Olink精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)助力腫瘤生物標(biāo)志物開發(fā)

2022年“中國腫瘤標(biāo)志物學(xué)術(shù)大會”召開在即。腫瘤標(biāo)志物的測定，作為腫瘤診斷、監(jiān)測和治療的重要手段之一，結(jié)合病理活檢、影像學(xué)等可有效幫助腫瘤患者更好地實現(xiàn)精準(zhǔn)治療。但遺憾的是，現(xiàn)階段腫瘤標(biāo)志物的開發(fā)仍在持續(xù)探索中，低豐度蛋白的檢測是其中的一大難題。
 

癌癥登月計劃（Cancer Moonshot）旗下的癌癥免疫監(jiān)測和分析中心選擇Olink作為低豐度蛋白標(biāo)志物的核心檢測方法，為一系列項目提供細(xì)胞因子、趨化因子和生長因子等的檢測和分析數(shù)據(jù)。今天小編來跟大家分享一下Olink蛋白質(zhì)組學(xué)在腫瘤領(lǐng)域的應(yīng)用，以期能給大家提供一些思路及靈感。
 

圖片來源鏈接：https://cimac-network.org/assays/

1. 腫瘤早篩
 

文獻(xiàn)名稱：Prospective identification of elevated circulating CDCP1 in patients years before onset of lung cancer

期刊：Cancer Research（IF 12.701）

檢測平臺：Olink-炎癥、mRNA-seq

樣本類型：血漿

研究內(nèi)容：該研究通過olink96-炎癥panel檢測648個診斷前血液樣本，發(fā)現(xiàn)肺腺癌早篩標(biāo)志物CDCP1，又通過mRNA-seq富集分析表明CDCP1在與細(xì)胞粘附和遷移相關(guān)的通路中具有潛在作用。

2. 預(yù)后分層
 

文獻(xiàn)名稱：Identification of Potential Prognostic and Predictive Immunological Biomarkers in Patients with Stage I and Stage III Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC): A Prospective Exploratory Study

期刊：Cancers（IF 6.575）

檢測平臺：Olink-炎癥等

樣本類型：血漿

研究內(nèi)容：該研究采用Olink蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)I期NSCLC陰性預(yù)后標(biāo)志物CD244，III期NSCLC陽性生物標(biāo)志物CR2、IFNGR2。此外，通過治療誘導(dǎo)的循環(huán)免疫原蛋白表達(dá)水平的變化確定CXCL10、IL-10為額外的陰性預(yù)測生物標(biāo)志物。
 

3. 藥物療效

文獻(xiàn)名稱：Plasma proteomics identifies Leukemia Inhibitory Factor (LIF) as a novel predictive biomarker of immune-checkpoint blockade resistance

期刊：Annals of Oncology（IF 51.769）

檢測平臺：Olink-1536、RNA-seq 等

樣本類型：血漿

研究內(nèi)容：通過Olink蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)現(xiàn)，在探索和驗證隊列中，白血病抑制因子(LIF)基線水平升高與接受ICB治療的癌癥患者較差的臨床結(jié)局相關(guān)，該癥狀獨立于其他預(yù)后因素。我們還證明了LIF的循環(huán)水平與腫瘤微環(huán)境中三級淋巴結(jié)構(gòu)(TLS)的存在呈負(fù)相關(guān)。
 

文獻(xiàn)名稱：In-depth plasma proteomics reveals increase in circulating PD-1 during anti-PD-1 immunotherapy in patients with metastatic cutaneous melanoma

期刊：J Immunother Cancer（IF 12.469）

檢測平臺：Olink-免疫腫瘤、質(zhì)譜

樣本類型：血漿

研究內(nèi)容：利用基于質(zhì)譜+Olink的全局蛋白質(zhì)組學(xué)分析了24名接受ICI治療CM患者和24名接受MAPKis治療CM患者的血漿蛋白組以確定ICI治療的特異性血漿蛋白水平的變化。結(jié)果顯示在抗PD-1治療期間循環(huán)PD-1的增加，以及在抗PD-1應(yīng)答者中呈現(xiàn)多樣化的免疫血漿蛋白組學(xué)標(biāo)志。

 

4. 腫瘤與其他疾病關(guān)聯(lián)研究

文獻(xiàn)名稱：Inflammatory Leptomeningeal Cytokines Mediate COVID-19 Neurologic Symptoms in Cancer Patients

期刊：Cancer cell（IF 38.585）

檢測平臺：Olink-炎癥、Olink-神經(jīng)探索等

樣本類型：腦脊液

研究內(nèi)容：本研究采用Olink蛋白組學(xué)分析腦脊液中蛋白質(zhì)的實時動態(tài)變化，發(fā)現(xiàn)II型干擾素驅(qū)動的柔腦膜炎癥細(xì)胞因子釋放可誘發(fā)神經(jīng)系統(tǒng)損傷。延長型神經(jīng)炎癥伴隨的細(xì)胞因子釋放綜合癥會導(dǎo)致長期神經(jīng)認(rèn)知障礙，這也預(yù)示對COVID-19感染引發(fā)的神經(jīng)性并發(fā)癥治療需要干預(yù)免疫炎癥系統(tǒng)。
 

 

Olink作為目前流行的創(chuàng)新蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，其獨特的PEA技術(shù)大大增加了樣本中低豐度蛋白的鑒定深度，輔助腫瘤生物標(biāo)志物開發(fā)，推進(jìn)腫瘤液體活檢的進(jìn)程。