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細(xì)胞死亡的新途徑泛凋亡 (PANopotosis)詳述

瀏覽次數(shù):622 發(fā)布日期:2024-1-30  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

在所有提出的程序性細(xì)胞死亡 (PCD) 形式中,細(xì)胞焦亡、細(xì)胞凋亡和壞死性凋亡是最明確的,其復(fù)雜的分子機(jī)制負(fù)責(zé)細(xì)胞死亡的啟動(dòng)、轉(zhuǎn)導(dǎo)和執(zhí)行[1]。但實(shí)際上這三種途徑之間存在復(fù)雜的串?dāng)_。例如在無菌損傷和感染性疾。ɡ缂仔土鞲胁《 IAV 感染)中,研究人員觀察到所有三種 PCD 途徑的生化標(biāo)記物均被激活[1]。

2019 年,美國學(xué)者 Malireddi 將這種具有焦亡、凋亡和壞死性凋亡特征的新型死亡方式命名為泛凋亡,并提出先天性免疫傳感器 ZBP1 和 TAK1 激酶在泛凋亡小體復(fù)合物組裝的調(diào)控中發(fā)揮重要作用[2]。


 Tips:
泛凋亡(PANoptosis) 是由特定觸發(fā)器激活并 PANoptosome 復(fù)合物調(diào)節(jié)的炎癥性 PCD 途徑,其綜合了細(xì)胞焦亡、細(xì)胞凋亡和/或壞死性凋亡的關(guān)鍵特征,這也是 PANoptosis 術(shù)語中 “P” “A” 和 “N” 的來源,但其不能被細(xì)胞焦亡、凋亡和壞死性凋亡中任意一種死亡方式單獨(dú)表征[1]

 

圖 1. 程序性細(xì)胞死亡的研究時(shí)間表和特征[1]。
細(xì)胞死亡對(duì)于機(jī)體正常發(fā)育和抵抗病原體入侵至關(guān)重要,是宿主應(yīng)對(duì)病原感染的一種防御手段。研究發(fā)現(xiàn),IAV 感染后和 TAK1 活性喪失后會(huì)發(fā)生泛凋亡。此外,多種病原體如病毒、細(xì)菌、真菌,甚至寄生蟲,以及其他非感染性因素如腫瘤中的細(xì)胞因子,都可能引發(fā)宿主細(xì)胞的泛凋亡 (表 1)[3]。
 
表 1. 可誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞焦亡、凋亡和壞死的病原體[3]



多種蛋白質(zhì)可以形成調(diào)節(jié) PCD 的多蛋白復(fù)合物,其基于各種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域之間的相互作用,可分為三類:傳感結(jié)構(gòu)域、組裝結(jié)構(gòu)域和催化結(jié)構(gòu)域[2]。 

 泛凋亡小體: PANoptosome   
泛凋亡受到上游感受器和分子信號(hào)的級(jí)聯(lián)調(diào)控,這些傳感器和級(jí)聯(lián)信號(hào)組裝成一種多聚體復(fù)合物,即泛凋亡小體 (PANoptosome)。PANoptosome 及其上游的感受器不僅是下游分子的激活平臺(tái),也是 3 種 PCD 途徑的啟動(dòng)“總開關(guān)”[4][5]。
PANoptosome 小體作為一種分子支架,允許參與焦亡、細(xì)胞凋亡和/或壞死性凋亡的關(guān)鍵分子進(jìn)行耦聯(lián)和結(jié)合[1]。傳感器蛋白在感知到病原體成分后,會(huì)介導(dǎo) RIPK3、RIPK1、CASP8、FADD等蛋白組裝成 PANoptosome 復(fù)合體,從而誘導(dǎo) PANoptosis[2][6]。
構(gòu)成 PANoptosome 小體的蛋白質(zhì)通?煞譃槿悾(1) ZBP1 和 NLRP3 作為假定的 PAMP 和 DAMP 傳感器,(2) ASC 和 FADD 作為適配器,以及 (3) RIPK1、RIPK3 、CASP1 和 CASP8 作為催化效應(yīng)器[2]

圖 2. PANoptosis 和 PANoptosome 形成[1]。
那么上游感受器如何特異性識(shí)別病原微生物感染以及這些成分之間相互作用的呢?其實(shí)這個(gè)的具體機(jī)制目前還是未知的。迄今為止,已經(jīng)明確的泛凋亡上游分子有三種,分別是 ZBP1、RIPK1 和 AIM2,它們可以感受特定刺激并觸發(fā)泛凋亡小體的組裝,形成三種具有不同傳感器和調(diào)節(jié)因子的泛凋亡小體,即 ZBP1-PANoptosomes、AIM2-PANoptosomes 和 RIPK1-PANoptosomes。此外,PANoptosome 的激活也會(huì)受到 TAK1、PSTPIP2、SHARPIN、HOIP、HOIL-1 和 A20 的抑制[6]。


圖 3. 泛凋亡小體及其通路[4]。


 Tips:
(1) ZBP1 泛凋亡小體:Z-DNA 結(jié)合蛋白 1 (ZBP1) 是一種先天免疫受體,被鑒定為甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)的感受器和 IAV 感染期間細(xì)胞死亡的主要調(diào)節(jié)因子。在 IAV 刺激下,ZBP1 作為特異的感受器被激活,進(jìn)而觸發(fā) PANoptosome 的組裝[7][8]。ZBP1-PANoptosis 形成后,可以啟動(dòng)由焦亡、凋亡和壞死性凋亡成分組成的泛凋亡,最終導(dǎo)致溶解性炎癥細(xì)胞死亡,其特征是 Caspase-1、Caspase-3、Caspase-8 的激活和 MLKL 的磷酸化[9]。
(2) RIPK1 泛凋亡小體:RIPK1 介導(dǎo)的泛凋亡小體主要由 RIPK1、ASC、Caspase-1、Caspase-8 和死亡相關(guān)結(jié)構(gòu)域蛋白(fas-associated protein with death domain,F(xiàn)ADD)構(gòu)成,最早由 Malireddi 教授團(tuán)隊(duì)提出。該團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn) TAK1 可作為 RIPK1-PANoptosome 的調(diào)控主開關(guān),因?yàn)?TAK1 基因的缺失或者功能失活可以觸發(fā) RIPK1-PANoptosome 的組裝。然而,后續(xù)研究發(fā)現(xiàn),TAK1 的缺乏同樣可以誘導(dǎo) RIPK1 非依賴的泛凋亡通路的激活,后者主要由 RIPK3-MLKL 介導(dǎo)。
(3) AIM2 泛凋亡小體:其組成分子包括 AIM2、ZBP1、pyrin、ASC、Caspase-1、Caspase-8、RIPK1、RIPK3 和 FADD[10]。AIM2 炎性小體可感知雙鏈 DNA,AIM2 調(diào)節(jié)先天免疫傳感器 Pyrin 和 ZBP1 來驅(qū)動(dòng)炎癥信號(hào)傳導(dǎo)和炎癥細(xì)胞泛凋亡,在人類的正常發(fā)育、傳染性疾病、炎癥和腫瘤方面發(fā)揮重要作用。



說了這么多,這種 “三合一” 的復(fù)雜細(xì)胞死亡方式,又該如何研究及檢測的呢?

首先咱們來說檢測,由于泛凋亡綜合了細(xì)胞焦亡、細(xì)胞凋亡和/或壞死性凋亡的關(guān)鍵特征,因此在進(jìn)行相關(guān)檢測時(shí)三方面缺一不可!
之前小 M 也為大家整理過相關(guān)的檢測方法,那么本期僅做整理,不再詳述。


 Tips:

泛凋亡檢測方法及指標(biāo)!

(1) 觀察細(xì)胞形態(tài):細(xì)胞焦亡引起細(xì)胞質(zhì)腫脹和膜破裂;凋亡主要形態(tài)學(xué)特征包括染色質(zhì)固縮、DNA 片段化、細(xì)胞膜起泡、細(xì)胞皺縮、凋亡小體的形成等。
(2) 檢測不同 PCD 的關(guān)鍵蛋白:焦亡相關(guān):Caspase-1、Caspase-3、Gasdermins、AIM2/Pyrin/NLRP3 等;凋亡相關(guān):Caspase-3、Caspase-7、Caspase-8、PARP、Bax/Bcl 等;壞死性凋亡相關(guān):MLKL、RIPK1、RIPK3、ZBP1 等。
(3) 其他指標(biāo)檢測:Annexin V-FITC 和 PI 聯(lián)合染色;TUNEL 法;JC-1 檢測;ELISA 檢測炎癥因子的釋放;免疫印跡、流式等技術(shù)檢測炎性小體 NLRP3 的表達(dá)和 Caspase-1 的活化情況。


  文獻(xiàn)案例解讀(IF=39.3):
近期,Jin-Fei Lin 等人發(fā)現(xiàn)磷酸化的 NFS1 可通過預(yù)防 PANoptosis 以削弱結(jié)直腸癌的 Oxaliplatin 敏感性[11]。

作者使用基于體內(nèi)代謝酶基因的 (CRISPR)-Cas9 文庫篩選,發(fā)現(xiàn) NFS1 的缺失顯著增強(qiáng)了 CRC 細(xì)胞對(duì)奧沙利鉑的敏感性。體外和體內(nèi)結(jié)果表明,NFS1 缺陷與 Oxaliplatin 協(xié)同作用,通過增加細(xì)胞內(nèi)活性氧 (ROS) 水平,引發(fā)泛凋亡。


圖 4. 磷酸化的 NFS1 通過降低 ROS 水平來減弱鉑基化學(xué)敏感性,從而防止 PANoptosis[11]。


為了研究發(fā)生的細(xì)胞死亡類型,使用常見細(xì)胞死亡途徑的多種抑制劑并結(jié)合光鏡觀察細(xì)胞形態(tài)、YP1/PI 染色、流式檢測細(xì)胞死亡等進(jìn)行檢測。結(jié)果表明,焦亡 (GSDME) 抑制劑 Disulfiram 和自噬抑制劑 3-methyladenine 無顯著作用,而凋亡抑制劑 Z-VAD-FMK 、壞死性凋亡抑制劑 Necrostatin-1 、鐵死亡抑制劑 Ferrostatin-1 、焦亡 (GSDME) 抑制劑 Ac-DMPD/DMLD-CMK 逆轉(zhuǎn)(但不能完全恢復(fù))Oxaliplatin 治療下由 NFS1 缺乏引起的細(xì)胞活力降低和細(xì)胞毒性增強(qiáng) (圖 5)。

圖 5. Oxaliplatin 聯(lián)合多種抑制劑的細(xì)胞活力及毒性測定[11]。 

a-b: 對(duì)照和 NFS1 敲低 HCT116 細(xì)胞的細(xì)胞活力 (a) 和細(xì)胞毒性 (b) 評(píng)估; c-d: 對(duì)照和 NFS1 敲低 DLD1 細(xì)胞活力 (c) 和細(xì)胞毒性 (d) 評(píng)估。

 

為了進(jìn)一步證實(shí) PANoptosis 的發(fā)生,作者發(fā)現(xiàn) NFS1 敲低聯(lián)合 Oxaliplatin 治療顯著增加了死亡細(xì)胞的數(shù)量,包括指示細(xì)胞凋亡或壞死性凋亡的 YP1 陽性細(xì)胞和指示細(xì)胞壞死性凋亡、細(xì)胞焦亡或鐵死亡的 PI 陽性細(xì)胞 (圖 6: 左圖, a-b 和右圖 a-b)。

對(duì) HCT116 細(xì)胞的分析還表明,聯(lián)合組中從質(zhì)膜出現(xiàn)的大氣泡數(shù)量明顯高于陰性對(duì)照組、NFS1 敲低組和 Oxaliplatin 治療組,這表明細(xì)胞焦亡的發(fā)生 (圖 6: 左圖, a)。此外,NFS1 耗竭后進(jìn)行 Oxaliplatin 治療定量增加了早期/晚期凋亡細(xì)胞的數(shù)量,并顯著減少了活細(xì)胞的數(shù)量 (圖 6: 左圖, c-d 和右圖 c-d)。此外,在 NFS1 敲低組和 Oxaliplatin 治療組中檢測到的脂質(zhì) ROS 含量高于對(duì)照組。這種增加在聯(lián)合組中更為明顯,表明鐵死亡的發(fā)生 (圖 6: 左圖, e 和右圖 e-f)。因此,這些數(shù)據(jù)表明 NFS1 缺陷與 Oxaliplatin 聯(lián)合有助于 PANoptosis 的激活。

圖 6. NFS1 缺陷與 Oxaliplatin 治療協(xié)同作用,誘導(dǎo) PANoptosis[11]。 

(左圖): a. 對(duì)照中可能發(fā)生凋亡或壞死性凋亡的 YP1+細(xì)胞(綠色)和可能發(fā)生凋亡、壞死性凋亡、細(xì)胞焦亡或鐵死亡的 PI+細(xì)胞(紅色)以及用 Oxaliplatin 處理的 NFS1 敲低 HCT116 細(xì)胞。底部顯示為明場,紅色箭頭表示從質(zhì)膜中出現(xiàn)的大氣泡; b. 對(duì) (a) 中的 YP1+ 和 PI+ 細(xì)胞進(jìn)行定量。c-d: 流式細(xì)胞術(shù) (c) 和采用膜聯(lián)蛋白 V/PI 染色的定量分析 (d),在對(duì)照和用 PBS 或 Oxaliplatin 處理的 NFS1 敲低 DLD1 細(xì)胞中評(píng)估活細(xì)胞 (Annexin V- /PI-)、早期凋亡細(xì)胞 (Annexin V+ /PI-) 和晚期凋亡細(xì)胞的百分比 (Annexin V+ /PI+); e. 通過 BODIPY™ 581/591 C11 探針測定評(píng)估用 Oxaliplatin 處理的對(duì)照和 NFS1 敲低 HCT116 細(xì)胞中的脂質(zhì) ROS 水平。

(右圖): a. 對(duì)照中可能發(fā)生凋亡或壞死性凋亡的 YP1+細(xì)胞(綠色)和可能發(fā)生凋亡、壞死性凋亡、細(xì)胞焦亡或鐵死亡的 PI+ 細(xì)胞(紅色)以及用 Oxaliplatin 處理的 NFS1 敲低 DLD1 細(xì)胞。底部顯示為明場; b. 對(duì) (a) 中的 YP1+ 和 PI+ 細(xì)胞進(jìn)行定量; c. 使用膜聯(lián)蛋白 V/PI 染色進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)分析,評(píng)估對(duì)照和用 PBS 或 Oxaliplatin 處理的和 NFS1 敲除 HCT116 中活細(xì)胞 (Annexin V-/PI-)、早期凋亡細(xì)胞 (Annexin V+/PI-) 和晚期凋亡細(xì)胞 (Annexin V+/PI+) 的百分比; d. (c)中活細(xì)胞 (Annexin V-/PI-)、早期凋亡細(xì)胞 (Annexin V+/PI-) 和晚期凋亡細(xì)胞 (Annexin V+/PI+) 的定量; e. 使用 BODIPYTM 581/591 C11 探針測定法評(píng)估Oxaliplati 處理的對(duì)照細(xì)胞和 NFS1 敲低 DLD1 細(xì)胞中的脂質(zhì) ROS; F. 本研究中用于 ROS/脂質(zhì) ROS 分析的策略。


外,作者評(píng)估了 Oxaliplatin 治療下 NFS1 缺陷誘導(dǎo) PANoptosis 的具體機(jī)制。總之,Oxaliplatin 介導(dǎo)的氧化應(yīng)激可增強(qiáng) NFS1 的絲氨酸磷酸化水平,并且 NFS1 以 S293 磷酸化依賴性方式阻止 Oxaliplatin 治療下 PANoptosis 的激活。


本期小 M 為大家介紹了細(xì)胞死亡的新姿勢:泛凋亡 (PANopotosis),一種炎癥性細(xì)胞程序死亡途徑。三種重要的泛凋亡小體 ZBP1-PANoptosomes、AIM2-PANoptosomes 和 RIPK1-PANoptosomes 在其中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用,此外,小 M 為大家介紹了泛凋亡的檢測指標(biāo),并通過文獻(xiàn)案例進(jìn)一步詳述。希望大家能夠有所收獲喔~


Oxaliplatin

Oxaliplatin 是一種 DNA 合成 抑制劑。Oxaliplatin 會(huì)導(dǎo)致 DNA 交聯(lián)損傷,阻止 DNA 復(fù)制和轉(zhuǎn)錄并導(dǎo)致細(xì)胞死亡。Oxaliplatin 以時(shí)間依賴方式抑制人黑色素瘤細(xì)胞系 C32 和 G361,IC50 值分別為 0.98 μM 和 0.14 μM。Oxaliplatin 可以誘導(dǎo)細(xì)胞自噬 (autophagy)。

Disulfiram

Disulfiram (Tetraethylthiuram disulfide) 是特異性的 ALDH1 抑制劑,對(duì)酒精具有急性敏感性。Disulfiram 有效抑制人體和小鼠細(xì)胞中脂質(zhì)體中的 GSDMD 孔形成,炎性體介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡和 IL-1β 分泌。Disulfiram + Cu2+ 可增加細(xì)胞內(nèi) ROS 水平,引發(fā)卵巢癌干細(xì)胞凋亡。

Daurisoline 

Daurisoline 是一個(gè) hERG 抑制劑,也是一種自噬抑制劑。

Z-VAD-FMK

Z-VAD-FMK (Z-VAD(OH)-FMK) 是一種 pan caspase 抑制劑。Z-VAD-FMK 不抑制泛素 C 末端水解酶 L1 (UCHL1) 活性,即使?jié)舛雀哌_(dá) 440 μM。

Necrostatin-1

Necrostatin-1 (Nec-1) 是一種有效的能透過血腦屏障的壞死性凋亡 (necroptosis) 抑制劑,在 Jurkat 細(xì)胞中的 EC50 為 490 nM。Necrostatin-1 抑制 RIP1 激酶 (EC50=182 nM) 。Necrostatin-1 (Nec-1) 也是一種 (IDO) 抑制劑。

 
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參考文獻(xiàn):
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