數(shù)字PCR分型在奧密克戎變異株六個(gè)突變位點(diǎn)鑒定的應(yīng)用

我是Omicron，中文名奧密克戎病毒，來自南非的新變種，都聽說了吧，如果你沒聽過我的名號(hào)，你可能就有點(diǎn)out了。

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全球各地都有我的身影，國內(nèi)呢，我正在香港、深圳、蘇州等地晃悠，人類給我總結(jié)的特點(diǎn)就是快，傳播快呀~

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聽說新冠自2019年末被發(fā)現(xiàn)至今已累計(jì)感染超4億人，新冠達(dá)到1億確診時(shí)是在2021年1月，之后只用了7個(gè)月就達(dá)到2億，而翻倍達(dá)到4億則只用了6個(gè)月，特別是3億到4億只用了1個(gè)多月的時(shí)間。這主要?dú)w因于我奧密克戎變異株的高傳染性和快速傳播性。

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根據(jù)新冠病毒數(shù)據(jù)庫GISAID目前共享的信息顯示，我奧密克戎變異株的突變位點(diǎn)數(shù)量明顯多于近2年流行的所有新冠病毒變異株，而最近的感染分析發(fā)現(xiàn)，奧密克戎毒株現(xiàn)有感染中也出現(xiàn)了進(jìn)一步變異的分支亞型，帶R346K變異的BA.1和BA.2。BA.1+ R346K亞型占現(xiàn)今全球奧密克戎序列的約40%，在新西蘭、英國和美國這一比例則為35-60%。BA.2亞型占全球奧密克戎序列的約10%，其流行率正在上升，并且在丹麥、印度和南非已占主導(dǎo)地位。我和之前的新冠病毒相比已經(jīng)改變得面目全非。

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通過人們的研究，對(duì)不同分支亞型的治療分析發(fā)現(xiàn)，同屬奧密克戎的不同亞型對(duì)不同中和抗體的反應(yīng)也并不相同。謝曉亮團(tuán)隊(duì)在《nature》的文章表明，奧密克戎RBD上的單個(gè)突變會(huì)影響不同類別抗體的有效性（該文章篩選了247種人類抗體，且將其分為6類）。例如，奧密克戎可利用突變K417N、G446S、E484A和Q439R逃逸A類至D類的抗體，這些抗體的表位與ACE2結(jié)合基序有重疊。Davide Corti團(tuán)隊(duì)在《nature》發(fā)表的文章也表明奧密克戎免疫逃逸能力或強(qiáng)于之前新冠病毒譜系，研究中測(cè)試的8種治療性單克隆抗體中，大部分完全失去了對(duì)奧密克戎的中和活性，擴(kuò)大篩選范圍后，入選的36種中和抗體，只有6種對(duì)奧密克戎依然具有強(qiáng)效的中和活性，而在29種靶向RBD特定區(qū)域（受體結(jié)合基序）的單克隆抗體中，有26種對(duì)奧密克戎的中和活性出現(xiàn)了顯著下降。

這些結(jié)果都提示我們，未來對(duì)新冠病毒的分型將是一個(gè)非常重要的工作，不但會(huì)影響我們的疫情防控工作，也會(huì)影響到我們針對(duì)新冠肺炎治療藥物的研發(fā)和不同患者的針對(duì)性治療。

我的秘密被暴露了，好像找到了方法對(duì)付我。

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讓我看看是啥方法~

原來是naica®微滴芯片數(shù)字PCR一次快速鑒別Omicron新冠病毒變異株刺突（Spike）蛋白6個(gè)突變位點(diǎn)，并實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量，獲得鑒定和監(jiān)控。

應(yīng)用亮點(diǎn)：

▶  6個(gè)核心突變位點(diǎn)快速檢測(cè)。

▶ 可視化微滴溯源單個(gè)陽性微滴，確保結(jié)果真實(shí)可靠。

▶  陽性微滴定性分析，同時(shí)給出定值，便于監(jiān)測(cè)監(jiān)控。(翻譯成中國話就是：檢測(cè)位點(diǎn)多、靈敏、還能監(jiān)控我~）

方法描述：

試劑：Omicron（奧密克戎）新冠病毒變異株鑒定試劑盒（珠海輝睿公司）

儀器：naica®微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)（北京深藍(lán)云生物科技有限公司）

數(shù)據(jù)分析：

數(shù)字PCR通過陽性微滴直接判讀陽性結(jié)果。

▲ 圖1：閾值判讀直觀陽性位點(diǎn)擴(kuò)增明確

這樣奧密克戎很容易就分型了。

新冠病毒已在全球肆虐了2年多的時(shí)間，且仍處于不斷變異過程中，隨著人們對(duì)其認(rèn)識(shí)更加深入，人們對(duì)其危害的認(rèn)知也越來越清晰，各種后遺癥的發(fā)現(xiàn)，各種新出現(xiàn)亞型不斷挑戰(zhàn)疫苗和治療手段組成的防線。

我們是否應(yīng)該針對(duì)病毒不同亞型展開更有針對(duì)性的治療方案研究？

我們是否應(yīng)該針對(duì)病毒不同亞型的感染特點(diǎn)采取更加有效的防控措施？

我們是否應(yīng)該針對(duì)感染進(jìn)行更精細(xì)化，更個(gè)人化的分析和治療？