NextGenPCR系統(tǒng)在猴痘最高警戒級(jí)別篩查與預(yù)防的應(yīng)用

MPOX（又名。猴痘（MPXV）是一種由猴痘病毒引起的傳染病。它會(huì)導(dǎo)致疼痛的皮疹、淋巴結(jié)腫大和發(fā)燒。大多數(shù)人完全康復(fù)，但有些人會(huì)病得很重。任何人都可能患上猴痘。目前，世界多個(gè)地區(qū)發(fā)生了多國猴痘疫情。猴痘病毒感染的確認(rèn)基于核酸擴(kuò)增檢測 （NAAT），使用實(shí)時(shí)或常規(guī)聚合酶鏈反應(yīng) （PCR） 檢測病毒 DNA 的獨(dú)特序列。PCR可以單獨(dú)使用，也可以與測序結(jié)合使用。

猴痘病毒變異株監(jiān)測，使用NextGenPCR®文庫制備進(jìn)行納米孔測序

測序可以跟蹤病毒的傳播以及可能使病毒更具傳染性或危險(xiǎn)的任何突變。NextGenPCR測序試劑盒與NextGenPCR設(shè)備相結(jié)合，可提供超快的納米孔測序。該試劑盒還可以與其他PCR設(shè)備配合使用。NextGenPCR設(shè)備已被證明具有超快且非常精確的特點(diǎn)，可為納米孔測序產(chǎn)生最終質(zhì)量的擴(kuò)增子。

對人畜共患猴痘病毒（MPXV）感染進(jìn)行快速基因組監(jiān)測可以為了解病毒的地理/人口傳播提供有價(jià)值的見解，并指導(dǎo)公共衛(wèi)生干預(yù)措施。在當(dāng)前的MPXV測序方法中，從樣品中分離的核苷酸直接在納米孔測序儀上進(jìn)行測序�，F(xiàn)有方法效率低下，因?yàn)樗�的基因組覆蓋率低，目標(biāo)片段的測序深度低，而且由于樣本無法進(jìn)行多路復(fù)用，因此成本高昂。為了幫助實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行MPXV基因監(jiān)測工作，Molecular Biology Systems開發(fā)了一種超快文庫制備方案，用于分析樣本中的MPXV基因組。190kb MPXV 基因組的擴(kuò)增是通過使用基于 PCR 的 2.5kb 片段（總共 88 個(gè)擴(kuò)增子）的擴(kuò)增子來實(shí)現(xiàn)的。使用NextGenPCR®超快PCR化學(xué)試劑，可在42分鐘內(nèi)完成方案的完整PCR循環(huán)程序。

該實(shí)驗(yàn)設(shè)置是一種使用NextGenPCR和Oxford Nanopore技術(shù)的組合對猴痘病毒全基因組進(jìn)行測序的方法。該實(shí)驗(yàn)旨在提供猴痘病毒的快速基因組監(jiān)測，這有助于指導(dǎo)公共衛(wèi)生干預(yù)措施。這實(shí)驗(yàn)設(shè)置與現(xiàn)有方法相比具有幾個(gè)優(yōu)勢，例如更快的實(shí)驗(yàn)流程時(shí)間、更高的靈敏度和更低的成本。該方案還成功應(yīng)用于對荷蘭和美國患者的猴痘病毒基因組進(jìn)行測序。

愛爾蘭都柏林國家病毒參考實(shí)驗(yàn)室的高級(jí)臨床科學(xué)家邁克爾·卡爾（Michael Carr）教授進(jìn)行了一項(xiàng)全國性研究，以闡明猴痘病毒（MPXV）在愛爾蘭的進(jìn)入和傳播。他使用的方案利用定制設(shè)計(jì)的 NextGenPCR® MPXV 引物池（貨號(hào) #50025）進(jìn)行 PCR 平鋪，使用戶能夠擴(kuò)增完整的 190 kb MPXV 基因組，然后可以進(jìn)行完整測序。使用下一代測序分析所得擴(kuò)增子，以準(zhǔn)確確定目前在愛爾蘭傳播的 MPXV 菌株。有了這些數(shù)據(jù)，卡爾實(shí)驗(yàn)室能夠?yàn)閻蹱柼m的決策者提供關(guān)鍵信息，以預(yù)防未來可能爆發(fā)的猴痘疫情。

閱讀更多關(guān)于他的研究 Multiple Introductions of Mpox virus to Ireland during the 2022 International Outbreak 并參考 NextGenPCR® 產(chǎn)品頁面 了解更多信息。

荷蘭MBS公司NextGenPCR系統(tǒng)，使用超快速NextGenPCR熱循環(huán)技術(shù)為Oxford Nanopore測序平臺(tái)提供多種基于PCR的文庫制備解決方案。結(jié)合NextGenPCR文庫準(zhǔn)備工作流程，可將實(shí)驗(yàn)室的通量提高至400%。

使用NextGenPCR技術(shù)進(jìn)行文庫制備的好處：

• 當(dāng)時(shí)間緊迫時(shí)，可更快獲得測序結(jié)果。

• 適用于多重?cái)U(kuò)增子文庫制備。

• 每天最多增加400%的數(shù)據(jù)量。

• 短基因組模板和長基因組模板的穩(wěn)健和高精度PCR。

• 直接PCR，無需核酸提取。

   

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