如果你曾經(jīng)做過SDS-PAGE和Western blotting實(shí)驗,你肯定會看到彎曲的或模糊的條帶,不同于你的抗體數(shù)據(jù)表上顯示的那些完美的條帶形狀。雖然這些彎曲的條帶本身并不吸引人,但它們會影響到分子量,這可能會影響到條帶密度測量的分析,尤其是在使用自動化程序或分析分子量相近的蛋白
不要擔(dān)心,通常您可以采取五個非常簡單的步驟,使您的完美印跡再次呈現(xiàn)。
清潔實(shí)驗器材
你花了幾個星期的時間來培養(yǎng)你的稀有細(xì)胞,用昂貴的新化合物來處理它們,小心地收集和溶解你的樣本,然后卻把你的凝膠放在兩個臟的玻璃板之間。所以要確保你的玻璃板和梳子在鑄造之前是干凈的,這是確保你鑄造完美凝膠非常重要的一步驟。
搖動和攪拌
凝膠鑄造的一個主要問題是不適當(dāng)?shù)幕旌显噭貏e是丙烯酰胺。為了確保在凝膠中均勻地分離蛋白質(zhì),需要確保一個恒定的丙烯酰胺百分比。但同樣的,你也要盡可能快地將配好的膠用于實(shí)驗。一次徹底的混合凝膠試劑,接著是同樣重要的脫氣步驟,每次都能給你純潔的凝膠。
保持試劑新鮮
相同的方式,緩沖buffer確保它們是新鮮的,重要的是調(diào)整到正確的PH值。我們經(jīng)常發(fā)現(xiàn)我們的western blotting是重復(fù)不出來,使用將近6個月不新鮮的緩沖buffer,并將buffer一直放在陽光下,可能把buffer扔掉重新配置更有意義。 至少要檢查一下buffer的pH值是必須的,因為它在您的蛋白質(zhì)遷移中通過凝膠發(fā)揮重要作用。
低電壓慢跑
如上所述,我們知道你希望盡快獲得令人興奮的結(jié)果,以高電壓運(yùn)行您的凝膠可能會導(dǎo)致您不得不再配膠并重新運(yùn)行樣品。 通過在高電壓下運(yùn)行你的凝膠,緩沖液和凝膠會變熱,這是您的凝膠翹曲和彎曲的主要原因。
上樣要適中
減少關(guān)于條帶彎曲和更多關(guān)于印跡,這一步對于確保您從印跡獲得最準(zhǔn)確的結(jié)果至關(guān)重要。 盡管在最大體積中加載最大濃度蛋白質(zhì)是有誘惑力的,但有時候減少上樣量,可以確保您獲得一個不錯的條帶而不是無法辨認(rèn)的印跡。使用新的抗體,甚至是新的抗體批次,需要運(yùn)用總蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行測試。 這個簡單的步驟可以節(jié)省您的時間和樣品,使您的分析更快捷。
在這五個步驟之后,你可以讓你的條帶變得銳利,讓它們成為你的實(shí)驗室的驕傲。