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歸納總結(jié)WB實驗過程中的各種問題和解決方法

瀏覽次數(shù):24230 發(fā)布日期:2022-1-13  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)
前言
Western Blot 蛋白質(zhì)免疫印跡法(簡稱:WB),是基于蛋白質(zhì)SDS-PAGE電泳分離和特異性抗體識別蛋白的特性,通過顯色達(dá)到檢測目標(biāo)蛋白的一種技術(shù)。Western blot 近年來發(fā)展迅速,成為了蛋白研究方向的一種主要技術(shù),但由于其實驗步驟和關(guān)鍵點多,耗時長,每個步驟可能都會影響最終結(jié)果,所以實驗中也會遇到各種問題,導(dǎo)致最終的結(jié)果“五花八門”,也讓眾多“新手”抓狂!

關(guān)于WB實驗的常見問題,有過不少網(wǎng)絡(luò)文獻(xiàn)做過總結(jié)和分析,本文將結(jié)合前人的經(jīng)驗對常見的問題進(jìn)行歸納,給出解決方法,建議收藏!

Western Blot 實驗流程
首先讓我們溫故而知新,回顧一下WB的實驗流程(如圖一所示)
(圖一:Western Blot 實驗流程)

Western Blot免疫印跡雜交試驗步驟多,包含多個影響實驗結(jié)果因素,如 SDS-PAGE 膠濃度、轉(zhuǎn)膜緩沖液、封閉液、一抗抗體及其特異性,二抗孵育及漂洗等。

常見問題
本文將現(xiàn)象總結(jié)歸納為以下五類,分析問題的原因,并為大家提供可參考的解決方法。
1. 膜上無信號或無目標(biāo)條帶
(實驗結(jié)果無目標(biāo)條帶,因抗體選用不當(dāng))
 
問題 可能的原因 建議
操作問題 洗膜過度 洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強(qiáng)或過多,減少洗膜次數(shù),洗膜時間和溫度
蛋白未轉(zhuǎn)到膜上 轉(zhuǎn)膜結(jié)束后,用總蛋白染色劑染膠來確定轉(zhuǎn)膜效率;轉(zhuǎn)膜過程中膠與膜完全接觸;轉(zhuǎn)印夾層排布正確;按照膜的制造商的使用說明潤濕膜;轉(zhuǎn)印部件在電印跡過程中未過熱;使用正對照和/或分子量 Marker;可以用麗春紅染膜并結(jié)合染膠(考馬斯亮藍(lán))后確定條帶是否轉(zhuǎn)至膜上或轉(zhuǎn)移過頭;適當(dāng)調(diào)整轉(zhuǎn)膜的時間和電流優(yōu)化轉(zhuǎn)印時間和電流。
蛋白未完全結(jié)合到膜上 低分子量的抗原可能會穿過轉(zhuǎn)印膜,需使用小孔徑的膜進(jìn)行。
過度封閉 減少封閉時間,試用不同的封閉液
底物孵育時間太短 延長底物孵育的時間。
抗體問題 一抗、二抗不匹配 選擇與一抗相匹配的二抗類型,二抗需和一抗宿主的物種相同?赏ㄟ^設(shè)置內(nèi)參可以驗證二級檢測系統(tǒng)的有效性。
一抗失效 使用有效期內(nèi)的抗體,分裝保存,避免反復(fù)凍融取用,工作液現(xiàn)用現(xiàn)配。
結(jié)合目標(biāo)蛋白的抗體不足 降低一抗稀釋度;使用效價高的一抗;延長抗體孵育時間;膜充分浸潤在液體中。
一抗或/二抗?jié)舛鹊?/td> 增加抗體濃度;
一抗或/二抗?jié)舛忍?/td> 使用太多一抗或二抗可能導(dǎo)致底物迅速耗竭,呈現(xiàn)出很弱的信號
抗原問題 一抗不識別目標(biāo)蛋白 參照數(shù)據(jù)庫對比抗原序列和蛋白序列,選擇合適的一抗
抗原不足或降解 每條泳道上樣量不低于 20~30 ug, 使用蛋白酶抑制劑并設(shè)置陽性對照。
封閉底物可能含有蛋白水解酶活性(如明膠)
緩沖液問題 封閉液與一抗或二抗有交叉反應(yīng) 更換適合的封閉液
緩沖液中含有疊氮鈉 疊氮鈉是一種 HRP 的抑制劑,緩沖液不能使用疊氮鈉作為防腐劑。
ECL發(fā)光液失活或靈敏度不夠 更換發(fā)光液,選擇超敏發(fā)光液
曝光時間不足 延長曝光時間

2. 目標(biāo)條帶信號弱

 
WB結(jié)果中可能出現(xiàn)有目標(biāo)蛋白條帶,但是目標(biāo)條帶在膜上顏色較淺,原因和解決建議如下:
問題 可能的原因 建議
操作問題 轉(zhuǎn)膜不充分 規(guī)范轉(zhuǎn)膜的操作;優(yōu)化電轉(zhuǎn)條件;可將兩張膜疊加在一起,防止轉(zhuǎn)膜過度,或使用小孔徑膜
洗膜過度 洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強(qiáng)或過多,減少洗膜次數(shù),洗膜時間和溫度
封閉過度 減少封閉時間,試用不同的封閉液
曝光時間過短 延長曝光時間,如使用化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng),可調(diào)整顯示灰度值
抗體染色不充分 延長孵育時間或增加抗體濃度
抗體問題 抗體濃度低 增加抗體濃度
抗體和抗原親和力不足 增加抗體濃度
抗體活性不足 使用有效期內(nèi)的抗體,分裝保存,避免反復(fù)凍融取用,工作液現(xiàn)用現(xiàn)配。
抗原問題 抗原量不足 增加上樣量
緩沖液問題 緩沖液中含有疊氮鈉 疊氮鈉是一種 HRP 的抑制劑,緩沖液不能使用疊氮鈉作為防腐劑。

3. 圖像高背景
3.1 均一性的高背景

 
問題 可能原因 建議
操作問題 封閉溫度過高,封閉不完全 封閉液的選擇與優(yōu)化;使用5%脫脂奶粉封閉;優(yōu)化封閉時間和溫度
膜的問題 防止膜過程中干燥;換用NC膜進(jìn)行實驗;使用干凈鑷子并戴手套操作
孵育中洗膜不充分 適當(dāng)增加洗膜時間和次數(shù);確保在充分震蕩的條件下孵育膜,并且抗體充分覆蓋膜表面
曝光過度 縮短曝光時間,或等待數(shù)分鐘后使用成像儀拍攝
抗體問題 一抗,二抗?jié)舛容^高 提高一抗,二抗稀釋度,優(yōu)化稀釋條件
一抗,二抗和封閉液結(jié)合 更換封閉液;更換二抗或降低二抗?jié)舛?/td>
儲存時間較長或儲存條件不當(dāng)導(dǎo)致抗體失活 選擇新的抗體
抗原問題 緩沖液中去污劑不夠 增加TBST中Tween 20的濃度
緩沖液問題 轉(zhuǎn)膜液,封閉液等不新鮮或被污染 現(xiàn)用現(xiàn)配

3.2 非均一性高背景

 
問題 可能的原因 建議
操作相關(guān) 封閉溫度過高,封閉不完全 封閉液的選擇與優(yōu)化;增加封閉液中蛋白濃度;優(yōu)化封閉時間和溫度
膜沒有正確潤濕,也可能干過 使用干凈鑷子并戴手套操作;使用足夠液體,膜始終保持濕潤;孵育時使用脫色搖床;避免膜重疊,相互覆蓋
抗體問題 抗體濃度太高 提高一抗,二抗稀釋度,優(yōu)化稀釋條件
二抗聚集 使用前過濾二抗或者更換二抗
封閉劑中有聚集體 使用前過濾封閉劑或者更換
一抗,二抗和封閉液結(jié)合 更換封閉液, 或更換二抗或降低二抗?jié)舛?/td>
緩沖液問題 儀器或用具被污染 保證儀器和用具干凈;確保膜上無殘留膠
轉(zhuǎn)膜液,封閉液等不新鮮或被污染 使用干凈、新鮮的轉(zhuǎn)膜液,封閉液。建議現(xiàn)用現(xiàn)配

4. 非特異性條帶多

 
可能原因 建議
抗體與蛋白非特異性結(jié)合 更換抗體
抗體濃度太高 降低上樣量;提高一抗稀釋度。
抗體未純化 使用單克隆或親和層析純化后的抗體,減少非特異條帶
轉(zhuǎn)膜強(qiáng)度太強(qiáng),導(dǎo)致雜帶太強(qiáng) 降低轉(zhuǎn)膜強(qiáng)度(時間和電流),使目標(biāo)蛋白上方的蛋白少轉(zhuǎn)移到膜上。
封閉不完全 增加封閉液中蛋白濃度
細(xì)胞傳代次數(shù)過多,導(dǎo)致其蛋白表達(dá)模式分化 使用原代或者傳代少的細(xì)胞株,和現(xiàn)在的細(xì)胞株一起做參照
新蛋白或同族蛋白分享同種表位的不同剪接方式 查其文獻(xiàn)報導(dǎo),使用說明書報導(dǎo)的細(xì)胞株或組織

5. 條帶形狀異常
5.1 啞鈴狀條帶
該現(xiàn)象可能有兩個原因?qū)е。一是由于配置膠有問題,膠凝固后不均一,可通過重新配置膠,確保膠質(zhì)量無問題。二是樣品可能含有過多雜質(zhì),我們在樣品使用前對其進(jìn)行離心,以去除過多雜質(zhì)。

5.2 條帶發(fā)白
該現(xiàn)象可能原因是一抗?jié)舛冗^高,二抗上HRP催化活力太強(qiáng),同時顯色底物處于臨界點,反應(yīng)時間不長,將周圍底物催化完,形成了空白?山档鸵豢购投?jié)舛龋蛘吒鼡Q底物。

5.3 條帶拖尾
該現(xiàn)象主要原因是蛋白量太大,或一抗?jié)舛群蜁r間太長,可根據(jù)情況調(diào)整蛋白量,同時一抗?jié)舛群蜁r間也可以縮短。

5.4 條帶相連
出現(xiàn)該現(xiàn)象的原因可能是上樣量太大或是制膠問題,分離膠和濃縮膠之間有間隙,樣品竄孔?赏ㄟ^減少上樣量和提高配膠質(zhì)量來避免該問題。

5.5 條帶呈現(xiàn)微笑狀
電泳條帶或整體出現(xiàn) “︶ ”形狀,可能原因主要為:電泳速度過快,可通過減少電壓等減慢電泳速度;或是電泳溫度過高,使得膠變形,可在冷室或者冰浴中進(jìn)行電泳或者改變電泳pH。

5.6 條帶中出現(xiàn)邊緣規(guī)則的白圈
該現(xiàn)象很大可能是電轉(zhuǎn)中膜和膠之間存在氣泡,建議在轉(zhuǎn)膜前去掉膜和膠之間的氣泡。

總結(jié)一下

Western blot 技術(shù)目前是蛋白研究中最常用的方法之一,但也因為其步驟繁雜讓結(jié)果變幻莫測。但只要規(guī)范實驗流程,選用適合的試劑耗材和穩(wěn)定的成像系統(tǒng),相信大家都會做出“美麗”的條帶。

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