染色體外DNA：癌基因竟然不存在于染色體上

 
昨日，Paul S.Mischel教授團(tuán)隊在Nature雜志上發(fā)表了名為Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression的文章，該文章首次解析了ecDNA的結(jié)構(gòu)與功能。
那么什么是ecDNA呢？
研究團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)，其實大量的癌基因并不在染色體上，而是會從染色體上脫落下來，變成一種小型的DNA，稱為染色體外DNA（extrachromosomal DNA，簡稱ecDNA） 這種顛覆傳統(tǒng)認(rèn)知的發(fā)現(xiàn)到底意味著什么呢？文章指出ecDNA在腫瘤中普遍存在，同時由于缺乏著絲粒，導(dǎo)致其不遵照孟德爾定律進(jìn)行遺傳，是驅(qū)動腫瘤異質(zhì)性的重要因素，也是導(dǎo)致腫瘤耐藥性的誘因。這將對腫瘤的治療帶來極大的挑戰(zhàn)。 我們知道，由于腫瘤存在異質(zhì)性，所以傳統(tǒng)的組織活檢已經(jīng)不能全面的解析腫瘤的真面目了。隨著技術(shù)的發(fā)展，液體活檢這一檢測方法逐漸成為檢測癌癥的新手段。液體活檢是指取患者的體液（血液、尿液、腦脊液等），通過測序或者數(shù)字PCR等方法對其中的腫瘤標(biāo)志物進(jìn)行檢測，從而確定患者是否罹患疾病。  
目前，在液體活檢方面做得較為出色的平臺要數(shù)來自法國stilla technologies公司的Naica全自動微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)了。
    
該系統(tǒng)是法國stilla公司開發(fā)的下一代核酸絕對定量技術(shù)。使用cutting-edge微流體創(chuàng)新型芯片——Sapphire芯片作為數(shù)字PCR過程的唯一耗材。樣品通過毛細(xì)通道網(wǎng)格以30,000個微滴的形式進(jìn)入2D芯片中，可稱作Crystal微滴。PCR擴(kuò)增實驗在芯片上實現(xiàn)。對微滴成像用以檢測包含擴(kuò)增片段的微滴。最后一步是對陽性微滴計數(shù)從而得到精準(zhǔn)的核酸絕對數(shù)量。  
該平臺擁有強(qiáng)大的圖像分析技術(shù)和直觀可視的檢測功能，從而達(dá)到了數(shù)字PCR定量卓越的置信水平，獲得的數(shù)據(jù)真實可信。并且該系統(tǒng)目前為市面上最簡單的數(shù)字PCR系統(tǒng)，可以實現(xiàn)3熒光通道檢測的數(shù)字PCR平臺，快速建立多重實驗。 此外我們還為大家提供了Gene-π數(shù)字PCR學(xué)堂（www.cycloudbio.com數(shù)字PCR學(xué)堂快速入口），您可以選擇感興趣的應(yīng)用教程，其中包含從實驗設(shè)計到數(shù)據(jù)分析的詳細(xì)工作流程。 您還可以通過搜索導(dǎo)航工具直接搜索特定的項目（"dPCR的DNA準(zhǔn)備"，"熒光溢出"等），或點擊我們的"HOW TO" 選擇您需要的部分（設(shè)計、分析、報告）。