MANTIS和TEMPEST液體處理器在COVID-19 測試工作流程中的應(yīng)用

自動化有一系列好處，包括提高可重復(fù)性和減少實驗室工作人員的接觸
 

隨著世界各地的實驗室應(yīng)對篩選大量 SARS-CoV-2 樣本的挑戰(zhàn)，這些實驗室的管理人員已轉(zhuǎn)向使用自動化來解決一些關(guān)鍵問題。

無論這些實驗室的規(guī)模是國家級別的，每天處理數(shù)十萬個樣本，還是在組織層面的小規(guī)模和敏捷實驗室測試，在這些工作流程中都有適應(yīng)自動化的一席之地。在流程中實現(xiàn)自動化帶來了一些顯著的優(yōu)勢。通過減少手動操作步驟的次數(shù)，可提高可重復(fù)性。由于手工進(jìn)行的步驟較少，這也減少了實驗室工作人員的潛在接觸。

挑戰(zhàn): 許多實驗室同時啟動 COVID-19 篩查計劃的需求導(dǎo)致移液器吸頭和試劑等資源稀缺。實驗室自動化為測試和篩選過程帶來了顯著的好處，但由于高通量儀器使用了大量的這些耗材，這一問題會進(jìn)一步惡化。
 
解決方法: 使用小型、靈活的液體處理解決方案，不依賴一次性吸頭，并且可以幾乎消除因死體積過大而造成的試劑浪費，使實驗室管理人員能夠從自動化的優(yōu)勢中獲益，并減少對稀缺資源的依賴。 
 
FORMULATRIX®的MANTIS®和TEMPEST®液體處理器背后的技術(shù)是獨一無二的，使用的是基于正位移微隔膜的芯片。這意味著試劑可以直接分配到用于樣品制備和 qPCR 分析的 96 或 384 孔板和深孔模塊中，而無需一次性塑料移液器吸頭。由于這些液體處理器的最小分配體積分別僅為100 nL 和 200 nL，這也為通過小型化減少總反應(yīng)體積開辟了道路，從而省下了寶貴的試劑。
 

 
 
在下面的示例中，我們重點介紹了三個不同實驗室使用MANTIS 液體處理器的經(jīng)驗。
 
牛津大學(xué) Weatherall 分子醫(yī)學(xué)研究所、根特生物技術(shù)公司 Biogazelle 和利物浦大學(xué)蛋白質(zhì)組研究中心。
 
 Neil Ashley博士，Wimthell分子醫(yī)學(xué)研究所（WMM）在英國牛津的單細(xì)胞核心設(shè)施管理者提出了SARS COV-2 qPCR工作流程，在夏季時這一流程已經(jīng)在其設(shè)施上操作了。
 
在Neil 的網(wǎng)絡(luò)研討會中，他討論了使用MANTIS作為工作流程的一部分，強調(diào)了所用移液器吸頭數(shù)量的減少以及其整體反應(yīng)規(guī)模的成功小型化。通過將MANTIS 液體處理器集成到用于 COVID-19 測試的現(xiàn)有 RT-qPCR 工作流程中，一致且可靠的非接觸式分配提高了吞吐量并消除了對制造商專有吸頭的依賴，這意味著全球供應(yīng)短缺不再是阻止RT-qPCR檢測以所需容量運行的障礙。
 
MANTIS 液體處理器在減少化驗量、顯著節(jié)省成本以及幫助避免試劑短缺時的延誤等方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。 
 
Jo Vandesompele教授是根特大學(xué)醫(yī)學(xué)與健康科學(xué)學(xué)院功能基因組學(xué)和應(yīng)用生物信息學(xué)的研究教授，也是Biogazole公司的聯(lián)合創(chuàng)始人環(huán)境中提供RNA和DNA生物標(biāo)記物服務(wù)。
 
2020年4月，Biogazole推出了一個高通量、模塊化和可擴展的SARS-CoV-2 RT qPCR測試平臺，每天處理多達(dá)6000個患者樣本。診斷測試是在ISO17025質(zhì)量管理體系下進(jìn)行的，該體系要求新儀器根據(jù)具有嚴(yán)格驗收標(biāo)準(zhǔn)的預(yù)定義計劃進(jìn)行驗證。
 

 
Biogazelle 選擇 MANTIS 作為其診斷 SARS-CoV-2 RT-qPCR 測試中的自動液體處理器，因為它占地面積小、靈活且高速準(zhǔn)確分配。除了儀器的技術(shù)能力外，易于使用的軟件可確保在篩選過程中以最低的培訓(xùn)要求快速部署。完整的應(yīng)用說明和網(wǎng)絡(luò)研討會詳細(xì)介紹了 Biogazelle 團隊為將 MANTIS 納入其 ISO 17025 認(rèn)可實驗室而開展的工作，可以在 FORMULATRIX 網(wǎng)站上找到關(guān)于這個的相關(guān)信息。
 
Ed Emmott 教授是利物浦大學(xué)蛋白質(zhì)組研究中心 Emmott 實驗室的負(fù)責(zé)人。該實驗室的目標(biāo)是使用和開發(fā)蛋白質(zhì)組學(xué)方法來研究 RNA 病毒復(fù)制和病毒-宿主相互作用，特別是使用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)來幫助這項研究。隨著對有效SARS-CoV-2疫苗的爭奪 持續(xù)吸引公眾和制藥行業(yè)的關(guān)注，認(rèn)識到在進(jìn)一步了解病毒與宿主相互作用方面的并行研究工作是很重要的，因為這可能會發(fā)現(xiàn)新的治療靶點。
Emmott 實驗室正在使用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)，遵循SCoPE2 協(xié)議，對 COVID-19 病毒進(jìn)行基礎(chǔ)研究。與之前的單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)相比，由于試劑使用的顯著小型化和用量減少，以及更短的實際操作時間，加上樣品制備和測量的吞吐量顯著加，SCoPE2的成本因而降低了。在最近的一份應(yīng)用說明中，Ed 討論了 MANTIS 液體處理器如何對這一成功起到關(guān)鍵作用：
MANTIS 提供了亞微升體積的可靠分配，即便是分配非常困難的液體類別，如用于存儲串聯(lián)質(zhì)量標(biāo)簽（TMT）的100%乙腈。
 
通過將MANTIS和TEMPEST液體處理器納入其COVID-19 測試工作流程，世界各地的許多實驗室已經(jīng)認(rèn)識到這些顯著優(yōu)勢。