芯片點(diǎn)樣儀在植物多糖組分研究中的應(yīng)用
瀏覽次數(shù):1107 發(fā)布日期:2022-12-21
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ArrayJet芯片點(diǎn)樣儀推動植物多糖組分研究
蘆薈凝膠是一類全球流行的日化、醫(yī)用產(chǎn)品,可修復(fù)皮膚劃傷、淡化疤痕、消炎抗菌等,其功效源于蘆薈含有的天然生物活性多糖。據(jù)統(tǒng)計(jì),25%的蘆薈屬植物應(yīng)用于傳統(tǒng)醫(yī)學(xué),表明蘆薈中的生物活性多糖成分可能在整個蘆薈屬中普遍存在。然而多糖的復(fù)雜性給開發(fā)蘆薈產(chǎn)品,以及建立相關(guān)的分析方法帶來了極大挑戰(zhàn)。近些年,糖芯片微陣列檢測可作為一種分析多糖成分的有效方法。本研究的目的,則是使用糖芯片微陣列對兩種藥用蘆薈和兩種非藥用蘆薈隨季節(jié)變化的多糖組成進(jìn)行研究,從而對商業(yè)種植獲取不同種類蘆薈多糖優(yōu)化的收獲時間提供建議。
該文章發(fā)表于Frontiers in Plant Science雜志,研究者對4種蘆薈屬植物進(jìn)行多糖成分研究。植物生長在玻璃容器中,取樣時均已成熟,其生長條件模擬野外環(huán)境,包括日照變化和土壤水分含量等。如(表1):
蘆薈樣本獲取于2017年6月26日至2018年6月25日,每月采集3次。為了降低酚類化合物污染的風(fēng)險,作者僅收集了蘆薈內(nèi)部的葉肉用于制備糖微陣列芯片,樣本取出后立即放置在帶有標(biāo)簽的EP管中,并在液氮中快速進(jìn)行低溫冷凍,冷凍后在-20℃下保存24小時,隨后干燥并稱重,用玻璃珠在組織裂解液中研磨,最后提取,操作步驟如圖1:
提取分三步進(jìn)行,首先根據(jù)每個樣品的重量計(jì)算萃取劑體積,萃取比例10mg樣品加300μL萃取劑。使用溶劑如下:
1.dH2O提取可溶性或未結(jié)合以及松散結(jié)合的多糖,主要是甘露糖;
2.50mM CDTA主要提取果膠和半纖維素;
3.4mM NaOH主要提取半纖維素。
提取后,樣品以4000RPM離心10 min,然后取上清液,轉(zhuǎn)移到已標(biāo)記的EP管中。每個樣品用Arrayjet緩沖液(55.2%甘油,44%水,0.8% Triton X-100)進(jìn)行稀釋,隨后加入384孔板中,并以3000RPM離心10 min,使用英國ArrayJet公司的生物芯片點(diǎn)樣儀將樣品點(diǎn)印在硝化纖維素包被的玻片上。使用15個可以與果膠和半纖維素多糖結(jié)合的單克隆抗體作為一抗進(jìn)行孵育,二抗選擇鼠來源的堿性磷酸酶與一抗進(jìn)行結(jié)合。
統(tǒng)計(jì)結(jié)果如圖2:橫列為15種與不同多糖結(jié)合的一抗以及陰性對照,縱列為四種蘆薈植物在不同季節(jié)的分類,數(shù)值為二抗結(jié)合信號的平均值。
結(jié)果發(fā)現(xiàn)不同種屬的蘆薈屬植物在不同季節(jié)多糖表達(dá)有明顯的差異,而糖芯片檢測有可能作為一種直接靶向相關(guān)多糖存在和研究多糖組成的篩選方法。
原文鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.00512/full
ArrayJet位于英國愛丁堡,專注于提供生物芯片應(yīng)用領(lǐng)域的解決方案及服務(wù)。自2000年公司成立即致力于開發(fā)新型生物樣品噴點(diǎn)方案–噴墨式液體處理平臺,該系統(tǒng)于2006年上市,目前用戶遍布全球27個國家。
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