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Naica數(shù)字PCR技術(shù)檢測(cè)IDH2突變

瀏覽次數(shù):2086 發(fā)布日期:2019-12-20  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
IDH2基因所編碼的蛋白名為異檸檬酸脫氫酶2,人類IDH有三種類型,分別為IDH1、IDH2和IDH3,IDH1定位于細(xì)胞質(zhì)和過(guò)氧化物酶體中,IDH2和IDH3定位于線粒體中。該類蛋白酶可以將異檸檬酸氧化為草酰琥珀酸,然后再轉(zhuǎn)化為α-酮戊二酸。其中,IDH1/2是人類癌癥中代謝基因發(fā)生突變頻率最高的,并干擾細(xì)胞新陳代謝和表觀遺傳調(diào)控,從而促進(jìn)腫瘤發(fā)生。在急性髓白血病中,IDH1/2突變與正常的核型,年齡及NPM1的突變有關(guān),其中IDH2 R140Q突變最為常見(jiàn)。
近日,法國(guó)著名大學(xué)-巴黎薩克雷大學(xué)Gustave Roussy血液學(xué)系、生物與醫(yī)學(xué)病理學(xué)系以及轉(zhuǎn)化研究實(shí)驗(yàn)室等聯(lián)合在德國(guó)Annals of Hematology上發(fā)表了一篇名為Spontaneous molecular response of IDH2 acute myeloid leukemia的文章。
研究報(bào)告了一例IDH2突變的急性髓細(xì)胞白血病(AML)患者,檢測(cè)發(fā)現(xiàn)有61%的骨髓原始細(xì)胞。細(xì)胞遺傳學(xué)揭示了其復(fù)雜的核型,二代測(cè)序分析顯示IDH2 R140Q(突變頻率28%)和KRASK117N(突變頻率22%)突變。隨后,研究人員再次對(duì)患者進(jìn)行了骨髓抽吸,發(fā)現(xiàn)骨髓原始細(xì)胞從61%下降到17%,其中存在許多組織細(xì)胞和紅細(xì)胞吞噬。進(jìn)一步的細(xì)胞遺傳學(xué)研究和NGS分析顯示復(fù)雜的核型消失,但I(xiàn)DH2 R140Q突變減少(5%),BRAF突變持續(xù)存在(31%),表明克隆進(jìn)化。
鑒于患者的身體狀況不佳以及兩次骨髓抽吸結(jié)果不一致,研究人員決定進(jìn)行第三次骨髓抽吸。出乎意料的是,骨髓原始細(xì)胞小于5%,并伴隨許多細(xì)胞吞噬。為了進(jìn)一步驗(yàn)證該結(jié)果,研究人員通過(guò)使用法國(guó)Stilla Technologies的Naica 微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng),對(duì)3個(gè)時(shí)間點(diǎn)的IDH2 R140Q突變進(jìn)行了定量。結(jié)果如下圖所示,和骨髓原始細(xì)胞的變化趨勢(shì)一致,IDH2突變從28.15%急劇下降到2.32%。
 
急性髓白血。ˋML)以不成熟髓細(xì)胞在骨髓里聚集,以及骨髓造血抑制為特征。AML的自發(fā)性完全緩解(SCR)是極其罕見(jiàn)的一種現(xiàn)象,目前關(guān)于其發(fā)生機(jī)制仍有待探討。上述研究揭示了SCR與IDH2 R140Q的關(guān)系,并且IDH突變的評(píng)估可以通過(guò)數(shù)字PCR量化并與總生存期相關(guān)聯(lián)。希望這一發(fā)現(xiàn)可以為急性髓白血病的治療提供一個(gè)靶點(diǎn)和方向。
法國(guó)巴黎薩克雷大學(xué)(Université Paris-Saclay)合并了3所大學(xué)、4所大學(xué)校(Grande Ecole)與7個(gè)研究所,包括巴黎第十一大學(xué)、凡爾賽大學(xué)、中央理工-高等電力學(xué)院(CentraleSupélec)、高等光學(xué)學(xué)院、法國(guó)國(guó)家原子能研究所(CEA)、法國(guó)國(guó)家科學(xué)研究院(CNRS)等。在2019 US News世界大學(xué)排名中,位列全球第30名,歐洲大陸第2名,法國(guó)第1名。
Annals of Hematology:《血液學(xué)年鑒》,IF=2.85。涵蓋了臨床和實(shí)驗(yàn)血液學(xué)、止血學(xué)、輸血以及腫瘤醫(yī)學(xué)的相關(guān)領(lǐng)域,包括白血病、淋巴腫瘤和實(shí)體腫瘤的診斷和治療,以及造血干細(xì)胞的移植。內(nèi)容包括與人類血液病相關(guān)的腫瘤學(xué)、分子生物學(xué)和免疫學(xué)等方面。該雜志與德國(guó)血液學(xué)和醫(yī)學(xué)腫瘤學(xué)協(xié)會(huì),以及奧地利血液學(xué)和腫瘤學(xué)協(xié)會(huì)有聯(lián)系。主編:阿諾德·甘瑟,德國(guó)漢諾威大學(xué)血液、止血和腫瘤學(xué)系。
該項(xiàng)研究使用了來(lái)自法國(guó)Stilla Technologies的Naica微滴芯片式數(shù)字PCR系統(tǒng)。
該系統(tǒng)利用cutting-edge微流體創(chuàng)新型芯片—Sapphire芯片作為數(shù)字PCR過(guò)程的唯一耗材。樣品通過(guò)毛細(xì)通道網(wǎng)格以30,000個(gè)微滴的形式進(jìn)入2D芯片中。并且還是首款3色熒光檢測(cè)儀器,整個(gè)流程只需要兩個(gè)半小時(shí)。結(jié)合強(qiáng)大的圖像分析技術(shù)和直觀可視的檢測(cè)功能,從而達(dá)到了數(shù)字PCR定量卓越的置信水平,獲得的數(shù)據(jù)真實(shí)可信。
三通道檢測(cè):兼容FAM, Evagreen /Cy3, VIC, HEX,/Cy5, Quasar® 705等染料,三色熒光檢測(cè),快速建立多重實(shí)驗(yàn) ↓
 
微滴回溯:精確到單個(gè)微滴圖像 ↓
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