Plant Phenomics | 基于自制番茄葉片病害的圖像分割方法研究
番茄現(xiàn)在已經(jīng)在全世界各地被廣泛種植,但在其生長過程中不可避免地會產(chǎn)生各種病蟲害。除了番茄果實(shí)上的病害,番茄葉片上的病害對番茄而言同樣也是一種威脅。若是防治不及時(shí),將會導(dǎo)致減產(chǎn)甚至絕收。人們早先通過經(jīng)驗(yàn)主觀地判斷番茄病害所屬類型。但是這樣的方法分辨能力有限,不能準(zhǔn)確地識別且耗時(shí)耗力。圖像處理技術(shù)經(jīng)過長期發(fā)展,已經(jīng)被廣泛的應(yīng)用在各個(gè)方面,并且農(nóng)業(yè)領(lǐng)域也漸漸興起。但是,隨著農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化發(fā)展朝著智能化方向不斷推進(jìn),傳統(tǒng)的圖像識別方法將無法應(yīng)對復(fù)雜的現(xiàn)實(shí)情況。隨著計(jì)算機(jī)硬件設(shè)備性能的提升,將深度學(xué)習(xí)應(yīng)用到農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中是未來農(nóng)業(yè)的發(fā)展趨勢。深度學(xué)習(xí)通過引入卷積層、池化層、全連接層等操作,自動提取圖像特征,使得植物葉片病害識別有了突破性進(jìn)展?焖、準(zhǔn)確地識別番茄葉片病害并采取相應(yīng)的防治措施,對保障作物生產(chǎn)、提高農(nóng)民收入具有重要意義。
圖番茄葉片病害特征展示(在圖A中,由于光照,標(biāo)記點(diǎn)邊緣細(xì)節(jié)模糊;在圖B中,標(biāo)記部分的疾病較小)
2023年4月,Plant Phenomics在線發(fā)表了中南林業(yè)科技大學(xué)、國防科學(xué)技術(shù)大學(xué)、愛達(dá)荷州大學(xué)、湖南省植物保護(hù)研究所題為 An effective image-based tomato leaf disease segmentation method using MC-UNet的研究論文。
圖MC-UNet結(jié)構(gòu)圖(A表示MC-UNet整體結(jié)構(gòu),B表示多尺度卷積模塊,C表示跨層注意力融合機(jī)制)
本研究基于UNet結(jié)構(gòu),提出一種采用MC-UNet的番茄葉片病害圖像分割方法。針對葉片邊緣模糊問題,設(shè)計(jì)了一種多尺度卷積結(jié)構(gòu)。首先應(yīng)用了多個(gè)卷積核來捕獲番茄葉片不同尺度的空間信息,后續(xù)的SE Module結(jié)構(gòu)加強(qiáng)了網(wǎng)絡(luò)對病害部分的感知能力以及病害邊緣的表達(dá)能力。針對葉片微小病害的問題,提出了一種跨層注意力融合機(jī)制。在網(wǎng)絡(luò)的各層上引入門控結(jié)構(gòu),門控結(jié)構(gòu)可以突出不同尺寸的病害區(qū)域。將門控結(jié)果融合輸出,以此綜合各層的病害特征信息。在自制的番茄葉片病害分割數(shù)據(jù)集上,我們將MC-UNet與現(xiàn)有的分割網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行對比,模型在參數(shù)量為6.67M的情況下達(dá)到了91.32%的準(zhǔn)確率。
該研究由中南林業(yè)科技大學(xué)、國防科學(xué)技術(shù)大學(xué)、愛達(dá)荷州大學(xué)、湖南省植物保護(hù)研究所完成。中南林業(yè)科技大學(xué)鄧榆寶為該文第一作者,周國雄為該文通訊作者。相關(guān)工作得到長沙市自然科學(xué)基金、國家自然科學(xué)基金等資助。
周國雄 教授
論文鏈接:
https://doi.org/10.34133/plantphenomics.0049
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About Plant Phenomics
《植物表型組學(xué)》(Plant Phenomics)是由南京農(nóng)業(yè)大學(xué)和美國科學(xué)促進(jìn)會(AAAS)合作創(chuàng)辦的英文學(xué)術(shù)期刊,于2019年1月正式上線發(fā)行。采用開放獲取形式,刊載植物表型組學(xué)交叉學(xué)科熱點(diǎn)領(lǐng)域具有突破性科研進(jìn)展的原創(chuàng)性研究論文、綜述、數(shù)據(jù)集和觀點(diǎn)。具體范圍涵蓋高通量表型分析的最新技術(shù),基于圖像分析和機(jī)器學(xué)習(xí)的表型分析研究,提取表型信息的新算法,作物栽培、植物育種和農(nóng)業(yè)實(shí)踐中的表型組學(xué)新應(yīng)用,與植物表型相結(jié)合的分子生物學(xué)、植物生理學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、作物模型和其他組學(xué)研究,表型組學(xué)相關(guān)的植物生物學(xué)等。期刊已被DOAJ、Scopus、PMC、EI和SCIE等數(shù)據(jù)庫收錄?祁Nò睯CR2022影響因子為6.5,位于農(nóng)藝學(xué)、植物科學(xué)、遙感一區(qū)。中科院農(nóng)藝學(xué)、植物科學(xué)一區(qū),遙感二區(qū),生物大類一區(qū)(TOP期刊)。2020年入選中國科技期刊卓越行動計(jì)劃高起點(diǎn)新刊項(xiàng)目。
說明:本文由《植物表型組學(xué)》編輯部負(fù)責(zé)組稿。
中文內(nèi)容僅供參考,一切內(nèi)容以英文原版為準(zhǔn)。
特邀作者:周國雄
排版:張婕(南京農(nóng)業(yè)大學(xué))
審核:孔敏、王平