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Octet®非標記分子互作技術應用:國內新發(fā)表高水平文章解析

瀏覽次數:1466 發(fā)布日期:2022-4-11  來源:賽多利斯
隨著國內科研水平的提高以及先進技術的使用,國內發(fā)表的諸如CNS高水平文章也越來越多,基于生物層干涉(BLI)技術的Octet®分子互作由于具有簡單、快速、結果準確的優(yōu)點,且具有廣泛的應用方向。

僅2022年第一季度,Octet®國內CNS文章就達到了5篇!涉及各種高通量、粗樣品的動力學和競爭實驗,也和我們身邊新冠疫苗和治療手段息息相關。今天,陳老濕就來介紹一下這幾篇文章。

🔺科興滅活疫苗加強針可提升對奧密克戎感染的重癥保護[1]

從多名三劑新冠疫苗接種者的新冠特異性記憶B淋巴細胞中成功獲得323株全人源抗體,用Octet® RED384檢測發(fā)現(xiàn)這些抗體都與野生型的新冠病毒S蛋白高親和力結合,其中24株對奧密克戎等突變株均有比較強的抑制活性。這表明三劑疫苗免疫后,約7%的記憶B淋巴細胞攜有廣譜性中和抗體。從中選取了幾株活性最高的廣譜性抗體(比如編號347,265抗體),并對其與S蛋白的復合物進行了結構解析,發(fā)現(xiàn)了奧密克戎的抗體逃逸表位G446S。
 
將帶His標簽的S蛋白固化在NTA傳感器上,分別與347和265抗體結合,發(fā)現(xiàn)347和265結合不同的表位(Octet® RED384)。

🔺可霧化吸入的廣譜抗新冠全人源納米雙抗藥/復旦大學[2]

復旦大學應天雷組研發(fā)了一種治療新冠的廣譜雙特異性全人源納米抗體Bn03,該抗體由該課題組之前發(fā)現(xiàn)的兩個靶向病毒S蛋白的保守表位的納米抗體n3113v和n3130v重組而成,能夠高效中和包括奧密克戎在內的各種流行變異株。同時,因分子量比較小可作為霧化吸入制劑,在新冠輕癥和重癥小鼠模型中顯現(xiàn)出很好的療效。論文還發(fā)現(xiàn)了一類隱藏在病毒刺突蛋白三聚體內部的高度保守表位,對廣譜疫苗和藥物的研發(fā)具有啟示作用。
Bn03可以高親和力地結合目前已知多種新冠毒株
 

接種疫苗后血清RBM(受體結合結構域)抗體和非RBM抗體測試:將RBD結合在NTA傳感器上,直接與血清結合的BLI信號Xt為所有RBD抗體,先結合ACE2再結合血清信號為Xm的是非RBM抗體,RBM抗體為Xt-Xm。發(fā)現(xiàn)非RBM抗體與奧密克戎的結合活性密切相關。


應老師組是第一個發(fā)現(xiàn)新冠抗體的課題組,請點這里。

🔺西湖大學發(fā)現(xiàn)艱難梭菌毒素入侵人體的新受體[3]

艱難梭菌是一種厭氧的革蘭氏陽性細菌,會導致抗生素相關性腹瀉和偽膜性腸炎等疾病,其中一個分支會分泌TcdB2,TcdB4毒素。目前,這些毒素在小腸上皮的受體并不明確。西湖大學陶亮組用CRISPR/Cas9的基因敲除文庫篩選技術發(fā)現(xiàn)了組織因子途徑抑制因子(TFPI)是這些毒素的受體。并解析了TFPI/ TcdB4復合物結構。用Octet®檢測了兩者之間的親和力,同時動力學實驗表明,TcdB4與FXa均可與TFPI的同一loop結合,相互之間是競爭關系。這與前人的研究以及結構學是完全一致的。這項研究對于揭示和理解艱難梭菌感染的致病機制,并且為超毒力分支菌株引起的艱難梭菌的感染預防和治療新方法的開發(fā)提供了重要的理論依據。
 

用Octet® RED96e和Anti-human Fc傳感器固化Fc融合TFPI,與TcdB4結合的親和力(KD值)達到nM級別。
 
Octet®固定TFPI,先結合TcdB4后,F(xiàn)Xa的結合信號顯著下降(左圖)。反過來亦是如此(右圖)。即FXa與TcdB4相互阻斷。
 
另外兩篇文章,主要檢測奧密克戎S蛋白和人受體ACE2以及中和抗體的親和力,BLI數據質量良好,與前面文章類似,就不做一一介紹了[4][5]

Octet®分子互作分析系統(tǒng)的優(yōu)勢在于:
  • 非標記Direct binding是趨勢,結果更準確;
  • 快速測定親和力,更加定量化地表征分子互作;
  • 無洗滌步驟,可測弱親和力(解離快);
  • 寫入了美國藥典,文章多,認可度廣;
  • 萬金油技術,可以用與檢測DNA,小分子,蛋白質等各種生物分子,比如這篇文章檢測的就是病毒顆粒樣品;
  • 操作簡便,耗材及維護成本低。

作為成熟的分析方法,Octet®已協(xié)助包括新冠疫苗在內的多種疫苗的研究和開發(fā),應用于多個關鍵環(huán)節(jié),包括表位設計、識別及特征分析,病原體多樣性和分布,抗體親和力測定,宿主免疫反應特征、多樣性和分布,核酸和分子病原體-宿主相互作用研究,以及治療藥物及臨床研究等。了解更多基于Octet®的疫苗研發(fā)策略,觀看講座:

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基于非標記分子互作技術的高效疫苗研發(fā)策略

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來源:德國賽多利斯集團
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