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穩(wěn)定輸出,樣本DNA提取案例分享

瀏覽次數(shù):1957 發(fā)布日期:2021-1-13  來(lái)源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

最近實(shí)驗(yàn)室的師兄師姐們反饋,試用了MP的兩款柱膜法新品試劑盒(SPINeasy DNA Kit for Soil和SPINeasy DNA Kit for Feces)都得到比較理想的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),問(wèn)了一圈身邊的科研小伙伴們,認(rèn)為操作簡(jiǎn)便,提取DNA純度高、收率好的試劑盒為優(yōu)先考慮購(gòu)買的上上之選。下面小編與大家分享下部分類型樣本DNA提取的實(shí)驗(yàn)成果吧~
 
土壤與沉積物樣本

針對(duì)土壤和沉積物型樣本DNA提取,實(shí)驗(yàn)中大家選擇了使用土壤基因組DNA提取試劑盒(柱膜法)SPINeasy DNA Kit for Soil(貨號(hào) 116530050),操作簡(jiǎn)便快捷,同時(shí)樣本應(yīng)用范圍廣泛。


案例分享1

樣本類型:高原植物根系土壤

面臨挑戰(zhàn):提取高原植物根系土壤,含腐植酸較高。對(duì)比了若干款進(jìn)口和國(guó)產(chǎn)DNA試劑盒后,存在DNA提取純度低太低問(wèn)題。

試用結(jié)果數(shù)據(jù):


試用體驗(yàn):
1、提取時(shí)間大大縮短;
2、操作相對(duì)比較簡(jiǎn)便;
3、提取效果相對(duì)較好,降解減少;
4、260/230有所提高,雜質(zhì)減少。
 

案例分享2
 

圖源  中國(guó)科學(xué)院城市環(huán)境研究所


樣本類型:蚯蚓腸道內(nèi)容物和所在土壤

面臨挑戰(zhàn):客戶自備的試劑盒,DNA提取濃度比較低(37.2 ng/μl),260/280為1.796,純度僅為0.044,后續(xù)要做擴(kuò)增子測(cè)序和高通量芯片熒光PCR,不能滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)要求。

試用體驗(yàn): 結(jié)合MP公司提供的技術(shù)建議,經(jīng)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化后,DNA提取濃度和純度都有所提升,腸道內(nèi)容物濃度為87 ng/μL,土壤樣本濃度為48 μg/uL,260/230為1.4。目前提取出的濃度已滿足下游的實(shí)驗(yàn)用量。
 

案例分享3


樣本類型:農(nóng)田土壤

面臨挑戰(zhàn):提取DNA效果不理想。

試用結(jié)果數(shù)據(jù):


試用體驗(yàn): 操作便捷,提取的DNA作為模板進(jìn)行qPCR,在對(duì)照組的土壤樣品中加入了等量的真菌孢子,最終qPCR結(jié)果中,實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組的CT值基本一致,說(shuō)明產(chǎn)率上差異不大。

 


案例分享4

樣本類型:河流湖泊沉積物

面臨挑戰(zhàn):DNA提取效果差

試用結(jié)果數(shù)據(jù):

試用體驗(yàn):提取的DNA純度有明顯提高,260/230遠(yuǎn)大于1.0,DNA純度較好,提取操作步驟比較簡(jiǎn)便。
 
微生物樣本

土壤基因組DNA提取試劑盒(柱膜法)SPINeasy DNA Kit for Soil不僅可用于土壤樣本DNA提取,試劑盒內(nèi)裂解液、雜質(zhì)去除劑及漂洗液能夠針對(duì)菌體特性很好地去除影響DNA純化以及下游實(shí)驗(yàn)的抑制劑,從而提取到更多的微生物DNA。

案例分享5

樣品類型:水管內(nèi)壁生物膜,提取管道內(nèi)的淤泥和滋生的各種微生物

面臨挑戰(zhàn):DNA提取純度低。

試用結(jié)果數(shù)據(jù):

 
試用體驗(yàn):試用后A260/230達(dá)到了1.73,純度大大提高,對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果滿意。
 
糞便與腸道菌群

在過(guò)去的十年里,糞便樣本分析實(shí)驗(yàn)占了很大比例。這些被消化的廢物和微生物基質(zhì)中含有的微生物群落影響著我們多種健康線索。不過(guò)嘛,整個(gè)實(shí)驗(yàn)操作過(guò)程可談不上很愉快。對(duì)于糞便樣本DNA提取,獲得純凈、無(wú)抑制作用的DNA,同時(shí)保持高的產(chǎn)量,操作時(shí)間縮短那是最好不過(guò)了。以下是使用MP糞便基因組DNA提取試劑盒(柱膜法)SPINeasy DNA Kit for Feces(貨號(hào)#116531050),看看他們有什么心得體會(huì)吧~

案例分享6

樣本類型:蜜蜂糞便

面臨挑戰(zhàn):DNA提取純度低,260/230低,260-280之間沒(méi)有明顯峰值

試用結(jié)果數(shù)據(jù):

試用體驗(yàn):提取結(jié)果較好,滿足宏基因組測(cè)序要求。

案例分享7

樣本類型:小鼠糞便和腸道內(nèi)容物

面臨挑戰(zhàn):DNA提取效果不理想

試用結(jié)果數(shù)據(jù):
 

試用體驗(yàn):試劑盒整體上使用起來(lái)操作比較簡(jiǎn)單,提取效果較好,260/230大于1.0,滿足后期PCR和測(cè)序需求。
 
來(lái)源:安倍醫(yī)療器械貿(mào)易上海有限公司
聯(lián)系電話:400-1500-680
E-mail:custserv.cn@mpbio.com

標(biāo)簽: 土壤 糞便 DNA提取
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