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單分子質(zhì)量光度表征溶液中生物分子native特征詳解

瀏覽次數(shù):642 發(fā)布日期:2024-8-6  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

分子質(zhì)量光度法(Mass Photometry)是一種革命性的分子分析新方法。它能夠準(zhǔn)確測量溶液中天然狀態(tài)下的單個分子的質(zhì)量和數(shù)量,無需標(biāo)記。這種方法為生物分析和生物分子功能研究提供了獨(dú)特的價值。
 

單分子質(zhì)量光度分析系統(tǒng)測量結(jié)果圖示

與傳統(tǒng)技術(shù)的對比提供的獨(dú)特價值

  • 無需標(biāo)記,通過分子量及分子數(shù)量直接表征生物大分子溶液中native特性

    -單分子計數(shù)native狀態(tài)下所有大分子的單體、寡聚物和非特異性聚集體等所有亞群信息;

     

  • 測試復(fù)雜體系中的分子相互作用

    -測試native狀態(tài)下多價態(tài)分子相互作用,如二抗、三抗、蛋白二聚及多聚體等參與的多位點(diǎn)結(jié)合等;

     

  •  快速且易于使用(<3min出結(jié)果),僅微量樣品(ng樣品量)

    -立刻確認(rèn)蛋白及核酸樣品的分子量,用于功能和其他測試。

單分子質(zhì)量光度分析系統(tǒng)工作原理

分子質(zhì)量光度法建立在干涉反射顯微鏡和干涉散射顯微鏡的原理之上。由牛津大學(xué)Kukura教授研究組開發(fā),利用檢測光路中的新穎空間相位裝置和精細(xì)的圖像分析軟件,展示了所見即所得的特性。

適用于各種生物大分子(例如蛋白、抗體、核酸、脂質(zhì)和病毒等)
 

分子質(zhì)量光度分析系統(tǒng)的應(yīng)用

01 樣品表征

抗體的降解

下圖顯示了分子質(zhì)量光度分析系統(tǒng)觀察到的NISTmAb(人源化IgG1κ單克隆抗體)的質(zhì)量分布及其在+4°C下長期儲存一段時間后的降解情況。


 

載鐵蛋白與全鐵蛋白

載鐵蛋白(ApoF)是一種球狀蛋白質(zhì)復(fù)合物,由形成納米籠的24個蛋白質(zhì)亞基組成。在鐵的存在下,ApoF與多個離子相互作用,形成一種稱為全鐵蛋白或簡稱鐵蛋白的復(fù)合物。每個鐵蛋白分子可以儲存數(shù)千個鐵(Fe3+)離子,從而改變其質(zhì)量分布。緊密峰載鐵蛋白質(zhì)量分布與鐵芯鐵蛋白的寬質(zhì)量分布之間的差異如下圖所示。


 

氧核糖核酸

基因泰克公司以最小樣本評估m(xù)RNA純度,用于基因治療藥物的開發(fā)。


 

02 蛋白質(zhì)寡聚化

蛋白質(zhì)寡聚化的評估對于詳細(xì)了解復(fù)雜的生物過程至關(guān)重要,質(zhì)量光度法提供具有單分子靈敏度的分子量及分布,因為它可以直接快速量度是蛋白的寡聚化。

低聚狀態(tài)

下圖,質(zhì)譜光度法表征了四種不同的蛋白質(zhì):蛋白質(zhì)A、β-淀粉酶、脲酶和甲狀腺球蛋白。通過質(zhì)量光度表征,展示這些蛋白質(zhì)表現(xiàn)出一系列行為 - 從純單體(如蛋白質(zhì)A)到多種狀態(tài)之間的動態(tài)平衡。


 

抗體寡聚化

2G12 IgG是一種針對HIV包膜糖蛋白gp120的單克隆抗體。在下圖中,質(zhì)量光度法揭示了基線分離的2G12單體和二聚體的分布。


 

03 大分子組裝

GroEL

GroEL屬于伴侶蛋白家族,因此有助于細(xì)胞中其他蛋白質(zhì)的正確折疊和組裝。它由14個單體組成,形成籠狀結(jié)構(gòu)。質(zhì)量光度法可以在不存在或存在ATP的情況下監(jiān)測該復(fù)合物的形成(如下圖)。

核糖體

核糖體是蛋白質(zhì)和RNA的大分子組裝體,是蛋白質(zhì)合成的中心位點(diǎn)。鎂離子在完整(70S)配合物的組裝中起著微妙而重要的作用。在沒有鎂的情況下,大腸桿菌核糖體迅速分解成它們的30S和50S亞基。質(zhì)量光度法使我們能夠監(jiān)測這些過程(如下圖)。

AAV病毒(滿殼和空殼率)

腺相關(guān)病毒(AAV)是研究最活躍的基因治療載體之一。在圖中的示例中,質(zhì)量光度法可分離空衣殼(~3.7 MDa)和DNA負(fù)載衣殼(~1 MDa位移)。

脂質(zhì)體

 

脂質(zhì)納米盤是一種膜模擬物,其中一簇脂質(zhì)被蛋白質(zhì)帶包圍,質(zhì)量光度法可以監(jiān)測光盤的平均質(zhì)量,以及它如何隨著脂質(zhì)組成和/或蛋白質(zhì)帶的變化,從而定量脂蛋白納米盤。

 


 

04 分子相互作用

抗原抗體相互作用

質(zhì)量光度法可用于確定單價和多價相互作用的結(jié)合親和力。

下圖說明了如何使用質(zhì)量光度法來量化分子相互作用。通過單獨(dú)和混合測量曲妥珠單抗抗體及其靶抗原Her2的質(zhì)量,可以量化單個抗體分子與靶抗原之間的相互作用。


 

脫氧核糖核酸-蛋白質(zhì)

質(zhì)譜光度法不僅可以檢測DNA結(jié)合,還可以提供有關(guān)DNA結(jié)合時蛋白質(zhì)的寡聚狀態(tài)如何變化的信息。

 

監(jiān)測PROTAC三元絡(luò)合物

  • 靶蛋白(具有結(jié)合位點(diǎn)BD1和BD2)

  • 質(zhì)子(MZ1)

  • E3連接酶(VHL)

  • MP分布顯示作為MZ1函數(shù)的三元絡(luò)合物形成(PROTAC)濃度

  • 靶蛋白和連接酶抑制復(fù)合物的結(jié)合位點(diǎn)飽和

 

05 其他生物大分子

Karitro分析空殼和滿載的AdV樣品。

        

    綜上所述,單分子質(zhì)量光度系統(tǒng)適用于生物大分子研究的各個方面,不但可以應(yīng)用于樣品的制備、質(zhì)量驗證的多個實驗環(huán)節(jié),還可以提供獨(dú)特的多價態(tài)分子相互作用的研究,通過快速提供的分子質(zhì)量及數(shù)量數(shù)據(jù),極大提高研究效率!

 

 

附:產(chǎn)品系列

三款產(chǎn)品分別用于蛋白/核酸/抗體,病毒和其他生物大分子。

RefeynTwoMP

 

  • 測試蛋白/核酸/抗體等多種生物分子,分子量范圍:30kDa-5MDa
     

SamuxMP

 

  • 測試AAV 的空/實心比率等,分子量范圍:500kDa-6MDa
  • KaritroMP

 

測試AdV, LLV等大顆粒,粒徑范圍:40-150nm

 

 

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