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種子的SSR檢測——高通量前處理解決方案

瀏覽次數(shù):4623 發(fā)布日期:2016-11-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

美國SPEX SamplePrep公司擁有60余年的專業(yè)樣品前處理儀器生產(chǎn)經(jīng)驗和專業(yè)背景。SPEX GENO高通量組織研磨儀,開始是專門為杜邦旗下先鋒良種農(nóng)業(yè)(PIONEER)植物樣品而研發(fā)。

SSR(又稱微衛(wèi)星DNA)標記,由于其共顯性遺傳特點,可以鑒定雜合子和純合子。該標記法需要DNA量少,實驗重復性好,可靠性高,操作簡便、經(jīng)濟,因而已經(jīng)成為種子鑒定中最常用的分子鑒定方法,并已經(jīng)出現(xiàn)在一些種子真實性和純度檢測的標準中。

為了真正實現(xiàn)極高通量檢測,在96孔深孔板的單孔中如能對單粒種子成功粉碎將是非常理想的。我們知道要將種子磨碎并不難,但要在如此狹小的空間內(nèi)將堅硬的種子磨碎就不那么容易實現(xiàn)了。SPEX高通量組織研磨儀能輕松達到這一目的。培安公司應用工程師已整理出上百種樣品的最佳前處理方案,下圖為部分種子的研磨效果(每個圖都是96孔深孔板單孔研磨單粒種子的結果):

         

值得注意的是,大麥、綠豆、黃豆這些帶皮的種子,無須剝皮,研磨完成外皮自然脫落;像黃豆這樣堅硬的種子,在單孔也成功粉碎;像葵花籽這樣油性的種子,研磨結果雖有些結塊,但是也呈泥漿狀,擁有很好的細度。唯獨玉米種子單粒較大,無法放入深孔板單孔中,但當我們將玉米種子放入15ml管中,也獲得了下圖的研磨效果:

             玉米

我們知道,在進行種子真實性和純度檢測時,每個品種需要做一定數(shù)量的重復,尤其純度檢測時,至少需要100粒種子。在SSR分子標定步驟的第一步就需要破碎種子并提取DNA,這是一個非常繁重的手工勞動。如果SPEX Geno 加入工作,就可以一個人在幾分鐘之內(nèi)就獲得所有待測種子的模板DNA!而這往往是需要一個人幾個工作日的勞動量!

Geno 2010一次可處理6塊96孔深孔板,也就是說一次即可完成576個種子的DNA提取;一次可處理24個15ml管,像玉米這樣的大顆粒種子,一次也可以做24個不同樣品的DNA提取。

種子檢測領域和遺傳育種領域的樣品通量極高是眾所周知的,也是讓科研工作者頗為傷腦筋的問題。培安技術中心的應用工程師可根據(jù)您的樣品為您提供方案,使得所有繁瑣的前處理問題迎刃而解。

愿培安公司專業(yè)的前處理儀器和技術服務能早日為您的科研事業(yè)添磚加瓦。

來源:培安有限公司
聯(lián)系電話:010-65528800
E-mail:sales@pynnco.com

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