從過(guò)去到現(xiàn)在,世界各國(guó)的頂尖育種工程師們一直都在為未來(lái)的發(fā)展提供更好的產(chǎn)品而努力。祖輩們和上一代的園丁們精心挑選出最適合當(dāng)?shù)貤l件的作物種子并加以妥善保存,以期在來(lái)年或今后更長(zhǎng)的時(shí)間內(nèi)能獲得好的收成。以番茄為例,在經(jīng)過(guò)幾十年的選擇性育種后,各種地方品種的種子表現(xiàn)出了明顯的特定區(qū)域特征。這些品種隨著時(shí)間的推移,適應(yīng)了當(dāng)?shù)氐沫h(huán)境,促進(jìn)了遺傳作物多樣性,并表現(xiàn)出優(yōu)秀的抗病能力。
總部位于荷蘭的拜耳作物科學(xué)(Bayer CropScience)的育種專家Coert Engels碩士和Pieter van Poppel博士,最近同富魯達(dá)(Fluidigm)公司分享了他們?cè)诜延N研究方面取得的喜人進(jìn)展。他們的團(tuán)隊(duì)正在開(kāi)發(fā)可以滿足世界范圍內(nèi)不同栽培方法和氣候的番茄新品種,由于每個(gè)地區(qū)都有其特有的要求和方法,因此他們的育種工作必須集中在一系列的特定性狀分析上。
更大、更好、更快……
實(shí)驗(yàn)室科學(xué)的創(chuàng)新可以指導(dǎo)實(shí)際規(guī)模化生產(chǎn)中的培育者,培育高產(chǎn)種子以及新的雜交品種,以達(dá)到快速抵抗疾病、蟲(chóng)害和不良環(huán)境條件如干旱和高鹽等目的。農(nóng)藝性狀的優(yōu)化日益提供了更好的產(chǎn)品保質(zhì)期、均勻性、穩(wěn)定性、耐洗性,密度和耐久性,這些優(yōu)化大幅提高了種植者的利潤(rùn)和食品供應(yīng),如更美味的番茄比薩和沙拉。
現(xiàn)代化的育種關(guān)注于如何抵抗真菌、細(xì)菌、病毒和害蟲(chóng)如蚜蟲(chóng)、粉虱等已知會(huì)導(dǎo)致番茄生產(chǎn)的問(wèn)題上!胺阎参镄枰弋a(chǎn),抗病和適應(yīng)當(dāng)?shù)氐纳L(zhǎng)條件”,Engels碩士解釋說(shuō),“水果必須有良好的形狀,顏色,硬度,耐貯性,大小和味道。我們的番茄品種不但要滿足種植者的需求,同時(shí)也要滿足貿(mào)易商、零售商和消費(fèi)者的要求!
分子育種的應(yīng)用
分子標(biāo)記育種方法在種子生產(chǎn)、促進(jìn)植物基因的識(shí)別以及關(guān)注性狀,如抗性的選擇上都具備明顯的優(yōu)勢(shì)。細(xì)胞和組織培養(yǎng)更適于在體外發(fā)展DH株特異種質(zhì)資源繁殖并進(jìn)一步擴(kuò)大作物遺傳庫(kù)。
“在分子水平上了解植物的特點(diǎn)加快了新的種子品種的生產(chǎn)過(guò)程,” Engels說(shuō),“從研發(fā)到市場(chǎng)的釋放時(shí)間平均為10年左右。通過(guò)分析葉子樣本,可快速識(shí)別存在的一個(gè)理想基因,而無(wú)需等待植物的成熟,分子生物學(xué)家可以節(jié)約大量的時(shí)間,大幅減低研發(fā)成本!
SNP檢測(cè)在番茄育種中的優(yōu)勢(shì)
據(jù)拜耳作物科學(xué)標(biāo)記輔助育種科學(xué)家van Poppel博士稱,在此項(xiàng)研究中,他們利用Fluidigm公司的 EP1™系統(tǒng),結(jié)合Juno™ 96.96 Genotyping IFC和192.24 DynamicArray™ IFC,進(jìn)行了終點(diǎn)法基因分型研究。
“我們利用全基因組標(biāo)記物和分子標(biāo)記輔助回交技術(shù)代替單一性狀連鎖標(biāo)記,對(duì)新的性狀進(jìn)行基因圖譜分析以區(qū)分不同作物群”,van Poppel博士解釋說(shuō),“在Fluidigm IFC研究體系上進(jìn)行基因分型分析,可以優(yōu)化最佳的SNP數(shù)量和樣本數(shù)搭配。”
Engels對(duì)此表示贊同:“每個(gè)群體需要特定的標(biāo)記選擇,這可以通過(guò)使用Fluidigm IFCS來(lái)實(shí)現(xiàn)。一旦被映射的數(shù)量性狀位點(diǎn)被確定,就可通過(guò)單性狀連鎖標(biāo)記輔助進(jìn)行更進(jìn)一步的篩選。表型分析鑒定往往是昂貴和費(fèi)時(shí)的,同時(shí)還依賴于季節(jié)。而分子標(biāo)記則使育種學(xué)家可以輕松跟蹤他們感興趣的農(nóng)藝性狀,如顏色和外觀,同時(shí)全基因組標(biāo)記物使育種專家們可以將分子標(biāo)記輔助回交技術(shù)應(yīng)用于后代的選擇上!
拜耳公司研發(fā)的種子新品種主要為了改善上述性狀,包括:產(chǎn)量、外觀、保質(zhì)期、抗病蟲(chóng)害、抗旱性和抗?jié)承缘。另外與口味相關(guān)的特征也很關(guān)鍵(已知100個(gè)左右的基因特異性的與口味相關(guān))。Engels發(fā)現(xiàn),為了研發(fā)出新的雜交品種,并使其具備純近交系父本和母本中的某些特定性狀,可能需要多達(dá)七代獨(dú)立自花授粉的基因純度的雜交品種。分子標(biāo)記方法則可以快速幫助選擇所需性狀。
Engels說(shuō):“在一個(gè)育種步驟中無(wú)法改變數(shù)百個(gè)基因。分子標(biāo)記輔助育種主要關(guān)注那些可以同時(shí)調(diào)控多種作物表型的基因!彼忉屨f(shuō),通過(guò)結(jié)合個(gè)體基因表型信息數(shù)據(jù)的分析,拜耳正在開(kāi)發(fā)一些和性狀緊密相關(guān)的SNP標(biāo)記物,以期逐步改善作物的遺傳譜系。
提高種子價(jià)值
比傳統(tǒng)的種系相比,由于雜交品種一般都有較高的產(chǎn)量,更強(qiáng)的抗性,因此拜耳采用雜交活力控制方法進(jìn)行親本純自交系的交叉選擇。當(dāng)育種家進(jìn)行優(yōu)化育種時(shí),導(dǎo)致植株表現(xiàn)出明顯的雜種優(yōu)勢(shì)。他指出:“利用廣泛的種質(zhì)資源和區(qū)域差異,可以使親本自交系的遺傳差異更大,從而獲取更強(qiáng)的雜種優(yōu)勢(shì)”。
最近幾年的改進(jìn)研究源于為發(fā)展高質(zhì)量的雜交品種而進(jìn)行的最適親本選擇。事實(shí)上,雜種優(yōu)勢(shì)只是故事的一部分。與世界范圍內(nèi)的種質(zhì)資源雜交育種,選擇具有理想性狀的種系,開(kāi)發(fā)新的種子,改良全球作物品種則是育種專家們一直在思考的問(wèn)題。
當(dāng)拜耳開(kāi)發(fā)一個(gè)新的種子時(shí),會(huì)申請(qǐng)植物新品種保護(hù)(PVP)。監(jiān)管機(jī)構(gòu)可能會(huì)給予這樣的要求,以禁止第三方復(fù)制特定品種,但種植者可以繼續(xù)使用經(jīng)改善的植物種質(zhì)資源,無(wú)論起源。
Engels簡(jiǎn)要概況了拜耳公司如何培育具有耐特殊的生長(zhǎng)條件如干旱,低溫或高鹽的種子品種:“我們針對(duì)蔬菜種子建立了專門(mén)的技術(shù)和方法,用以提高種子質(zhì)量、產(chǎn)量,改善生產(chǎn)技術(shù)和流程。包埋、造粒過(guò)程使種子萌發(fā)時(shí)能夠更均勻,而種子激發(fā)作用則使播種更簡(jiǎn)單,更有針對(duì)性!
他補(bǔ)充道:“一旦我們發(fā)現(xiàn)特定的基因與耐受性或抵抗特定的不良條件相關(guān),我們會(huì)尋找分子標(biāo)記物,以使進(jìn)一步的研究和未來(lái)的發(fā)展更容易和更快!
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