文獻(xiàn)解讀：非病變性狼瘡皮膚有助于骨髓細(xì)胞炎癥進(jìn)展并引發(fā)皮膚炎癥

研究結(jié)果
1. CLE患者的皮損病灶和非皮損皮膚組織進(jìn)行scRNA-seq發(fā)現(xiàn)皮膚細(xì)胞群和免疫細(xì)胞群占比差異
一共28個樣本進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，最終捕獲檢測46,540個細(xì)胞，平均基因數(shù)為2,618 個/細(xì)胞，平均轉(zhuǎn)錄本數(shù)為11,645個/細(xì)胞，分組包括：皮損病灶（lesional，L）、非皮損皮膚組織（nonlesional，N）和健康對照皮膚（healthy，H）。一共注釋10種主要細(xì)胞類型，包括角質(zhì)化細(xì)胞（keratinocytes，KCs）和髓系細(xì)胞，都顯著在CLE患者皮膚中的聚集。細(xì)胞組成分析顯示，與H組對比，L組和N組中髓系細(xì)胞的比例都有所增加。
 

3. scRNA-seq發(fā)現(xiàn)在CLE患者中富集的成纖維細(xì)胞亞型且該細(xì)胞群表現(xiàn)出強烈的干擾素反應(yīng)特征
基于分組對比，發(fā)現(xiàn)只有成纖維細(xì)胞（fibroblast，F(xiàn)B）中的亞簇4在狼瘡患者中占主體。根據(jù)已報道的皮膚FB標(biāo)記基因，對成纖維細(xì)胞亞簇進(jìn)行歸類注釋，分別為：分泌型卷曲相關(guān)蛋白2 （SFRP2）⁺ 、XI膠原型α1鏈 （COL11A1）⁺ 、分泌型卷曲相關(guān)蛋白4 （SFRP4）⁺ FB，除此外還有高表達(dá) COL26A1 和RAMP1（受體活性修飾蛋白，（RAMP1）⁺ FBs）的細(xì)胞群。同樣針對FBs亞群其細(xì)胞因子模式進(jìn)行分析，并通過小提琴圖展示，結(jié)果顯示IFN-FBs中特異性表達(dá)IFN-α和IFN-γ，且這種顯著的干擾素基因改變僅在CLE患者皮膚特定的亞簇中出現(xiàn)。
 

5. CLE患者的皮損病灶和非皮損皮膚組織中髓系細(xì)胞亞群的主要變化
本文還評估了髓系細(xì)胞，作為皮膚中另一種主要的免疫細(xì)胞。通過亞簇聚類和注釋，鑒定了9個具有顯著不同標(biāo)記基因的髓系細(xì)胞亞群。健康對照皮膚和狼瘡患者皮膚進(jìn)行對比，CD16⁺ DCs是差異顯著的細(xì)胞群之一。與健康皮膚相比，CLE患者的非皮損組織和皮損病灶組織中CD16⁺ DC豐度占比更顯著。在健康對照皮膚中（H組），cDC2Bs占髓系細(xì)胞的近一半（47%）；這與CLE患者非皮損組織有很大不同，N組中pDCs占主導(dǎo)地位（41%）。相對于cDC2Bs，CD16⁺ DC在Toll樣受體刺激下也表現(xiàn)出分泌炎性細(xì)胞因子的能力增強。因此，狼瘡患者D16⁺ DC的擴(kuò)增和功能增強可能促進(jìn)發(fā)病機(jī)制。
 

6. 配體-受體分析顯示紅斑狼瘡患者中預(yù)測細(xì)胞相互作用主要涉及 CD16⁺ DC
在鑒定了細(xì)胞群體后，本文使用了CellPhoneDB分析性患者皮膚中細(xì)胞間通訊。所有組織包括：健康對照（H組），非皮損組織（N組）和皮損病灶（L組）均進(jìn)行了配體受體討論。在H組中，有比較少的配受體對，其中最強的是KCs-KCs配受體對。相比之下，N組表現(xiàn)出更多的相互作用，F(xiàn)Bs是主要的配體表達(dá)細(xì)胞類型，髓系細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞（endothelial cells，EC）也具有高度的相互作用。L組中髓系細(xì)胞和EC在相互作用中最為突出。

初步結(jié)果可發(fā)現(xiàn)N組中有比較密集的相互作用，因此選取N組構(gòu)建了網(wǎng)絡(luò)圖進(jìn)一步分析。KCs基底狀亞群表達(dá)的配體和內(nèi)皮細(xì)胞受體關(guān)聯(lián)，這表明KCs可能涉及免疫細(xì)胞浸潤組織的機(jī)制。IFN-FBs是所有細(xì)胞亞群中活性最高的。然而，無論是配體還是受體CD16⁺ DC都有最多的配受體對，CD16⁺ DC顯示富集出很多的相互作用，涉及IFN-FBs、T_ph/T_fh細(xì)胞和cDC2B細(xì)胞。pDCs相對惰性，很少參與L-R對，這與最近文獻(xiàn)報道稱SLE皮膚中pDCs衰老表型的結(jié)論一致。
 

7. 空間轉(zhuǎn)錄組測序和scRNA-seq整合分析提供在患者皮膚中細(xì)胞互作的的空間架構(gòu)
本文通過空間轉(zhuǎn)錄組檢測到632個spots（檢測位點），每個spot平均檢測出3704個基因和10176個轉(zhuǎn)錄本。大多數(shù)在表皮下和毛囊周圍區(qū)域spots具有高的免疫細(xì)胞特征。FBs亞群IFN-FB顯示顯著定位在真皮淺層。朗格漢斯細(xì)胞（Langerhans cells，LC）特征的spots僅分布在表皮和毛囊上皮。pCDs得分高的spots主要分布在毛囊周圍真皮中。CD16⁺ DC得分高的spots在真皮淺層最密集。結(jié)合以上結(jié)果，再次表明濾泡間上皮的基底狀KCs形成富含IFN皮膚的環(huán)境可以調(diào)節(jié)這些

CD16⁺ DC。