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細(xì)胞外囊泡EVs熒光標(biāo)記的機(jī)遇與挑戰(zhàn)

瀏覽次數(shù):1821 發(fā)布日期:2022-8-4  來(lái)源:https://www.nanofcm.cn/

細(xì)胞外囊泡(extracellular vesicles, EVs)在機(jī)體的多種生理病理過(guò)程中均發(fā)揮著重要作用,良好的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性、生物相容性及天然的轉(zhuǎn)運(yùn)能力使其成為理想的藥物遞送載體和治療制劑。不管是在工業(yè)生產(chǎn)還是科學(xué)研究中,EVs的質(zhì)量控制都至關(guān)重要,國(guó)際細(xì)胞外囊泡協(xié)會(huì)(international society for extracellular vesicles, ISEV)一直在努力推動(dòng)和完善相關(guān)標(biāo)準(zhǔn),如MISEV2014、MISEV2018以及即將發(fā)布的MISEV2022,同時(shí)工業(yè)界也試圖確立適用于工業(yè)產(chǎn)品的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。除了粒徑、濃度等常規(guī)物理參數(shù)的檢測(cè),更重要的是對(duì)EVs的純度、蛋白標(biāo)志物、核酸以及載物等功能性分子進(jìn)行表征,而內(nèi)容物的定性定量分析通常需要通過(guò)熒光標(biāo)記來(lái)實(shí)現(xiàn)。

近日Lonza集團(tuán)的研發(fā)團(tuán)隊(duì)發(fā)表了題為“Opportunities and Pitfalls of Fluorescent Labeling Methodologies for Extracellular Vesicle Profiling on High-Resolution Single-Particle Platforms”的文章,作者分別利用高分辨單顆粒表征平臺(tái)nFCM(NanoFCM)和F-NTA對(duì)EVs進(jìn)行表征,探討EVs熒光表征過(guò)程中面臨的問(wèn)題與挑戰(zhàn)。文章對(duì)EVs純度測(cè)定過(guò)程中染料的選擇、蛋白標(biāo)志物分析、RNA檢測(cè)、復(fù)雜體系中EVs的表征等方面進(jìn)行全面研究,指出在EVs綜合表征中面臨的問(wèn)題與注意事項(xiàng),供廣大EVs研究者參考。
 


EVs純度鑒定
首先,分別選取兩種細(xì)胞膜染料和兩種細(xì)胞質(zhì)染料對(duì)EVs的純度進(jìn)行鑒定。nFCM結(jié)果顯示,無(wú)論是細(xì)胞膜染料(CMG/CMR)還是細(xì)胞質(zhì)染料(CFSE/CTR),EVs陽(yáng)性顆粒的比例均高達(dá)90%左右,且EVs尺寸越大,結(jié)合的染料越多,熒光強(qiáng)度也越高。由于具備超高的散射和熒光靈敏度,nFCM證實(shí)了幾種染料標(biāo)記效率的一致性(圖1)。同樣的樣品和染色方法用F-NTA檢測(cè),經(jīng)CFSE標(biāo)記的EVs陽(yáng)性率為88%,與nFCM結(jié)果相當(dāng),而對(duì)于CMG染料標(biāo)記,F(xiàn)-NTA測(cè)得的陽(yáng)性顆粒比例只有32%左右,粒徑分布顯示F-NTA檢測(cè)到的是大的EVs。這個(gè)案例提醒研究者對(duì)于EVs純度分析不僅需要關(guān)注不同染料間的標(biāo)記和檢測(cè)效率問(wèn)題,還需要關(guān)注表征平臺(tái)的檢測(cè)能力。
 

圖1.不同染料標(biāo)記EVs純度的效率
 

EVs抗體選擇和標(biāo)記方法
在早期的推文中小編介紹過(guò)不同公司的抗體特異性存在差異重磅!安德森癌癥中心用NanoFCM直篩外泌體特異性抗體!,抗體標(biāo)簽也是影響EVs標(biāo)記效率的一個(gè)因素。該研究對(duì)比了PE、AF488、AF647、APC四種標(biāo)簽的CD9抗體,發(fā)現(xiàn)PE和AF488的標(biāo)記比例優(yōu)于AF647和APC,比例在50%左右;進(jìn)一步選用PE和AF488兩種標(biāo)簽的CD9、CD63和CD81抗體,發(fā)現(xiàn)在HT29和HEK293細(xì)胞系中不同標(biāo)簽抗體標(biāo)記的效果沒(méi)有顯著差別(圖2),說(shuō)明在EVs蛋白標(biāo)記過(guò)程中研究者需要格外關(guān)注抗體特異性、標(biāo)簽的選擇對(duì)標(biāo)記效率的影響。
 

圖2.不同熒光標(biāo)簽對(duì)抗體標(biāo)記效率的影響
 

除了抗體標(biāo)簽,未結(jié)合的抗體對(duì)EVs的陽(yáng)性率也存在影響。文章對(duì)比了稀釋法(Dilution)、超濾(UF)、尺寸排阻(SEC)三種方法對(duì)游離抗體去除效果和標(biāo)記比例的影響。由于不涉及純化過(guò)程,理論上稀釋法對(duì)EVs的影響是最少的。nFCM結(jié)果顯示三種方法得到的CD9、CD63、CD81陽(yáng)性率基本一致,說(shuō)明稀釋法可以用來(lái)準(zhǔn)確地測(cè)定EVs蛋白的比例,同時(shí)結(jié)果也證明UF和SEC純化過(guò)程對(duì)EVs蛋白的陽(yáng)性率沒(méi)有影響(圖3)。說(shuō)明nFCM可通過(guò)稀釋法測(cè)定EVs蛋白表達(dá)比例,省略超速離心去除游離抗體的操作,極大縮短操作時(shí)間,同時(shí)真實(shí)反映EVs蛋白表達(dá)比例和強(qiáng)度。
 

圖3.nFCM測(cè)定游離抗體去除方法對(duì)標(biāo)記比例的影響
 

細(xì)胞上清中EVs的直接檢測(cè)

前面介紹的案例都是基于EVs純品的分析,雜質(zhì)顆粒含量非常低,對(duì)測(cè)定結(jié)果的影響相對(duì)較小。進(jìn)一步對(duì)較復(fù)雜的細(xì)胞上清(CCM)進(jìn)行直接檢測(cè),作者指出對(duì)于EVs純品和CCM樣品,nFCM的結(jié)果令人驚訝的一致,CFSE與CMG陽(yáng)性率例均在90%左右,與超離純化的 HT29 EVs樣品結(jié)果一致,說(shuō)明nFCM平臺(tái)既適用于純的EVs樣品,也可用于細(xì)胞上清樣品中EVs的直接檢測(cè),具有廣泛的應(yīng)用場(chǎng)景;而在F-NTA平臺(tái),CFSE與CMC對(duì)于HT29細(xì)胞上清EVs標(biāo)記陽(yáng)性率分別為33%和27%,作者解釋稱可能是由于CCM樣品復(fù)雜的成分導(dǎo)致F-NTA的檢測(cè)存在差異;對(duì)于蛋白比例檢測(cè),3種EVs蛋白marker總比例高達(dá)188.5%,遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)100%,文章指出可能是F-NTA熒光的靈敏度高于散射,大量小顆粒的散射信號(hào)未檢出,導(dǎo)致比例高于100%。
 

 

圖4.CCM樣品EVs純度和蛋白比例測(cè)定

與F-NTA相比,nFCM還可以利用多色熒光標(biāo)記策略對(duì)sEV亞群進(jìn)行表征。為研究EVs的抗體單標(biāo)和雙標(biāo)之間是否相互影響,作者選取CD9-AF488和CD81-PE分別進(jìn)行單獨(dú)標(biāo)記和雙標(biāo),對(duì)比標(biāo)記比例的變化。結(jié)果表明這兩個(gè)蛋白之間,不管是單獨(dú)標(biāo)記或雙標(biāo),陽(yáng)性率差異不顯著;另外,用EVs染料CTR和CD81同時(shí)標(biāo)記EVs,發(fā)現(xiàn)所有CD81陽(yáng)性的EVs的CTR均呈現(xiàn)陽(yáng)性,說(shuō)明CD81陽(yáng)性的顆粒,均是EVs!(圖5)。nFCM可以準(zhǔn)確識(shí)別抗體標(biāo)記的所有EVs,并且確認(rèn)抗體陽(yáng)性率的準(zhǔn)確性。
 

圖5.EVs抗體單標(biāo)和雙標(biāo)的影響
 

結(jié)論

綜上,Lonza集團(tuán)的研發(fā)團(tuán)隊(duì)對(duì)EVs熒光標(biāo)記過(guò)程中的各項(xiàng)指標(biāo)進(jìn)行綜合對(duì)比,對(duì)EVs純度測(cè)定過(guò)程中染料的選擇、蛋白標(biāo)志物分析、復(fù)雜體系中EVs的表征等進(jìn)行研究,對(duì)工業(yè)生產(chǎn)中EVs的質(zhì)量控制提供了新思路和新方法。

作者肯定了nFCM用于EVs檢測(cè)的準(zhǔn)確性和靈敏度,提出EVs純度表征方法,初次采用CD9/63/81幾種抗體的混合物驗(yàn)證EVs的純度,并對(duì)細(xì)胞上清中的EVs進(jìn)行直接檢測(cè),得到了跟EVs純品相一致的結(jié)果。另外作者指出nFCM對(duì)于EVs熒光檢測(cè)具有更高的靈敏度和穩(wěn)定性(圖6),nFCM可在單顆粒水平對(duì)EVs的散射和熒光進(jìn)行同時(shí)檢測(cè),單次采樣即可實(shí)現(xiàn)蛋白與EVs(或蛋白間)的“共定位”分析,是EVs質(zhì)量控制中不可或缺的工具。
 

 

圖6.文中關(guān)于nFCM的評(píng)價(jià)
 

附錄:

Lonza Walkersville(龍沙集團(tuán))是全球CDMO龍頭企業(yè),一家以生命科學(xué)為主導(dǎo),在生物化學(xué)、精細(xì)化工、功能化學(xué)等行業(yè)均處于領(lǐng)先地位的全球性跨國(guó)公司,具有一百多年歷史,總部位于瑞士巴塞爾。

圖7.Lonza集團(tuán)EVs工作流程圖(圖片來(lái)源:Lonza官方網(wǎng)站)

Lonza目前已采購(gòu)3臺(tái)NanoFCM,分別用于EVs研發(fā)、生產(chǎn)質(zhì)控和CRO項(xiàng)目致力于EVs大規(guī)模生產(chǎn)、純化和表征,后續(xù)將應(yīng)用于EVs載藥領(lǐng)域。2021年11月,Lonza收購(gòu)了Codiak公司位于馬薩諸塞州Lexington的外泌體生產(chǎn)基地,正式成為Codiak管線的戰(zhàn)略制造合作伙伴。屆時(shí)Lonza將借助Codiak的高通量外泌體生產(chǎn)技術(shù)向第三方提供服務(wù),并開發(fā)先進(jìn)的外泌體產(chǎn)品,助力細(xì)胞與基因治療產(chǎn)業(yè)。


參考文獻(xiàn):

  1. Fortunato D, Mladenović D, Criscuoli M, et al. Opportunities and Pitfalls of Fluorescent Labeling Methodologies for Extracellular Vesicle Profiling on High-Resolution Single-Particle Platforms[J]. International Journal of Molecular Sciences, 2021, 22(19): 10510.
  2. https://www.lonza.com/
  3. https://www.lonza.com/news/2021-11-02-13-01
來(lái)源:廈門福流生物科技有限公司
聯(lián)系電話:4006677046
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