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mRNA 疫苗從設(shè)計(jì)到使用的全過(guò)程詳解

瀏覽次數(shù):619 發(fā)布日期:2024-1-29  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
2023 年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)被授予 Katalin Karikó 和 Drew Weissman ,以表彰他們?cè)诤塑諌A基修飾方面的發(fā)現(xiàn),這些發(fā)現(xiàn)促使開(kāi)發(fā)出有效的 mRNA 疫苗來(lái)對(duì)抗 COVID-19。

今天就讓我們一起來(lái)了解 mRNA 疫苗從設(shè)計(jì)到使用的全過(guò)程吧~

 

mRNA 疫苗是在體外轉(zhuǎn)錄好的一段編碼抗原蛋白的完整 mRNA,包含 5 部分:① 5’ 帽子結(jié)構(gòu),② 5’ 非編碼區(qū) (untranslated region, UTR),③ 一個(gè)編碼抗原的開(kāi)放閱讀框(open reading frame, ORF), ④ 3’ 非編碼區(qū),⑤ 3’ poly (A) 尾 (圖 1)[1]。



 Tips:

(1) 5’ 帽子結(jié)構(gòu)包含一個(gè) 7-甲基鳥(niǎo)苷 (m7G),通過(guò)三磷酸橋連接到 mRNA 的5’端。5’ 端第一個(gè)或第二個(gè)核苷酸在核糖的 2’ 羥基上被甲基化 (2’ - O- methylation),這阻止了 RNA 被細(xì)胞識(shí)別,從而阻止了非預(yù)期的免疫反應(yīng)。此外,5’ 帽子結(jié)構(gòu)在空間上保護(hù) mRNA 不被外切酶降解。

(2) 在 3’ 端,poly(A) 尾的長(zhǎng)度間接調(diào)控 mRNA 的翻譯和半衰期。一個(gè)足夠長(zhǎng)的尾巴 (100-150 bp) 是與 poly (A) 結(jié)合蛋白相互作用所必需的。poly (A) 結(jié)合蛋白和翻譯起始因子形成復(fù)合物招募核糖體啟動(dòng)翻譯,并且保護(hù)帽子結(jié)構(gòu)免受降解酶。

(3) 編碼區(qū)側(cè)翼的 5’ UTR 和 3’ UTR 調(diào)控 mRNA 翻譯、半衰期和亞細(xì)胞定位。開(kāi)放閱讀框包含翻譯成蛋白質(zhì)的編碼序列,可以通過(guò)將很少使用的密碼子替換為編碼相同氨基酸殘基的更頻繁出現(xiàn)的密碼子來(lái)優(yōu)化,從而在不改變蛋白質(zhì)序列的情況下增加翻譯量。例如, CureVac AG 公司在新冠疫苗 CVnCoV 用 G 或 C 代替 A 或 U(人類 mRNA 密碼子很少在第三位有 A 或 U)。

圖 1. 將無(wú)細(xì)胞生產(chǎn)的體外轉(zhuǎn)錄 mRNA 制成脂質(zhì)納米顆粒疫苗[1]。 

A.體外轉(zhuǎn)錄 mRNA 的結(jié)構(gòu)示意圖。B. 制備 mRNA 疫苗的過(guò)程。(1) 病原體基因組測(cè)序完成后,設(shè)計(jì)目標(biāo)抗原的序列并插入到質(zhì)粒中。(2) 在體外通過(guò)噬菌體聚合酶將質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄為 mRNA。(3) 通過(guò)高效液相色譜 (HPLC) 純化 mRNA以去除污染物和反應(yīng)物。(4) 將純化好的 mRNA 與脂質(zhì)在微流控混合器中速混合,形成脂質(zhì)納米顆粒。(5) 將納米顆粒溶液透析或過(guò)濾以除去非水溶劑和任何未封裝的 mRNA。(6) 將過(guò)濾后的 mRNA 疫苗溶液保存在滅菌的瓶中。


mRNA 疫苗不需要復(fù)雜的細(xì)胞培養(yǎng)體系和表達(dá)純化體系,可在實(shí)驗(yàn)室直接合成,因而可以實(shí)現(xiàn)快速大規(guī)模生產(chǎn)。這些優(yōu)勢(shì)使得 mRNA 疫苗在 COVID-19 疫情防控中發(fā)揮著重要作用。

但 mRNA 不穩(wěn)定且難以遞送,而且,體外產(chǎn)生的 mRNA 會(huì)引起炎癥反應(yīng)。然而,在兩個(gè)關(guān)鍵技術(shù)上的突破使得 mRNA 疫苗技術(shù)高歌猛進(jìn)。

  脂質(zhì)納米遞送系統(tǒng)
裸的 mRNA 在體液中容易被核酸酶迅速降解,難以在靶組織中積累。此外,免疫系統(tǒng)也能夠識(shí)別并降解外源性的核酸引發(fā)免疫反應(yīng)[2]。所以 mRNA 的安全高效遞送對(duì)于 mRNA 疫苗的推廣使用十分重要。脂質(zhì)納米顆粒可保護(hù)核酸不被降解,最大限度地向靶細(xì)胞遞送,并減少核酸對(duì)脫靶細(xì)胞的暴露。

基于脂質(zhì)的納米顆粒是臨床上最先進(jìn)的 mRNA 遞送載體。截至 2021 年 6 月,所有正在開(kāi)發(fā)或批準(zhǔn)用于臨床的 SARS-CoV-2 mRNA 疫苗均采用脂質(zhì)納米顆粒(LNP)。

圖 2. 脂質(zhì)納米顆粒及組成[1]。 

除了 RNA 藥物之外,LNP 通常還包括四種成分:可電離脂質(zhì) (如 DLin-MC3-DMA)、膽固醇 (如 DSPC)、輔助磷脂和聚乙二醇化脂質(zhì) (如 ALC-0159),它們一起封裝并保護(hù)脆弱的 mRNA 核心。

  核苷修飾

Katalin Karikó 和 Drew Weissman 發(fā)現(xiàn)樹(shù)突狀細(xì)胞和 TLR 表達(dá)的細(xì)胞可被細(xì)菌和線粒體 RNA 有效激活,但不能被哺乳動(dòng)物總 RNA(其中含有豐富的修飾核苷)激活[3]。因此,他們假設(shè)核苷修飾抑制了 RNA 的免疫作用。通過(guò)使用含有修飾核苷的 RNA 刺激樹(shù)突狀細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)修飾的核苷確實(shí)可以阻止 TLR 受體的識(shí)別,特別是修飾的尿苷,誘導(dǎo)的 TNF-α 的表達(dá)量顯著降低[3]。

Moderna 和輝瑞-公司的新冠疫苗基于這一結(jié)論開(kāi)發(fā)出含有修飾核苷的 mRNA 疫苗。并且這兩款新冠疫苗都在 III 期臨床試驗(yàn)中產(chǎn)生了 >94% 的療效。

圖 3. Katalin Karikó 和 Drew Weissman 對(duì) RNA 核苷修飾的研究[3][4]。

左圖: RNA 轉(zhuǎn)染樹(shù)突狀細(xì)胞誘導(dǎo)表達(dá)TNF-α[3]: a. 化學(xué)合成 (ORN1-4) 或體外轉(zhuǎn)錄 (ORN5-6) 的寡核苷酸序列轉(zhuǎn)染人樹(shù)突狀細(xì)胞; b-c. ELISA 或 Northern blot 檢測(cè) TNF-α 表達(dá)量。
右圖: Ψ 修飾的 mRNA 具有更高的翻譯能力[4]: a. 體外轉(zhuǎn)錄的含有或不含Ψ修飾的 capTEVlucA50 用 poly (A) 聚合酶延長(zhǎng)了 3 '端 poly (A) 尾 (+An), 用于動(dòng)物研究的 mRNA 用星號(hào)表示; b-d. 尾靜脈注射含有或不含 Ψ 修飾的 mRNA (capTEVluc-An) 脂質(zhì)體。處死動(dòng)物后, (b-c) 對(duì)各組織進(jìn)行熒光素酶活性測(cè)定; (d) 并用 Northern blot 檢測(cè) luciferase 和 TNF-α; e-f. 尾靜脈注射含有或不含 Ψ 修飾的 mRNA (capTEVluc-An) 或 pCMVluc 質(zhì)粒脂質(zhì)體。處死動(dòng)物后,(e) 進(jìn)行熒光素酶活性測(cè)定,(F) 用 ELISA 檢測(cè)血清中 TNF-α 的含量。


在后續(xù)研究中,Katalin Karikó 和 Drew Weissman 還證明了相比未修飾的  mRNA,修飾后的 mRNA 在實(shí)驗(yàn)小鼠體內(nèi)具有更高的翻譯能力,可以顯著增加蛋白合成[4]。


至此 mRNA 臨床應(yīng)用中的關(guān)鍵障礙被突破。諾貝爾委員會(huì)也正是基于 Katalin Karikó 和 Drew Weissman 這些開(kāi)創(chuàng)性的發(fā)現(xiàn)將今年的諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)授予他們。

 

目前在臨床前試驗(yàn)和臨床使用中的大多數(shù) mRNA 疫苗都是通過(guò)向皮膚、肌肉或皮下間隙內(nèi)注射,在那里它們被免疫或非免疫細(xì)胞吸收并轉(zhuǎn)化為抗原,向 T 細(xì)胞和 B 細(xì)胞展示,具體過(guò)程如下:
(1) 注射的 mRNA 疫苗被抗原提呈細(xì)胞內(nèi)吞。
(2) mRNA 脫離內(nèi)涵體進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)后,被核糖體翻譯成蛋白質(zhì)。翻譯后的抗原蛋白可以通過(guò)多種方式刺激免疫系統(tǒng)。
(3) 胞內(nèi)抗原被蛋白酶體分解成更小的片段,這些片段在細(xì)胞表面被 Ⅰ 類主要組織相容性復(fù)合體 (MHC I) 展示給細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞。
(4) 活化的細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞通過(guò)分泌穿孔蛋白和顆粒酶等溶細(xì)胞分子殺死受感染的細(xì)胞。
(5) 此外,分泌的抗原可以在核內(nèi)體內(nèi)降解,并通過(guò) MHC II 類蛋白在細(xì)胞表面呈現(xiàn)給輔助T細(xì)胞。
(6) 輔助性 T 細(xì)胞通過(guò)刺激 B 細(xì)胞產(chǎn)生中和抗體,并通過(guò)炎癥細(xì)胞因子激活吞噬細(xì)胞,如巨噬細(xì)胞,促進(jìn)循環(huán)病原體的清除。

圖 4. mRNA 疫苗引起免疫反應(yīng)的機(jī)制示意]圖[1]


  mRNA 疫苗用于癌癥治療
mRNA 疫苗在傳染性疾病防治領(lǐng)域的成功激發(fā)了人們對(duì) mRNA 疫苗在癌癥免疫治療領(lǐng)域的應(yīng)用的興趣 (表 1)[5]。一種方法是通過(guò)表達(dá)缺失或改變的腫瘤抑制蛋白來(lái)修改免疫抑制腫瘤微環(huán)境。另一種方法是 mRNA 疫苗訓(xùn)練免疫系統(tǒng)尋找并殺死癌細(xì)胞。
表 1. 進(jìn)入臨床研究的癌癥 mRNA 疫苗[5]。  

不過(guò),癌癥 mRNA 疫苗的開(kāi)發(fā)面臨著許多必須解決的挑戰(zhàn),傳染性疾病的預(yù)防性疫苗對(duì)感染的保護(hù)很大程度上是由強(qiáng)大的體液反應(yīng)賦予的,而癌癥 mRNA 疫苗還必須確保誘導(dǎo)強(qiáng)烈的細(xì)胞毒性 CD8T 細(xì)胞反應(yīng)來(lái)根除癌細(xì)胞。此外,由于腫瘤相關(guān)抗原在不同個(gè)體之間具有高度可變性,因此選擇能夠誘導(dǎo)足夠腫瘤特異性免疫反應(yīng)的抗原也是需要解決的難題。最后,即使抗原能夠誘導(dǎo)細(xì)胞免疫反應(yīng),抑制性腫瘤微環(huán)境也可以阻止 T 細(xì)胞浸潤(rùn)到腫瘤中,并可能導(dǎo)致 T 細(xì)胞衰竭。

 

帽類似物

使用帽類似物是體外合成 5’加帽 mRNA 最常用的方法。帽子結(jié)構(gòu)的存在賦予了 mRNA 的穩(wěn)定性,使其能夠高效翻譯。

m7GpppA diammonium

一種二核苷酸帽類似物,可用于體外 RNA 轉(zhuǎn)錄。

3'Ome-m7GpppAmpG ammonium

一種含有鎖核酸的三核苷酸帽類似物,可用于體外 RNA 轉(zhuǎn)錄。

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參考文獻(xiàn):
[1] Chaudhary N, et al. mRNA vaccines for infectious diseases: principles, delivery and clinical translation [published correction appears in Nat Rev Drug Discov. 2021 Sep 21;:]. Nat Rev Drug Discov. 2021;20(11):817-838. 
[2] Hou X, et al. Lipid nanoparticles for mRNA delivery. Nat Rev Mater. 2021;6(12):1078-1094. 
[3] Karikó K, et al. Suppression of RNA recognition by Toll-like receptors: the impact of nucleoside modification and the evolutionary origin of RNA. Immunity. 2005;23(2):165-175. 
[4] Karikó K, et al. Incorporation of pseudouridine into mRNA yields superior nonimmunogenic vector with increased translational capacity and biological stability. Mol Ther. 2008;16(11):1833-1840. 
[5] Barbier AJ, et al. The clinical progress of mRNA vaccines and immunotherapies. Nat Biotechnol. 2022;40(6):840-854.  
 
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標(biāo)簽: mRNA疫苗 核酸藥物
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