg/sample）至 1.5mL 離心管中。標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

 

3. 對于要求對整個果實進(jìn)行提取的（整粒葡萄等），需要把果實裝在 50mL 離心管中/自封袋中，標(biāo)號后（同時放入自封袋中標(biāo)簽紙，注明樣本信息）迅速放入液氮中冷凍處理至少 15min。

 

• 注意事項：

對多汁的果實進(jìn)行取樣很難保持均一性（如番茄，皮、果肉、果瓤、籽的占比）， 強烈建議將整個果實進(jìn)行研磨、凍干，對粉末進(jìn)行稱重分裝。
 

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