“質(zhì)譜血漿蛋白質(zhì)組”+“三角法”實現(xiàn)生物標(biāo)志物開發(fā)

傳統(tǒng)的“三角法”旨在于小隊列中發(fā)現(xiàn)大量候選的生物標(biāo)志物，然后在更大的驗證隊列中進行下一步的驗證和確證，隊列數(shù)量從少到多，而篩選的蛋白質(zhì)標(biāo)志物的數(shù)量從數(shù)百或數(shù)千減少到只有少數(shù)幾個，具體步驟如下。
文章：A pipeline that integrates the discovery and verification of plasma protein biomarkers reveals candidate markers for cardiovascular disease
期刊：nature biotechnology
影響因子：68.164

研究背景：截至當(dāng)時，使用蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物僅停留在科研階段，尚未被應(yīng)用于臨床。
內(nèi)容簡介：開發(fā)了一個整合蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的研究路徑，從血漿生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)到驗證，并將其應(yīng)用于臨床，作為識別PMI患者心臟損傷的早期生物標(biāo)志物。在受控心肌損傷的不同階段，從患者心臟中采集血液，以確保候選生物標(biāo)志物的富集，并允許患者作為自己的生物對照。LC-MS/MS分析檢測到121個高度差異表達(dá)的蛋白，包括先前證實的心血管疾病標(biāo)志物和>100個心肌梗死(MI)的新候選生物標(biāo)志物。通過對外周血漿樣本進行靶向質(zhì)譜檢測，來篩選候選標(biāo)志物。通過PRM或免疫分析，對不同組別（對照組和PMI/自發(fā)性MI患者）的外周血漿進行分析，表明候選生物標(biāo)志物可能是MI的特異性標(biāo)志物。

技術(shù)路線：
 
文章：Plasma Proteomics Identify Biomarkers and Pathogenesis of COVID-19
期刊：immunity
影響因子：43.474

研究背景：2019冠狀病毒(COVID-19)大流行是一場全球公共衛(wèi)生危機。然而，對COVID-19的發(fā)病機制和生物標(biāo)志物知之甚少。
內(nèi)容簡介：通過對新冠肺炎病亡、重癥、輕癥患者的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)進行系統(tǒng)性分析，揭示了不同臨床結(jié)局患者的血漿蛋白質(zhì)在疾病進展的不同階段發(fā)生了大量獨特的變化。此外，基于機器學(xué)習(xí)，獲得了用于預(yù)測患者不同臨床結(jié)局的11種蛋白標(biāo)志物，并通過獨立隊列進行驗證和確證。

技術(shù)路線：
小編小結(jié)
 “三角法”+“血液質(zhì)譜蛋白質(zhì)組學(xué)”強強聯(lián)合，目前已可對血液蛋白質(zhì)組進行深度檢測，并獲得有效、科學(xué)的生物標(biāo)志物，有望實現(xiàn)臨床科研的轉(zhuǎn)化，再次推進國內(nèi)精準(zhǔn)醫(yī)療的進程。
 
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