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COPAS流式分選系統(tǒng)簡(jiǎn)介及其在藥物篩選方面的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):5385 發(fā)布日期:2012-6-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
Union Biometrica COPAS流式分選系統(tǒng)簡(jiǎn)介及其在藥物篩選方面的應(yīng)用
 
微型模式動(dòng)物、模式植物種子、大體積細(xì)胞及微球的分選在生命科學(xué)研究中有著非常廣泛的應(yīng)用,但是由于這些對(duì)象體積太大,普通流式細(xì)胞儀難以對(duì)其進(jìn)行分選,而手工鏡下分選耗時(shí)耗力、效率低下、準(zhǔn)確性難以保證,因此一種自動(dòng)化大體積微粒分選系統(tǒng)應(yīng)運(yùn)而生,它就是本文介紹的COPASTM多參數(shù)生物微粒分析與分選系統(tǒng)。
 
COPASTM生物分選系統(tǒng),這一目前市面上唯一的能夠分選40-1500um生物微粒的全自動(dòng)、高通量分選系統(tǒng),是由位于美國(guó)馬薩諸塞州的Union Biometrica公司出品。該公司作為Harvard  Bioscience的子公司,專門致力于生物分選系統(tǒng)的研究、設(shè)計(jì)和制造。COPASTM系統(tǒng)可以檢測(cè)微粒的尺寸、光密度及熒光信號(hào),并根據(jù)用戶設(shè)定的域值,將相應(yīng)的微粒噴人96孔板或其它容器中,整個(gè)過程對(duì)于微粒的生物活性不會(huì)產(chǎn)生任何負(fù)面影響。
 
一、工作原理 

COPASTM技術(shù)平臺(tái)是基于流式細(xì)胞技術(shù)開發(fā)的,但它與普通流式細(xì)胞技術(shù)相比,做了兩個(gè)重要的改進(jìn)以適應(yīng)大體積生物微粒分析與分選的需要。
 
第一,系統(tǒng)管路直徑增大以適應(yīng)40-1500u m大小的生物微粒,這比普通流式細(xì)胞儀用于分選單個(gè)真核細(xì)胞的管路大的多。每一個(gè)COPASTM系統(tǒng)都針對(duì)不同尺寸范圍的微粒進(jìn)行管路的優(yōu)化設(shè)計(jì),以便在高速高通量分選時(shí)獲得最好的檢測(cè)靈敏度與準(zhǔn)確性。
 
第二,COPASTM技術(shù)的核心,即專利的氣流分選裝置(圖1、表1)。當(dāng)不需要收集時(shí),分選系統(tǒng)會(huì)通過氣體將液流吹人廢液槽中;當(dāng)需要分選的微粒經(jīng)過時(shí),分選系統(tǒng)會(huì)暫時(shí)將氣體分流器關(guān)閉,使氣流中斷,然后再重新打開分流器,這樣就能將含有待選微粒的液流噴人微孔板或收集容器中。這種分選的方式非常溫和,可以保證收集到的生物活體或敏感化學(xué)物質(zhì)的活性和完整性,對(duì)于后續(xù)的培養(yǎng)和分析不會(huì)產(chǎn)生任何負(fù)面影響,而普通流式細(xì)胞儀一般采用電磁場(chǎng)進(jìn)行分選,會(huì)對(duì)生物活體產(chǎn)生致命的影響。
 
COPASTM生物分選系統(tǒng)可以同時(shí)檢測(cè)微粒的五種光學(xué)參數(shù),包括微粒的光密度(Extinction,EXT)、微粒的軸向長(zhǎng)度(Time Of Flight,TOF ),以及三色熒光信號(hào)(表1)。樣本懸液在鞘液的包裹下形成層流,生物微粒被聚焦在液流的中心輸送到流動(dòng)室,通過兩個(gè)低能激光器來激發(fā)和檢測(cè)光信號(hào)。其中,一個(gè)紅色激光器( 670nm)被用來檢測(cè)微粒的軸向長(zhǎng)度和光密度,而另一個(gè)多色氫激光器(488/514nm)被用來激發(fā)多種熒光素。儀器的標(biāo)準(zhǔn)配置包括綠光、黃光及紅光檢測(cè)器,用來檢測(cè)受激發(fā)的熒光素發(fā)出的光信號(hào)。這些實(shí)時(shí)檢測(cè)的參數(shù)被用來將樣本中的微粒分群,只有那些符合用戶設(shè)定域值的微粒才會(huì)被分選系統(tǒng)加人微孔板或樣品收集容器中,而那些不在用戶設(shè)定域值范圍內(nèi)的微粒也可以被收集起來,以備后續(xù)的其它操作。最終的分選速度取決于樣本的濃度和需要分選的微粒所占的百分比,最快可以達(dá)到每小時(shí)100, 000個(gè)微粒。

二、應(yīng)用領(lǐng)域
 
COPASTM多參數(shù)生物微粒分析與分選系統(tǒng)被廣泛應(yīng)用在模式動(dòng)植物研究、大體積細(xì)胞研究及藥物篩選等方面,具體應(yīng)用對(duì)像包括微型模式動(dòng)物:C .elegans、D .melanogaster、Zebrafish、Medaka,  Mosquito,  Xenopus;模式植物種子與花粉:Arabidopsis、花粉;大體積細(xì)胞與細(xì)胞簇:胚胎干細(xì)胞、胰島;微球/顆粒:化合物結(jié)合微球、微球分析。本文將重點(diǎn)介紹COPASTM生物分選系統(tǒng)在藥物篩選方面的新應(yīng)用。
 
目前的高通量化合物篩選大多使用384或1536孔板。要提高分析的速度和通量并降低樣品消耗量就需要進(jìn)一步增加板上孔的密度,但是對(duì)于目前的liquid handling技術(shù)而言,1536孔板已經(jīng)接近其操作的極限。于是,另一種替代方法產(chǎn)生了,這就是基于微球的分析技術(shù),On-bead assays(圖21)。最近,一些科學(xué)家將COPASTM分選技術(shù)運(yùn)用于On-bead  assays中(圖3),大大提高了藥物篩選的效率,使篩選速度達(dá)到了每小時(shí)100000個(gè)化合物的高水平。同時(shí),這種結(jié)合還大大節(jié)省了樣品的消耗量,同樣分析1000, 000個(gè)化合物,基于384孔板的方法以每孔20u1計(jì)算,大約需要20升的樣品和試劑,而運(yùn)用COPASTM分選技術(shù)的On-bead assays只需要20-40m1的樣品。另外,COPASTM分選系統(tǒng)可以處理最大直徑達(dá)毫米級(jí)的微粒,這樣就完全可以分選500u m直徑的的微球,而這樣大小的微球可以滿足運(yùn)用MS和NMR對(duì)單個(gè)微球進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析的需要。
 

圖2. On-bead assays技術(shù)原理(A)與COPAS微球分選示意圖(B)
 
COPASTM生物分選系統(tǒng)可以運(yùn)用到On-bead assays技術(shù)的多個(gè)領(lǐng)域(圖3),比如微球的質(zhì)控,COPASTM可以分選出破損、塌陷和粘合的微球,從而保證用于實(shí)驗(yàn)的微球的完整性;根據(jù)微球表面的熒光標(biāo)記進(jìn)行分選;從已經(jīng)結(jié)合了化合物的微球中,去除那些結(jié)合了自發(fā)熒光化合物的微球,以避免假陽性。其中根據(jù)微球表面熒光信號(hào)進(jìn)行分選是用途最廣的應(yīng)用,現(xiàn)舉幾個(gè)例子進(jìn)行說明。

 

 

圖3.  COPASTM分選技術(shù)在On-bead assays中的應(yīng)用(A),分選熒光微球時(shí)的散點(diǎn)圖(B)
 
(1)結(jié)合分析,動(dòng)力學(xué)與竟?fàn)幏治?BindingAssays,  kinetics and competition assays)
 
使用COPAS生物分選系統(tǒng)在以微球?yàn)檩d體的化合物庫(kù)中篩選能與帶有熒光標(biāo)記的目標(biāo)蛋白結(jié)合的化合物,將陽性化合物微球加人微孔板以進(jìn)行后續(xù)的MS,NMR及其它分析,將沒有結(jié)合蛋白的陰性化合物微球加人收集容器以便重復(fù)使用。另外,還可以根據(jù)熒光信號(hào)的強(qiáng)弱設(shè)定域值,將陽性化合物微球進(jìn)一步分為結(jié)合能力不同的幾群。目前,已經(jīng)有科學(xué)家利用這種技術(shù)找到了一個(gè)能與纖維原細(xì)胞生長(zhǎng)因子粘多糖結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合的硫酸鹽化合物。
 

 
(2) On-bead酶一底物篩選(On-bead  enzymesubstrate discovery)
 
將需要研究的多膚,如點(diǎn)突變多膚,兩端標(biāo)記上淬滅熒光基團(tuán)(FRAP ),然后連接到微球上,從而建立一個(gè)以微球?yàn)檩d體的多膚庫(kù)。將多膚微球與目的蛋白酶結(jié)合,如果蛋白酶能夠切斷多膚,就會(huì)發(fā)出熒光信號(hào)。由于使用COPAS高速分選技術(shù),陽性微球可以被快速分選,以保證微球表面仍有足夠多的完整多膚以便進(jìn)行后續(xù)分析。從建立多膚庫(kù)到陽性多膚序列分析的整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程,可以在一周內(nèi)完成,與傳統(tǒng)方法相比效率提高了一百倍。丹麥的一個(gè)研究小組已經(jīng)利用該技術(shù)研究了枯草桿菌蛋白酶的多膚底物結(jié)構(gòu)。
 

 
(3)蛋白酶抑制劑篩選
 
COPAS技術(shù)的一個(gè)更為復(fù)雜的應(yīng)用是在蛋白酶抑制劑篩選方面。首先,將帶有淬滅熒光基團(tuán)(FRAP )的蛋白酶底物多膚連接在微球的一部分結(jié)合位點(diǎn)上,然后將需要篩選的抑制劑連接在微球的其它結(jié)合位點(diǎn)上,從而建立一個(gè)以微球?yàn)檩d體的抑制劑庫(kù)。將微球與蛋白酶一起孵育,如果抑制劑無效,蛋白酶會(huì)將多膚切斷,微球產(chǎn)生較強(qiáng)的熒光信號(hào)。如果抑制劑效果很強(qiáng),蛋白酶無法切斷多膚,微球沒有熒光信號(hào)。如果抑制劑無法完全抑制蛋白酶活性,那么仍會(huì)有部分多膚被切斷,微球會(huì)發(fā)出較弱的熒光信號(hào)。這樣就可以利用COPAS技術(shù)根據(jù)微球熒光信號(hào)的強(qiáng)弱對(duì)微球進(jìn)行分選,從而快速找到不同抑制強(qiáng)度的抑制劑。這種技術(shù)在篩選抑制劑和優(yōu)化反應(yīng)條件方面具有很高的效率和很大的靈活性,可以實(shí)現(xiàn)每小時(shí)100000個(gè)化合物的高速篩選。利用這種技術(shù),荷蘭的一個(gè)研究小組在數(shù)周內(nèi)找到了胰蛋白酶和多種基質(zhì)金屬蛋白酶的多種抑制劑。
 

 
綜上所述,由于 COPASTM生物分選系統(tǒng)在微粒分選方面的強(qiáng)大功能,其與On-bead  assays技術(shù)的結(jié)合必將成為藥物篩選的犀利武器,從而大大提高藥物篩選的效率,為人類健康作出貢獻(xiàn)。
 

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